功能基因

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文章数：8篇

河南大学：环境菌群中胞内与胞外基因的动态穿梭与生态功能（综述）

细胞外DNA(extracellular DNA, eDNA)和细胞内DNA(intracellular DNA, iDNA)广泛存在于陆生和水生生态环境系统中，在物质循环和基因信息传递中发挥重要的生态学作用。该文章从e/iDNA环境行为、eDNA在生物膜中的环境作用、物质信息传递、e/iDNA生态学功能等角度，综述了环境e/iDNA的行为归趋及生态功能研究进展，并对未来研究方向进行了展望。

胞外DNA 胞内DNA 功能基因宏基因组学生态功能

翟齐啸团队：普通拟杆菌FTJS7K1或能保护肠道

益生菌在肠道疾病治疗中有着重要的作用。然而，益生菌的开发任重而道远。很多肠道疾病都导致肠道菌群中拟杆菌丰度的降低，而且已有较多研究显示拟杆菌具有缓解肠道炎症，抑制肿瘤进展等作用，因此拟杆菌作为潜在益生菌株方面有着较好的前景。然而，拟杆菌菌株有很多，不同菌株在疾病和健康中的作用也不尽相同。普通拟杆菌（B.vulgatus）是肠道菌群中的常见菌群，但是目前对于该菌是否为有益菌仍然存在争议。近期江南大学翟齐啸团队在Journal of Advanced Research上发表研究论文，探究了4株普通拟杆菌对LPS诱导急性肠道炎症的影响，发现FTJS7K1菌株对LPS诱导的急性肠损伤具有保护作用，基因组分析显示FTJS7K1可能通过调控防御和代谢相关的特定基因（如分泌SCFAs）发挥其保护作用。这一研究结果为下一代拟杆菌属益生菌的筛选提供了科学依据。

益生菌基因组分析研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

中科院南京土壤所揭示关键菌群的多样性决定作物产量

长期施肥背景下土壤生物多样性在调控作物产量方面的机制尚未清楚，这限制了我们在全球变化背景下通过土壤生物多样性的变化来评估作物生产和土壤健康，本研究中，作者将多营养级生态网络和土壤微食物网理论相结合，借助35年长期施肥试验平台，研究土壤生物多样性尤其关键微生物菌群的多样性对土壤功能潜力和小麦产量的影响。该研究揭示了长期施肥背景下关键微生物菌群多样性在维持土壤功能和作物产量方面的重要作用，并且找出了与作物产量和土壤养分循环密切相关的多营养级微生物集群，为粮食生产的可持续性发展提供科学指导。

关键菌群生物多样性作物产量功能基因生态网络

土壤微生物组

南土所：农业土壤核心菌群可提升土壤生态功能

理论上，一个生态网络内高度相连的类群（核心节点，kinless hubs）比关联较少的类群（peripherals）能够支持更高水平的生态系统功能。然而，核心节点在调节土壤微生物群落功能潜力中的作用在很大程度上尚未得到探索与研究。中国科学院南京土壤研究所褚海燕与团队的这项研究，通过对具有重要生态功能与经济价值的农业生态系统（小麦和玉米轮作）的华北平原243个土壤样本进行大规模调查，建立了土壤真菌和细菌类群的关联网络，结果表明，在微生物网络中被归类为核心节点的土壤微生物类群的相对丰度与土壤功能潜力高度相关，这对于在大空间尺度上理解和管理（通过操纵微生物关键物种）农业生态系统具有重要意义。

土壤微生物组农业生态系统微生物网络功能基因核心节点

环境微生物

广东生态所：稳定同位素示踪-宏基因组分箱联用，揭示砷污染土壤中的厌氧砷氧化微生物代谢途径

近日，广东省生态环境技术研究所孙蔚旻研究员课题组在环境领域顶级期刊《Environmental Science & Technology》上发表文章利用稳定同位素示踪技术，锚定了砷污染土壤中的关键砷氧化微生物。并结合宏基因组分箱联用技术，揭示了这些功能微生物的代谢途径，进一步拓展了我们关于砷氧化微生物的多样性的认知。该课题组自组建以来，一直致力于开发稳定同位素示踪-宏基因组分箱联用平台。该文章的发表代表着此技术平台迈出了重要的一步，首次在学术杂志上公开发表，后续该技术将逐步走向成熟与完善。

环境微生物功能基因厌氧砷氧化反硝化 DNA稳定性同位素探针

南京农大团队发现土壤化学计量特性影响土壤碳、氮和磷循环的微生物群落及其对全球变化的抵抗力

面对全球变化，要保持生态系统功能的稳定性，就需要更好地理解功能特殊微生物群的调控因素及其种群对干扰的响应。在这项研究中，作者收集了中国54个管理的生态系统的土壤，并进行了一个微观实验，将干扰、元素化学计量和遗传抗性联系起来。发现与年平均温度和降水量相比，土壤碳:氮:磷化学计量对与碳、氮和磷主要生物地球化学过程相关的微生物类群的丰度有更大的影响。土壤全碳、全氮、全磷含量及其比值对微生物种群的遗传抗性有着强烈的直接影响，土壤全碳、全氮含量及其比值是磷循环对氮沉降、变暖和干湿性抗性的主要预测因子。总的来说，本文的工作强调了土壤化学计量平衡对于维持生态系统功能抵御全球变化能力的重要性。

全球变化生态系统功能功能基因生物地球化学循环碳矿化

朱怀球：微生物如何塑造菌群？基于功能基因的微生态动力学模型

北京大学工学院生物医学工程系的朱怀球教授发表题为《微生物如何塑造菌群？基于功能基因的微生态动力学模型》的报告，系统总结了多个群落动力学方程，介绍了微生物塑造其群落的方式方法。

菌群建立微生物群落动力学方法学功能基因 Yihai Cao

中山大学等：菌群功能基因多样性或可预测地下水污染

来自中山大学与俄克拉荷马大学的合作研究：地下水的污染可改变其中的菌群功能基因多样性，并可利用后者预测地下水的生态系统功能。

地下水功能基因 ecosystem functioning Environmental contamination groundwater microbiome