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stratification
文章数:5篇
肠易激综合征
IBS和胆汁酸吸收障碍的菌群和代谢组标志物
肠易激综合征(IBS)是一个异质性的疾病,目前对临床亚型的诊断主要基于患者症状,缺少临床可用的生物标志物。这可能引起误诊,比如可引发腹泻的胆汁酸吸收障碍(BAM),因为症状相似,就常被误诊为腹泻型IBS,从而耽误治疗。Gastroenterolog发表的一项最新研究,试图通过分析粪便微生物组以及尿液和粪便代谢组,来寻找可用于诊断IBS及其亚型的标志物。研究发现,IBS患者的尿液和粪便代谢组以及粪便微生物组,与健康人有显著不同,而这种差异与IBS临床亚型无关,提示现有的IBS亚型诊断标准,无法反映患者的菌群和代谢异常;此外,该研究还表明粪便代谢组特征可用于判断患者是否患有BAM,有助于提高诊断准确性。这些发现为临床诊断和治疗IBS,提供了新的参考和视角。
肠易激综合征
machine learning
SeHCAT
stratification
Ruminococcus gnavus
结直肠癌
发现新型结直肠癌分层的分子标志物
病理Wnt通路激活是结直肠癌(CRC)的一个保守标志。Wnt激活突变可分为两类:包括非配体依赖性(LI)突变和配体依赖性(LD)突变激活。非配体依赖(LI)的细胞内信号转导蛋白(如腺瘤性息肉病基因、β-catenin)的改变导致该信号通路持续激活;配体依赖性(LD)突变通过内源性Wnt信号跨膜转导的扩增影响协同的R-Spondin轴。来自Gut杂志的一项最新研究,旨在探索Wnt靶基因的差异表达,寻找结直肠癌分层的分子生物标志物。该研究利用突变数据将病变细分为LI/LD肿瘤亚群,比较各组间的转录、甲基化、形态学和临床特征差异,最后发现适当的Wnt负反馈环的表观遗传抑制在LD肿瘤中具有选择性优势,而AXIN2在LD/LI病变中的差异表达可作为鉴别LD/LI肿瘤的分子标志物。
结直肠癌
AXIN2
Wnt signalling
colorectal cancer
molecular biomarker
炎症性肠病
Cell:单细胞水平分析结肠间充质细胞,为IBD治疗铺路
肠道间充质细胞度对维持肠上皮细胞稳态至关重要,但是这些细胞的内部差异和分工,人们还所知甚少。Cell近期上线的一项研究,对健康和结肠炎个体的结肠间充质细胞进行单细胞水平分析,根据基因表达特征鉴定出4个新亚群,并重点研究了两个亚群的特征和作用,其中的S4亚群与结肠炎密切相关。该研究还比对了人体和小鼠中这些亚群的异同,相关发现对于揭示炎症性肠病的病理机制和开发新疗法,都有重要意义。
INFLAMMATORY BOWEL DISEASE
mesenchymem
stromal cell
crypt niche
Wnts
代谢调控
肠道普氏菌属/拟杆菌属丰度或有益于代谢
European Journal of Nutrition上的一项最新研究,根据普氏菌属/拟杆菌属的比值,对99名健康人的肠道菌群进行分类,发现比值不会影响对大麦仁面包的代谢应答,但可能对宿主的代谢调节有益。
代谢调控
普氏菌属
拟杆菌属
Bacteroides
Barley
Gut microbiota
TM:人如何改善饮食,才能与微生物和谐共生?(长图+综述)
Trends in Microbiology最新上线的必读综述,从人类进化的不同阶段的饮食习惯开始,到如何通过饮食恢复现代人失去的微生物和它们的功能,再到系统性介绍微生物代谢产物和它们的功能,最后到怎样通过大数据做个体化饮食干预,说得很有调理,内容非常重磅,行文也颇有趣味。这样的综述,不看是不行的!而且还有热心肠先生编译改造的中文长图,让你一图读懂人类-微生物构成的生态系统,快打开看看吧。
Gut microbiota
Prevention
Diet
probiotics
stratification