Xiaolin Liu

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Xiaolin Liu

文章数：6篇

肠道菌群代谢物

王军+宋默识+张发明：菌群代谢物甲硫氨酸影响宿主生物钟基因表达和活性氧水平

昼夜节律对于宿主健康和菌群稳态都很重要。Protein & Cell近期发表了中科院微生物所王军、中科院动物所宋默识、南京医科大学第二附属医院张发明与团队的研究，分析了小鼠和人体肠道菌群中共同存在的节律性代谢特征，并分析了其中的关键代谢物——甲硫氨酸对宿主和菌群的影响，包括对生物钟基因的影响以及对活性氧的中和作用等，并在小鼠中证实补充膳食甲硫氨酸能改善睡眠不足对身体带来的多种负面影响。

肠道菌群代谢物昼夜节律甲硫氨酸 mRNA甲基化生物钟

王军+宋默识Nature子刊：二代+三代测序，深挖人类肠道菌群

中科院微生物所王军团队和中科院动物所宋默识团队合作，在Nature Communications发表文章，报道了一种新方法，结合短读长的二代测序（Illumina）和长读长的三代测序（纳米孔）数据进行宏基因组分析，深入挖掘了人类肠道微生物组的基因结构变异、原噬菌体和CRISPR间隔元件，在菌株水平上揭示了肠菌功能差异以及与宿主代谢组和表型的关系。

宏基因组三代测序牛津纳米孔测序菌株水平肠道菌群

肠道菌群代谢产物

王军团队：肠道菌群-宿主互作中的代谢物

肠道菌群代谢产物在健康与疾病中的作用正在得到越来越多的关注。EBioMedicine近期发表了中科院微生物所王军团队的综述，总结了复杂疾病中肠道菌群代谢物的变化，探讨了其中的相关性、因果性和机制，阐述了肠道菌群和药物之间的相互作用对药物疗效的影响，并讨论了从菌群代谢物中开发药物的研究方向和策略。

肠道菌群代谢产物药物-菌群互作宿主-菌群互作

王军+宋默识：肠系膜淋巴系统或是肠-肝轴的第二通路

门静脉连接肠道与肝脏，将肠道吸收的代谢物运送到肝脏中。肠-肝轴中是否还存在其他的代谢物运输途径，尚不清楚。中科院微生物所王军、中科院动物所宋默识与团队近期在Journal of Genetics and Genomics发表研究，发现肠系膜淋巴系统可能是肠-肝轴中从肠道向肝脏运输代谢物的第二通路，在代谢调节方面发挥作用。

肠-肝轴肠系膜淋巴系统代谢物

人肠道菌群

王军+张发明：人体肠道菌群的原位重建及昼夜节律

目前对于人肠道菌群的认知大多是源于对粪便菌群的分析，但粪便菌群不能完全反映出菌群在肠道内的原位情况，也限制了对人肠道菌群在更精细时间尺度上的动态变化的研究。中科院微生物所王军团队与南京医科大学第二附属医院张发明团队合作，在Engineering发表研究论文，通过结肠TET方法采集人体原位的回盲部菌群样本，揭示了肠道菌群在泻药扰动后的固有恢复力，以及人回肠菌群在组成和功能层面上的昼夜节律动态，并分析了菌群扰动和重建通过代谢物对宿主的潜在影响。

人肠道菌群昼夜节律菌群重建经内镜肠道植管术多组学

张发明团队：FMT治疗UC何时应进行第二疗程？哪些肠菌能预测疗效？

越来越多的研究证据表明粪菌移植（FMT）可有效诱导活动期溃疡性结肠炎（UC）患者获得临床缓解，且严重不良反应事件发生率低。但是目前很少有研究报道FMT对于UC应保持怎样的治疗频率从而更好地维持其长期疗效。南京医科大学第二附属医院张发明团队李潘等2018年曾报道，获益于FMT的克罗恩病患者在首疗程治疗后的3个月应接受第二疗程FMT治疗（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1084046042）。Clinical and Translational Gastroenterology近日发表了一篇来自张发明团队的临床研究，发现获益于FMT的UC患者也应该在首疗程后3个月接受第二疗程FMT治疗，以更好地维持长期临床疗效。该研究同时还探究了患者治疗前后短期内菌群变化与长期疗效的关系。本研究将会促进临床医生考虑将FMT的序贯治疗付诸实践作为UC的长期治疗策略。

粪菌移植溃疡性结肠炎肠道菌群治疗策略疗效预测