基因变异

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Nature子刊：利用肠道宏基因组测序数据或可重建宿主信息

粪便样本中存在的人类 DNA 会导致肠道鸟枪法宏基因组测序数据中出现少量的人类reads。然而，目前尚不清楚有多少个人信息可以从这些reads中重建出来，而且还没有进行定量评估。近日，日本大阪大学研究人员在Nature Microbiology发表最新研究，从343名日本人肠道宏基因组中重建个人信息。基于人类对肠道宏基因组数据的reads，开发了一种从基因型数据集中重新识别个体的方法。通过计算可能性得分，可有效利用肠道宏基因组中的少量reads，量化肠道宏基因组数据中包含的个人信息，值得关注。

肠道菌群宿主基因信息研究论文基础研究肠道宏基因组

结直肠癌相关基因突变的累积负荷与早发性结直肠癌的密切关联

早发性结直肠癌指50岁以前发生的结直肠癌，近年来的发病率逐渐增加。来自Gastroenterology上发表的一项最新研究发现，结直肠癌相关基因突变的累积负荷越高，早发性结直肠癌风险越高。另外，对比与结直肠癌相关基因突变累积负荷的关联，早发性结直肠癌显著高于晚发性结直肠癌。

结直肠癌 EOCRC SNP colon cancer penetrance

Nature：大肠杆菌连续培养50000代，基因组会怎么变？

50000，你没看错，五万！从1988年开始培养到今天，然后研究大肠杆菌的基因组进化速率和模式，绝对需要耐心的研究，值得好好看看。

长期演化基因突变基因变异基因组动力学大肠杆菌