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Doris Vandeputte
文章数:7篇
低温保存方法
低温保存介质条件影响人肠道厌氧菌恢复和培养
在培养组学研究的样品收集阶段,粪样保存的最佳条件对于后期尽可能覆盖和恢复肠道微生物组的多样性至关重要。Microbiome最新发表的文章对不同的低温保存方法进行了探索。
低温保存方法
肠道菌群培养组
研究论文
人类肠道菌群
Nature子刊:定量揭示人肠道菌群的变化性——对临床研究有何影响?
人肠道菌群不仅具有个体间差异,在同一个体内也呈现随时间的动态变化。Nature Communications近期发表研究,对20名比利时健康女性进行为期6周的密集式粪便采样,对共713个样本进行定量分析,在菌属水平上揭示了个体内和个体间的肠道细菌绝对丰度和相对丰度的变化性,还从菌群整体(肠型)的角度进行了分析,并探索了与菌群组成变异性相关的宿主协变量。鉴于菌群的这种波动性变化,该研究强调了多次采样对基于微生物组的靶标鉴定和诊断筛查的重要性。
人类肠道菌群
临床微生物组分析
菌群变化
量化分析
Nature:测序+流式细胞术,真正靠谱地量化分析菌群!
这是刚刚发表在Nature的提示要充分改变菌群分析游戏规则的研究,说明结合测序和流式细胞术计数的菌群量化分析方法,才能充分避免相对值分析的局限性。这是值得所有专业人士认真看看的文章,强烈推荐!
量化分析
微生物载量
流式细胞术
Christiane Sokollik
Bahtiyar Yilmaz
菊粉
Gut:菊粉改变什么肠道细菌并改善便秘?
昨天Online,今天日报里备受关注的文献,特别推荐。
菊粉
inulin
研究论文
以人为对象的临床试验
随机双盲对照实验(RCT)
菊粉
Gut:菊粉改变什么肠道细菌并改善便秘?
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菊粉
益生元
代谢组
便秘
Anaerostipes
物种-功能关系
Nature微生物学:菌群结构不同,生态学功能各异
关于菌群中物种与其功能间关系的Nature Microbiology杂志最新文章。
物种-功能关系
生态学特性
细菌生存策略
代谢一致性
厚壁菌
健康人菌群
Science:健康人的菌群长啥样?
① 整合分析比利时佛兰德斯肠道菌群计划(FGFP)、荷兰LifeLines-DEEP研究计划数据和全球数据库,共3948份健康人群粪菌数据;② 总共发现664属,其中Alistipes,梭菌属IV,副拟杆菌属和来自于放线菌门的14个菌属为核心菌群;③ 69个临床和问卷调研的协变量被发现与微生物组成变化相关:大便性状对菌群影响最大,药物治疗是影响粪便菌群发生变化最大因素;④ 出生方式等幼年期事件不影响成年菌群组成;⑤ 发现了一些能作为疾病生物标记的细菌属。
健康人菌群
正常菌群
核心菌群
疾病指针
Chenhong Zhang