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全基因组关联研究
文章数:6篇
炎症性肠病
刘占举等Nature子刊:迄今最大规模的东亚IBD遗传研究
炎症性肠病(IBD)包含克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)两种亚型。目前大多数IBD的遗传关联研究都是基于欧洲(EUR)血统人群开展的,东亚(EAS)血统人群的研究很不充分。Nature Genetics最新发表了同济大学医学院附属上海市第十人民医院刘占举团队、广州医科大学第三附属医院李明松团队与国外合作者的重要研究,进行了迄今最大规模的EAS人群的IBD全基因组关联分析,并与EUR人群的数据进行联合分析和对比,鉴定出IBD的新风险位点。结合不同血统人群(EAS和EUR)数据建立的多基因风险评分,表现出更好的IBD预测准确性。
炎症性肠病
全基因组关联研究
免疫遗传学
东亚人群
欧洲人群
肠道微生物组
陈从英+黄路生院士:猪作为宿主遗传与肠道菌群研究的实验动物(综述)
猪不仅是重要的养殖动物,也是研究人类疾病的生物医学模型。近日,江西农业大学的陈从英和黄路生院士在Gut Microbes发表综述,回顾了宿主遗传对肠道菌群组成影响的研究进展,并总结了猪作为实验动物在探索宿主遗传对肠道菌群组成影响方面的主要优势和挑战。
肠道微生物组
宿主遗传
遗传力估计
全基因组关联研究
猪
肠道运动
Cell子刊:分析近17万人数据,14个基因位点或影响大便频率和IBS
肠道运动障碍与便秘、腹泻和功能性胃肠道疾病如肠易激综合征(IBS)有关,Cell Genomics近期发表的一项研究,分析了近17万欧洲人的数据,鉴定出与大便频率相关的14基因位点,并对这些基因进行了进一步分析,并建立了可用于预测IBS风险的多基因评分。
肠道运动
肠易激综合征
gut motility
GWAS
SNP
心血管
傅静远等:调控心血管疾病相关蛋白的遗传-菌群互作
Nature Genetics刚刚上线来自荷兰格罗宁根大学傅静远等主导的研究,系统性分析了与92种心血管疾病相关蛋白质有关的人体遗传和菌群因素,并从中鉴定出若干重要的遗传-菌群互作。这些蛋白质中有很多都对人体健康有广泛影响,因此该研究的发现不仅揭示了心血管疾病中遗传和菌群的联合效应,对于代谢、肠道、免疫等相关疾病的研究和个性化医疗等领域也有很大参考价值。
心血管
全基因组关联研究
宏基因组关联研究
肠道菌群
遗传学
炎症性肠病
黄海亮等Nature发文:精准定位IBD致病基因突变!
这是就职于哈佛大学医学院,美国麻省总医院和Broad Institute的中国学者黄海亮和合作伙伴的重量级研究。在GWAS分析的基础上,分析67852名IBD病人的基因组数据,精确定位了与IBD发生有大概率因果关系的单一因果性变异。这对理解IBD疾病的发生机制,研究新的药物和疗法具有重大意义。强烈推荐!
炎症性肠病
全基因组关联研究
单基因突变
生态基因组学
FPS:利用生态基因组学方法研究植物病原系统(综述)
① 植物致病微生物的出现和再现可干扰宿主和病原体的生态位;② 全球变化将导致新的病原体出现,鉴定出产生植物抗性的遗传学变异基础是估计植物群的适应潜能、研发培育新的抗性栽培品种的先决条件;③ 预测病原体遗传学决定因素将有助于鉴定出植物抗性等位基因;④ 在植物学或致病微生物(细菌、真菌和卵菌)中进行全基因组关联分析,可检测与野生植物和农作物的疾病抗性自然变异相关的基因组区域,并解析植物-微生物互作的分子全貌。
生态基因组学
全基因组关联研究
植物病原系统