微生态学

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文章数：11篇

流行病学研究如何使用菌群数据？

大规模人群研究中，肠道菌群数据已成为仅次于人类DNA数据的比对指标。《American Journal of Epidemiology》近期发表观点类文章，介绍了Sinha团队将菌群数据与标准流行病学相结合的开拓性研究，并探讨了菌群数据在流行病学研究中的潜力的运用前景。

流行病学观点评论微生态学

SR：仅不到1%已被研究人体微生物群落满足中性理论

中性理论认为：大部分对种群的遗传结构与进化有贡献的分子突变在自然选择的意义上都是中性或近中性的，因而自然选择对这些突变并不起作用，然而利用现有人体微生物组数据来检验中性理论，只发现不到1%的微生物群落满足中性理论。关于生态学的文章，感兴趣的人建议好好看看。

微生态学中性理论生物多样性 Mi-Ja Jung Jin-Woo Bae

FM：关于微生物共生，人类又有了哪些新认识？

关于微生物共生的一篇小文章，文章虽小，但值得好好阅读。

微生态学共生关系共生功能体海洋共生微生物

Nature子刊：研究微生物，只靠多组学根本不够！

Nature Microbiology新文章明确提出，要结合多组学、培养和生态学的研究，我们才能准确掌握微生物和微生态的规律，很值得一看的文章，强烈推荐。

微生态学宏基因组学宏转录组学宏蛋白组学宏代谢组学

非酒精性脂肪肝

JPGN：益生菌治疗儿童脂肪肝，证据有限但有希望

① 非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是最常见的儿童慢性肝病；② 迄今为止，无有效药物阻止甚至反转肝纤维化进程中的损伤；③ 少数几个临床研究证明：益生菌能改善肝代谢环境，这或许能发挥抗纤维化活性；④ 目前，可通过菌群变化研究肠道生态系统动力学，这可以推导益生菌的新功能，利于选择最佳益生菌；⑤ 支持益生菌功能的临床证据还很少，但菌群相关微生物学、微生态学，会在通过益生菌治疗NAFLD的研究中发挥积极和核心的作用。

非酒精性脂肪肝慢性肝病肝纤维化菌群动力学微生态学

个体本位模型

Nature Reviews：个体本位模型

关于生态学的内容，肠sir说脑袋瓜疼，谁能读懂这篇文献？求给群友科普。

个体本位模型微生态学个体本位生态学生态学 Kristoffer Forslund

PNAS：人体共生菌如何pk竞争者以在肠道存活？

关于细菌特别是人体共生细菌的研究最近有很多，不过我们特别分享一篇2015年发表在PNAS的文献，值得大家读一读。

微生态共生微生态学 6型分泌系统

脆弱拟杆菌VI型分泌系统通过新型效应物和免疫蛋白来拮抗人体肠道中的拟杆菌

① Ⅵ型分泌系统（T6SSs）基因座在拟杆菌中广泛存在，且分为三种遗传结构（GA），GA1、2存在于保守的整合结合元件上，在不同拟杆菌中传递共享，GA3基因仅在脆弱拟杆菌存在；② GA3 T6SSs会拮抗大多人类肠道拟杆菌菌株，除了具有相同T6SS位点的脆弱拟杆菌；③ 脆弱拟杆菌638R菌株的GA3可变区编码的效应蛋白和免疫蛋白与已知蛋白是非同源关系，大多具有多个预测的跨膜结构域；④ GA3 T6SSs可能使脆弱拟杆菌在肠道生态系统中获得一定的竞争优势；

拟杆菌细菌竞争微生态学 6型分泌系统

Nature子刊：初步理解怎样建立稳定的菌群

对之前Foster等人发表在Science的菌群生态学文章的介绍，图比较直观，推荐看看。

微生态学微生物群落动力学细菌竞争 Mi Young Yoon Sang Sun Yoon

Science：如何准确认识菌群的网络、竞争和稳定性？

去年年底，Science发表的关于微生态的重量级文献，是微生态学一篇承前启后的文章，对微生态网络、竞争和稳定性的科学理解，是推动我们做好基础研究、开发临床应用的基础。一切没有微生态指导的应用，可能都会摔跟头（参见Seres[呲牙]），所以认真看看这篇文章很重要。

微生态学细菌竞争菌群稳定性

Nature Reviews：菌群代谢产物如何影响大肠癌？（综述）

2014年9月发表在Nature Reviews Microbiology上的重要综述，系统阐述了肠道菌群代谢产物与大肠癌的关系，对饮食、代谢和癌症发生做了深入介绍，这是非常值得一看的经典综述，强烈推荐！

大肠癌代谢产物微生态学 Loreto Abusleme Niki M Moutsopoulos