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数据整合
文章数:3篇
单细胞特征
深圳湾实验室Nature子刊:炎症性肠病单细胞水平特征和潜在治疗靶点是何?
炎症性肠病为累及回肠、直肠、结肠的一种特发性肠道炎症性疾病。既往单细胞转录组研究揭示了来自IBD患者的细胞亚群的多样性,但这些亚群在不同解剖区域和疾病状态下的异质性仍有待解析。近日,深圳湾实验室张雷及团队在Nature Computational Science发表最新研究,通过对IBD患者的单细胞转录组数据集整合分析,并结合GWAS研究及药物临床试验信息,揭示了IBD的细胞亚群和潜在的治疗靶点。还开发了交互式在线分析平台,用于加深研究者对IBD发病机制的理解并发现新的治疗靶点,值的关注。
单细胞特征
治疗靶点
研究论文
基础研究
数据整合
肠道菌群标志物
赵方庆等Nature子刊:拨开菌群大数据的迷雾,用NetMoss鉴定可靠的疾病标志物
肠道菌群作为疾病的“晴雨计”,是潜在的疾病标志物。然而,由于混杂因素(比如批次效应)以及基于丰度分析方法的局限性,不同研究之间难以鉴定出统一的疾病相关菌群标志物,这阻碍了菌群在疾病临床诊断和预后预测中的应用。为解决这一难题,中国科学院北京生命科学研究院的赵方庆团队,开发了一个基于生物学网络分析的新型工具——NetMoss,可以有效地解决以往微生物组数据整合中存在的批次效应问题,能极大提高对疾病相关肠菌标志物的识别能力。相关成果已在Nature Computational Science发表,强烈推荐专业人士关注!
肠道菌群标志物
分析工具
colorectal cancer
Data integration
data mining
数据整合
Nature Reviews:小伙伴,大影响(评论)
Nature Reviews Microbiology当月Genome Watch集中讨论了将代谢组学、基因组和功能数据结合,挖掘微生物及其代谢产物不为人知,意想不到的作用。
数据整合
脑肠轴
其他