Laurie E Comstock

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Laurie E Comstock

文章数：11篇

脆弱拟杆菌的“套期保值”策略，帮助其逃离宿主防御提高竞争优势

I型R-M是一种普遍存在的可与外源入侵DNA对抗的防御系统，同时微生物也进化出一套抵抗I-R-M的逃逸机制，革兰氏阴性菌有很多特性，比如在其整个基因组中大量反转倒位DNA的功能，然而这些倒位是否能帮助菌群逃逸噬菌体的追捕，及其背后的作用机制仍不清楚。Nucleic Acids Research报道了一项研究，发现了脆弱拟杆菌在单个R-M基因座中四个不同反向重复序列处的可逆DNA倒位，产生了八个不同的特异性基因，所有这些基因均存在于细菌种群的表达基因座中，从而导致种群中广泛的甲基化多样性，不仅能帮助其避开宿主防御，同时增加其种群的菌株多样性，进一步增强其存活优势。

I型R-M 脆弱拟杆菌基础研究研究论文细胞系实验

对厌氧肠道菌进行动态成像的新方法

肠道菌群内包含大量的厌氧细菌，但使用基于荧光标记的成像技术来直观地研究厌氧菌中的动态过程，仍有很大困难，这是因为荧光蛋白的成熟需要氧气存在。PNAS近期发表的一项研究，利用一些表达细胞色素bd氧化酶的厌氧菌（如拟杆菌、Akk菌），具有在纳摩级别氧含量的条件下进行需氧呼吸的能力，建立了可用于在这些细菌中进行活菌荧光成像的方法，该方法或将有助于对肠道厌氧细菌进行多方面的研究分析。

细菌成像 fluorescent proteins Bacteroides nanaerobic GFP

用于拟杆菌和副拟杆菌遗传操作的新工具

拟杆菌目细菌是人肠道菌群的重要成员，已发现超过55个菌种，包含非常多样化的菌株。为了进一步研究这些细菌的基因功能，研究者需要对细菌进行基因敲除等遗传操作，通常会使用特定抗生素对改造的细菌进行筛选，但随着人肠道细菌耐药性越来越严重，常用于筛选的抗生素也越来越不好用。mBio近期发表一项研究，开发了一类通用、高效的质粒载体，以让细菌获得新的多糖利用能力作为筛选策略，搭配诱导型毒素作为反筛标记，可用于在多重耐药的拟杆菌属和副拟杆菌属细菌中制造等位基因缺失和置换等基因突变，推荐专业人士参考。

突变株构建

用于拟杆菌和副拟杆菌遗传操作的新工具

拟杆菌目细菌是人肠道菌群的重要成员，已发现超过55个菌种，包含非常多样化的菌株。为了进一步研究这些细菌的基因功能，研究者需要对细菌进行基因敲除等遗传操作，通常会使用特定抗生素对改造的细菌进行筛选，但随着人肠道细菌耐药性越来越严重，常用于筛选的抗生素也越来越不好用。mBio近期发表一项研究，开发了一类通用、高效的质粒载体，以让细菌获得新的多糖利用能力作为筛选策略，搭配诱导型毒素作为反筛标记，可用于在多重耐药的拟杆菌属和副拟杆菌属细菌中制造等位基因缺失和置换等基因突变，推荐专业人士参考。

突变株构建肠道拟杆菌遗传操作工具 Hamed Mohammadi Sepide Talebi

Nature子刊：一种拟杆菌门产生的新型抗菌肽

Nature Communications上发表的一项最新研究，鉴定出了一种由拟杆菌门物种产生的新型广谱抗菌多肽毒素，广泛存在于人群中，并可杀伤拟杆菌门的多个成员。

抗菌肽抗菌肽拟杆菌门 Peng Du Kaifeng Luo

微生物互作

Science：种间竞争塑造菌群（综述）

哺乳动物的肠道微生物群是多样的和动态的，肠道细菌对饮食和药物摄入敏感。然而，在健康的成年人中，微生物群落组成随着时间的推移保持相对稳定。Science发出的综述中，归纳了肠道细菌物种争夺空间和资源的机制：包括抗生素，细菌素，毒素和运输装置。这些“细菌”武器为潜在的治疗开发提供了宝贵的资源。

微生物互作种间竞争拮抗作用微生物生态学细菌素

mBio：拟杆菌目分泌的抗菌蛋白对在肠道定殖和竞争的作用

关于脆弱拟杆菌及单形拟杆菌分别分泌的两种抗菌蛋白如何帮助细菌在肠道定殖和竞争的分子机制研究，推荐看一看。

拟杆菌目抗菌蛋白 Lianwei Li Zhanshan Sam Ma

Nature：肠道菌群是如何进行内部合作的？

最新nature，值得一看。

Nature：肠道菌群是如何进行内部合作的？

最新nature，值得一看。

肠道菌群合作进化拟杆菌菊粉

脆弱拟杆菌VI型分泌系统通过新型效应物和免疫蛋白来拮抗人体肠道中的拟杆菌

① Ⅵ型分泌系统（T6SSs）基因座在拟杆菌中广泛存在，且分为三种遗传结构（GA），GA1、2存在于保守的整合结合元件上，在不同拟杆菌中传递共享，GA3基因仅在脆弱拟杆菌存在；② GA3 T6SSs会拮抗大多人类肠道拟杆菌菌株，除了具有相同T6SS位点的脆弱拟杆菌；③ 脆弱拟杆菌638R菌株的GA3可变区编码的效应蛋白和免疫蛋白与已知蛋白是非同源关系，大多具有多个预测的跨膜结构域；④ GA3 T6SSs可能使脆弱拟杆菌在肠道生态系统中获得一定的竞争优势；

拟杆菌细菌竞争微生态学 6型分泌系统

Cell子刊：miRNA，塑造菌群！

① 粪便miRNA介导种间基因调控，促进宿主控制肠道菌群；② miRNA在人和小鼠粪便样本中含量丰富，存在于细胞外小泡；③ 肠上皮细胞（IEC）和Hopx阳性细胞是粪便miRNA的主要来源；④ 粪便miRNAs可以进入细菌，如F. nucleatum和大肠杆菌，特异性调节细菌基因转录，影响细菌生长；⑤ IEC特异性缺失miRNA的小鼠表现出不受控制的肠道菌群，且结肠炎加剧，而WT小鼠的粪便miRNA移植则可恢复粪便微生物，改善结肠炎。

粪便miRNA 肠道菌群