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互作
文章数:9篇
埃及伊蚊
埃及伊蚊菌群组成随沃尔巴克氏体感染密度变化而变化
沃尔巴克氏体是一种广泛存在的细菌内共生体,当它被稳定地感染到登革热病毒和其他虫媒病毒的主要媒介埃及伊蚊中时,可以抑制媒介的能力。近日,锡拉丘兹大学研究人员在Microbiome发表最新研究,利用生物信息学调查埃及伊蚊微生物种水平特征,发现不同种群和个体的wMel负荷差异很大,重要的是,wMel是微生物组负向互作的主要枢纽,值得关注。
埃及伊蚊
微生物组成
研究论文
基础研究
基因组
植物微生物组
Cell:植物微生物组科学面临的突破、挑战和机遇(综述)
跨物种和跨生态系统的植物微生物群的基本定义,加上还原论实验模型的开发以及利用微生物对植物表型的操纵,激发了人们将其应用于农业的兴趣。然而,绝大多数在实验室和温室中表现出植物生产力特征的微生物在田间都失败了。近日,北卡罗来纳大学教堂山分校研究人员在Cell发表最新综述,论述了将有益微生物从实验室转化到田间地头的最新突破、挑战和机遇,值得关注。
植物微生物组
互作
综述
植物免疫系统
多菌株
Lectin-Seq
Science子刊:用于表征凝集素与微生物互作的方法—Lectin-Seq
凝集素是一种可溶性的碳水化合物结合蛋白,可区分细胞表面多糖,并特异地结合相关的菌株。先前遗传模型表明,凝集素在调节肠道微生物群中起着重要作用。然而,人类凝集素在宿主-共栖微生物群落中的作用尚未阐明。近日,麻省理工学院研究人员在Science Advances发表最新研究,开发出一种Lectin-Seq方法,用于表征凝集素与微生物相互作用,性能较好,值得关注。
Lectin-Seq
凝集素
研究论文
基础研究
方法工具
真菌组
一文读懂真菌和癌症间的关联(综述)
微生物组可能影响癌症的发展、进展和治疗反应,但其真菌成分在这方面的研究仍不够充分。近日,德国癌症研究中心研究人员在Gut发表最新综述,强调了共生真菌和致病真菌可能参与癌症发生和发展,系统地论述了真菌影响肿瘤生物学的可能机制以及真菌作为治疗标志物的潜在前景。还展望未来能有更多研究解开真菌、细菌和宿主之间复杂的相互作用,值得关注。
真菌组
癌症
综述
基础研究
肠道菌群
空间转录组
国内团队:空间宏转录组测序技术SMT
近年来,空间转录组技术发展迅速,可解析实体组织基因表达的空间异质性,确定其细胞组成及功能特点。然而标准的ST技术在评估宿主细胞与驻留微生物的互作研究方面仍存在精度及通量方面的局限性。近日,上海市免疫学研究所陈磊及团队在Genome Research发表最新研究,开发了空间宏转录组测序及一体化的生物信息分析技术SMT, 通过结合空间转录组数据和微生物丰度数据,可在空间层面揭示宿主细胞和微生物的大致分布与互作状态。总之,该研究为微生态研究提供了有力的工具,值得关注。
空间转录组
SMT
研究论文
基础研究
方法技术
铁稳态
谢黎炜+印遇龙+万丹等:肠道菌群是铁稳态和宿主健康的桥梁(综述)
铁是人体最重要的微量元素之一,它不仅是合成血红蛋白的必需元素,而且广泛参与机体的代谢过程,所有具有功能的细胞均含铁。近日,中国科学院亚热带农业生态研究所印遇龙、万丹、广东省科学院微生物研究所谢黎炜及团队在Science China Life Sciences发表最新综述,系统的阐述了宿主铁代谢与肠道菌群间的紧密关联和互作情况,梳理了肠道菌群、铁平衡在预防和治疗多种代谢性及慢性疾病中的重要性,值得关注。
铁稳态
肠道菌群
综述
基础研究
肠-X轴
瘤内菌群
山东大学:一文读懂瘤内微生物组数据的计算方法和挑战(综述)
人类微生物组与癌症生物学密切相关,在癌症治疗效果方面发挥着重要作用。随着不断深入的微生物研究,发现人类微生物能够通过与宿主免疫系统的相互作用在癌症诊断、发病机制和治疗中发挥广泛的作用。近日,美国俄亥俄州立大学马勤、山东大学刘丙强及团队在Trends in Microbiology发表最新综述,重点关注了研究肿瘤内微生物组的数据和计算方法,详细介绍了通过分析宿主bulk、单细胞和空间测序数据中的微生物组数据来挖掘生物学发现的计算方法及挑战,并对免疫肿瘤微生物组(IOM)研究方法的发展前景进行了展望,值得精读。
瘤内菌群
互作
综述
基础研究
免疫-肿瘤-微生物组
根际微生物
南农沈其荣团队综述根系-土壤-微生物互作
根相关微生物之间的相互作用比土体土壤中微生物之间的相互作用更复杂,根际被认为是植物的第二基因组,是根系-土壤-微生物相互作用研究的热点。植物的根际具有通过被管理从而增加农作物的产量的潜力,其植物根、土壤和微生物都可以被操纵或设计成有利于植物的方向,以实现可持续的农业收益。尽管在了解根际中复杂的网络方面取得了很大的进步,但我们的了解仍处于起步阶段,我们的大部分见解均来自于模式植物,而对主要作物的研究才刚刚开始。这篇综述将介绍根-土壤-微生物相互作用尤其是其在农作物根际的最新研究进展,并鉴于此提出了增加农作物产量的潜在策略。
根际微生物
根系
土壤
群体猝灭
群体感应
肠道上皮细胞
SR:IBD病人的肠道上皮与免疫细胞如何互作?
在体外共培养系统中研究人体上皮和巨噬细胞的相互作用,以研究IBD,很好的思路,建议看看。
IBD
肠道上皮细胞
免疫细胞
互作
Zhigang Zhang