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中山大学：不同腹足动物的核心肠菌可持续多代传播？

对动物肠道菌群的研究主要集中在脊椎动物身上，哺乳动物肠道共生菌传播方式已经得到很好的研究。然而，在腹足类动物中，肠道微生物群与宿主间的关系仍然知之甚少。近日，中山大学Xi Sun、吴忠道、丁涛、林达涛及团队在Microbiome发表最新研究，收集244份淡水腹足动物微生物样本，发现不同腹足动物物种相关的核心肠道微生物可持续多代传播，且肠道微生物代谢功能被发现与腹足类动物从野生环境到养殖环境的适应性进化有关，值得关注。

腹足动物肠道菌群研究论文基础研究垂直遗传

郑钜圣+周宏伟等：早期饥荒或可影响成年后肠菌组成，增加糖尿病风险

人类在生命早期经历不利因素会增加成年期罹患T2D等慢性疾病的风险。虽然已经有流行病学观察结果支撑多哈理论（健康和疾病的发育起源-生命早期），但其背后潜在的生物学机制尚不明确。近日，西湖大学郑钜圣、南方医科大学周宏伟、中国疾病预防控制中心张兵、中山大学陈裕明及团队在BMC Medicine发表最新研究，解析了来自三个独立队列涵盖中国16个主要省份/直辖市人群的万人肠道微生物组大数据，揭示了生命早期饥荒暴露对成年期肠道微生物组的影响，并发现饥荒暴露相关肠菌与T2D发病风险增加存在密切的关联，值得关注。

生命早期饥荒暴露研究论文基础研究肠道菌群

RExMap或可助力识别人类肠道核心物种？

人类肠道菌群与健康和疾病相关，人类微生物组的研究主要采用16S扩增子测序，在物种水平上区分微生物的能力有限。近日，美国加利福尼亚大学Tao Long及团队在Nucleic Acids Research发表最新研究，开发了一个针对16S数据的基于参考的精确映射（RExMap）数据库，在物种水平上识别到15种核心微生物在人类中普遍存在，独立于生活方式、环境或地理区域。这些微生物通常在出生时就已形成，并与营养代谢有关，值得关注。

RExMap 核心物种研究论文基础研究数据库

揭示鱼类相关微生物群中的核心物种

Microbiome近期发表的文章，通过将鳗鱼养殖池的微生物群作为模型系统，重建了9605种细菌和303种古菌在128天内的种群动态。同时通过整合微生物学、群落生态学和网络科学，探索鱼类相关微生物群复杂动力学中的关键物种和相互作用。

鱼菌群核心物种

组蛋白甲基化

国内团队揭示水稻组蛋白甲基化调控根系核心菌群

尽管表观遗传调控与宿主菌群的关系已在动物模型中得到广泛研究，但在植物中相关研究较少，2021年7月2日，JGG在线发表了中国科学院遗传与发育生物学研究所白洋研究员和曹晓风研究员团队合作题为“The rice histone methylation regulates hub species of the root microbiota”的研究论文。该论文报道了组蛋白甲基化修饰对水稻根系菌群组装及核心菌群的调控作用，作者确定了水稻（Oryza sativa）组蛋白甲基化调节根菌群的结构和组成，尤其是微生物网络中的核心物种。作者表明水稻组蛋白甲基化在调控根系菌群的组装过程中起关键作用，为植物表观遗传调控与根系微生物群之间的联系提供新思路。

组蛋白甲基化根系菌群核心物种共现网络水稻

河流生态系统

中科院南土所褚海燕组揭示冰川源水体和沉积物细菌群落显著分异

冰川源的水生生态系统中的细菌群落是全球气候变化和水文循环的重要生物指标。本研究系统地比较了以冰川为主要水源补给的多种水生环境中水体和沉积物中细菌群落的多样性、群落组成和共现网络模式。水体和沉积物细菌群落表现出不同而错综复杂的环境偏好性和脆弱性。因此，阐明冰川源水生生态系统在环境条件变化下的细菌群落组成的机制，对于理解水文制度对气候变暖等干扰事件的适应能力至关重要。共存的水体和沉积物细菌群落是由不同的环境因素所驱动。这项工作也为环境变化下的水资源管理和水生态保护提供了一定的科学依据。

河流生态系统共现网络核心物种生态集群环境偏好