Alexander Kurilshikov

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Alexander Kurilshikov

文章数：6篇

IBS患者具有怎样的微生物组和代谢组特征？

Gut Microbes发表的研究，纳入142名IBS患者和120名健康对照，使用宏基因组测序（MGS）对肠道微生物群组成及其代谢能力进行了分析，并使用质子核磁共振（1H-NMR）光谱对肠道微生物群的代谢物进行了分析，确定了IBS的粪便微生物-代谢组特征，这些特征与5-羟色胺代谢的改变和与消化道症状有关的不利的应激反应有关。与微生物组信息相结合的代谢反应网络显示了宿主-微生物组相互作用的途径。这些结果支持微生物群-肠道-大脑在IBS的发病机制中的联系。

IBS 肠道微生物组微生物代谢组微生物-肠-脑轴

遗传-菌群互作

Nature子刊：近8000人数据揭示遗传对肠道菌群的影响

宿主遗传可影响肠道菌群。近期，Nature Genetics背靠背发表了2篇基于大型单一人群队列的肠道微生物组GWAS研究。这项研究纳入了荷兰微生物组计划中的近8000名参与者，对肠道菌群宏基因组的组成（分类单元）和功能（通路）进行了全基因组关联研究（GWAS），鉴定出24个遗传位点（涉及37个SNP）与菌群分类单元和通路的关联，分析了潜在混杂因子（如用药、饮食和BMI）对这些关联的影响，用孟德尔随机化法探索了肠菌与宿主表型的因果关系，并通过功效分析强调了大样本量对于微生物组GWAS研究的重要性。有兴趣的读者可搭配阅读该团队同期发表的观点评论文章（见“延伸阅读”），讨论了微生物组GWAS的研究进展、技术现状、面临的挑战和未来的研究方向。

遗传-菌群互作全基因组关联分析（GWAS）肠道菌群

Nature子刊：肠道菌群和血液代谢物的关系

Nature Communication的这篇文章通过合并两个大型队列研究的粪便菌群成分和血液代谢组成分数据，进行线性回归分析并纠正混淆因子得到可靠的相关性结论。此外，文本的另一研究亮点之一在于进行了菌群成分与脂质成分较为细致的相关性分析，菌群已被证明与肥胖和糖尿病相关，也有一些研究证明肠道菌群是血液脂质含量的重要影响因子，因此有必要进行进一步研究。文章最后作者提及粪便菌群成分不能完全代表肠道菌群成分，因此未来需从肠道多部位多次取样，且本研究的代谢组分析完全基于核磁1H NMR数据，因此之后还需多平台进行分析。

肠道菌群血液代谢物 Sandi M Azab Sonia S Anand

傅静远等：肠道菌群与血液代谢物和心血管风险的关联

肠道菌群组成与心血管疾病（CVD）相关，《Circulation Research》最新发表了来自荷兰格罗宁根大学傅静远团队主导的研究，收集了荷兰的健康和肥胖人群两个队列近1300人的样本和数据，开展了基于宏基因组学的大规模关联性研究，综合分析了肠道菌群成员和功能通路与人体血液代谢组、心血管代谢表型和心血管疾病（CVD）代谢风险的关系，评估了CVD风险中的饮食-微生物-代谢-免疫相互作用，有一些有意思的发现（比如关于TMAO和SCFA的），相关发现为开发防治CVD的肠道菌群靶向治疗带来新启示。

心血管肠道菌群宏基因组学血液代谢组学队列研究

菌群-宿主互作

Nature：挖掘细菌基因多态性与宿主健康

菌株水平的基因差异可能意味着功能上的显著变化。《Nature》近期发表研究，在人类肠道菌群中发现了基因拷贝数多态现象，同时发现结构和丰度存在差异的微生物基因簇与人类宿主健康存在关联。该研究提出的概念和研究方法，有助于在基因功能水平阐释共生菌群与宿主的相互作用，对目前的共生菌群研究有重要参考价值。

菌群-宿主互作宏基因组基因拷贝数多态细菌功能肠道菌群宏基因组

傅静远等：调控心血管疾病相关蛋白的遗传-菌群互作

Nature Genetics刚刚上线来自荷兰格罗宁根大学傅静远等主导的研究，系统性分析了与92种心血管疾病相关蛋白质有关的人体遗传和菌群因素，并从中鉴定出若干重要的遗传-菌群互作。这些蛋白质中有很多都对人体健康有广泛影响，因此该研究的发现不仅揭示了心血管疾病中遗传和菌群的联合效应，对于代谢、肠道、免疫等相关疾病的研究和个性化医疗等领域也有很大参考价值。

心血管全基因组关联研究宏基因组关联研究肠道菌群遗传学