Matthew R Redinbo

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Matthew R Redinbo

文章数：14篇

Cell子刊：肠道菌群色氨酸酶抑制剂或可改善慢性肾病

硫酸吲哚酚是一种微生物衍生的尿毒症毒素，在晚期慢性肾脏疾病中积聚，并导致肾脏和心血管毒性；硫酸吲哚酚是通过吲哚代谢产生，吲哚是一种仅由肠道微生物色氨酸酶产生的化合物。近日，发表在Cell Chemical Biology上的这篇文章，发现一种非杀菌性的肠道微生物色氨酸酶泛抑制剂，有望减少慢性肾病中的硫酸吲哚酚。

Science子刊：口腔菌群中的β-葡萄糖醛酸酶促进牙周炎

β-葡萄糖醛酸酶（GUS）可降解牙周组织中的成分，可作为牙周炎严重程度的生物标志物。Science Advances上发表的一项最新研究结果，在人口腔菌群中鉴定出了多种不同的GUS，并发现GUS降解牙周组织中的多糖的能力明显优于人GUS。

牙周病口腔菌群 β-葡萄糖醛酸酶研究论文基础研究

活化IBD药物的肠道菌群偶氮还原酶景观

这是发表在Gut Microbes上的一份工作，作者着眼于可活化偶氮连接前药的肠道菌群偶氮还原酶（AzoRs）。他们基于目前已知的四种细菌偶氮还原酶晶体结构预测了活性位点，并基于活性位点通过序列从宏基因组数据集中鉴定获得196个独特的AzoRs，并对其来源和整体丰度进行阐述。他们发现肠道菌群中的AzoRs功能多样但整体丰度较低，因此依赖偶氮连接的前药激活来结肠递送治疗药物可能仍然存在问题。

胆盐水解酶

Nature子刊：揭示乳酸杆菌改变胆汁酸组成分布促进定植抗性的新机制

胆汁酸（BA）介导宿主与微生物之间的互作，影响艰难梭菌感染机体。已知胆盐水解酶（BSH）通过对结合胆汁酸去结合改变BA库，但其结构选择性，以及对艰难梭菌的影响尚未可知。Nature Microbiology发表的文章对此进行了探讨。

胆盐水解酶艰难梭菌研究论文

药物-菌群互作

宏基因组学结合蛋白质组学，鉴定出可激活霉酚酸酯的肠道细菌酶

霉酚酸酯（MMF）是一种用于预防器官移植排斥和治疗自身免疫性疾病的免疫抑制剂前药，然而约45%的服用MMF的患者会出现胃肠道毒性；肠道细菌的β-葡萄糖醛酸酶（GUS）可将MMF从非活性的霉酚酸葡萄糖醛酸（MPAG）重新激活为活性的霉酚酸（MPA）。GUS酶根据其结构特征具有不同的底物偏好，目前尚未鉴定出重新激活MPA的肠道微生物GUS酶。近日，发表在Gut Microbes的这篇文章中，通过结合宏基因组学与基于活性的蛋白质组学方法，鉴定出可重新激活MPA的肠道细菌酶，可能驱动了MPA诱导的胃肠道毒性。

药物-菌群互作细菌酶多组学

香港浸会大学Nature子刊：警惕！牙膏中的三氯生可促肠炎

三氯生（TCS）是一种广谱抗菌剂，广泛被添加在牙膏、肥皂、除臭剂、漱口水、剃须膏等日化用品中。由于TCS可以预防牙龈炎，因此在许多牙膏中添加使用。此前已有研究证实了TCS的肠道毒性，但相关的分子机制尚未确定。香港浸会大学蔡宗苇团队与国外团队合作发表在Nature Communications上的一项研究证明了TCS如何引发肠道炎症，确定了所涉及的特定酶——β-葡萄糖醛酸（GUS）酶是TCS肠道毒性所必需的。该研究结果揭示了肠道微生物酶对TCS的代谢激活和其肠道毒性的机制，将有助于更好地评估TCS在不同人群中的个体效应。考虑到TCS和相关化合物对肠道的潜在危害，应当重新评估TCS对人体健康的影响。

