单细胞转录组学

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单细胞转录组学

文章数：5篇

Cell：两种人类结直肠息肉的不同癌变之路

结直肠癌（CRC）起源于前体息肉，其细胞起源、分子异质性和免疫原性可为诊断和治疗提供参考。Cell近期发表的文章，通过对两种最常见的人类结直肠息肉——常规腺瘤和锯齿状息肉进行分析，发现两者具有不同的细胞来源、免疫微环境和癌变路径，加深了我们对于大肠息肉恶性进展及其微环境的认知，并为精确监测和预防结直肠癌提供参考。

结直肠癌大肠息肉单细胞转录组学成像图谱

单细胞转录组学

赵勇+张宏福：新生仔猪回肠上皮发育动态

中国农业科学院赵勇、张宏福及团队在mSystem上发表文章。采用单细胞RNA测序结合蛋白组学、成像分析，详述新生猪回肠上皮细胞的多样性，功能分化及分子调节机制。为肠道发育、炎症病理等的研究提供了详实的参考数据。

单细胞转录组学回肠上皮发育研究论文

急性肝衰竭

Nature子刊：肠道菌群协同MYC通路共同驱动急性肝衰竭

急性肝衰竭（ALF）是一种突发性的，致死率极高的疾病，ALF发展过程中变化的细胞、基因以及肠道菌群的影响仍不清楚，因此治疗措施仅局限于肝移植以及辅助性的治疗。Nature Medicine上发表的一项研究，对肝衰竭小鼠模型单细胞转录组学进行分析，发现并定义了新的星状细胞、内皮细胞、Kupffer细胞的myc-依赖性的激活，并发现这些细胞的激活是由肠道菌群所介导的；同时，文章还发现了如Ly6Chi单核细胞在ALF肝组织中的浸润。该文章将单细胞转录组与肠道菌群结合，全方位的揭示了肠道菌群在ALF中的作用，为寻找设计通路特异性的干预药物的研究提供了有力的依据。

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溃疡性结肠炎

Nature子刊：绘制UC患者的结肠CD8+ T细胞单细胞图谱

Nature Medicine上发表的一项最新研究，基于单细胞转录组学及质谱流式细胞技术，对健康人及溃疡性结肠炎（UC）患者的结肠CD8+ T细胞进行了分析，对比了患者与健康人结肠中各CD8+ T细胞亚群在比例及功能上的差异，发现UC患者的CD8+ 效应T细胞中GZMK及TNF-α表达升高，而CD8+ IL-26+ T细胞的比例也显著增加，GZMK+ TNF-α+ 效应T细胞与IL-26+ T细胞之间的平衡失调可能促进了UC患者的组织损伤。

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Cell：又是单细胞水平！肠绒毛不同区域的细胞有不同功能

肠上皮细胞具有多样化的功能，不仅参与各种营养物质的吸收，还要防御肠内微生物的入侵。Cell近期发表的一项研究，用单细胞空间转录组学方法，揭示了小肠绒毛中，肠细胞广泛的区域和功能异质性，将对肠上皮细胞基因表达和功能的认知的精度，又提高了一个水平，相关方法学也可用于其他组织器官的类似研究。这是Cell近期连续发表的第2项肠道领域的单细胞水平研究，另一项研究见此（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1064546867），scRNA-seq等单细胞分析技术不断成熟，将越来越多的出现在高水平研究中。

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