三氯生肠道细菌代谢酶结肠炎

抗肿瘤治疗

抑制肠道细菌的β-葡糖醛酸酶活性可提升伊立替康的疗效

伊立替康可用于多种实体瘤的治疗，但肠道细菌的β-葡糖醛酸酶对伊立替康的代谢可能造成炎症的胃肠道毒性。来自PNAS上发表的一项最新研究，发现相比于单独使用伊立替康，将β-葡糖醛酸酶抑制剂与伊立替康联用，可在乳腺癌小鼠模型中显著延长生存期、缓解伊立替康造成的肠道损伤并显著降低肿瘤体积，且不会引发肠道菌群组成的变化。

抗肿瘤治疗 Microbiome Chemotherapy Cancer gastrointestinal toxicity

微生物代谢物模拟

微生物代谢物模拟助力药物研发

文章利用微生物代谢物模拟方法，基于IPA和吲哚在人PXR的配体结合域中的相互作用，研发了两个先导类似物：FKK5和FKK6。FKK6与与PXR直接作用，诱导PXR特定编码基因在细胞、人体类器官以及小鼠体内表达。FKK6还具有潜在的消炎作用。FKK6的发现，微生物代谢物模拟为药物研发提供可能。

微生物代谢物模拟 Laura S Weyrich Matilda Handsley-Davis

小鼠肠道菌群

小鼠肠道菌群的葡萄糖醛酸酶组（GUSome）

肠道菌群编码的葡萄糖醛酸酶（β-glucuronidase，GUS）在药物代谢、药物毒性、肠道癌变和宿主-菌群相互作用中发挥重要作用。之前，人肠道菌群的 GUSome 中发现了279个独特的GUS，并依据蛋白质活性位点将其分为六类。本研究则针对于小鼠这一模式生物，开展了类似的研究。

小鼠肠道菌群 β-葡萄糖醛酸酶 beta-glucuronidase gut microbiome mouse metagenomics

被研究的粑粑，有学名了！

in vivo, in vitro, in silico, ex vivo, ... 在生物学中有很多广泛使用的拉丁文术语。近期Gastroenterology发表的短文，对于肠道菌群研究中最常用到的研究材料——粪便，提出了一个专门的拉丁文术语"in fimo"，听起来不错~

术语粪便 Ling He Ling He

mBio：嗜酸乳杆菌帮助宿主利用植物糖苷

这是近期mBio[IF：6.956]发表的评论文章，回顾介绍了之前同刊物发表的关于嗜酸乳杆菌代谢植物糖苷的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1038908210），推荐专业人士搭配阅读。

嗜酸乳杆菌

mBio：嗜酸乳杆菌帮助宿主利用植物糖苷

这是近期mBio[IF：6.956]发表的评论文章，回顾介绍了之前同刊物发表的关于嗜酸乳杆菌代谢植物糖苷的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1038908210），推荐专业人士搭配阅读。

嗜酸乳杆菌植物糖苷 enzymes Gut microbiota plant glycosides

β-葡萄糖醛酸酶

Structure：人体肠道菌群中的β-葡萄糖醛酸酶

① 菌群基因编码的β-葡萄糖醛酸酶（GUS）在胃肠道药物代谢中发挥重要作用；② 人体胃肠道菌群中的GUS数量、类型及多样性尚未明确；③ 本文从人类微生物组计划GI数据库中鉴定出共3013个、279种独特的菌群基因编码的GUS蛋白，根据其结构特征可分为6类；④ 对139个采样个体进行分类，评估其细胞内定位，揭示个体间差异，发现了112种新的菌群GUS；⑤ 在科水平强调GUS的结构及功能差异，包括对较小的葡糖苷酸及较大的碳水化合物的差异化处理。

β-葡萄糖醛酸酶 Human Microbiome Project X-ray crystallography alpha-beta hydrolase gastrointestinal microbiota

Koch’s Postulates

Cell子刊：靠谱的天然药物，或许就在我们肚子里

这是对我们之前分享的一篇文章（http://mc.gutgutgut.cn/papers/read/1087451040）的介绍，看看标题，就是值得读一读。

GI microbiota Koch’s Postulates human microbiome human therapeutics microbial metabolites