小鼠肠道菌群

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小鼠肠道菌群

文章数：6篇

谢明勇院士团队：生活环境太潮湿或可增加肠道疾病的发生

温度和湿度是对人生存具有重要影响的环境因素。随着温室效应的不断加重，地球气候将变得更加温暖和潮湿。环境流行病学研究显示，湿度与很多疾病的发生有密切关系。然而，湿度对健康的影响以及相关机制尚不明确。尿素是哺乳动物蛋白质分解代谢的主要产物，从血液循环进入宿主的消化道，被肠道菌群代谢为氨和二氧化碳。氨对宿主结肠细胞有毒性作用，但又是肠道菌群合成蛋白质和核酸的主要氮源。同时，肠道菌又可以将氨转化为对宿主有益的短链脂肪酸。因此肠道菌群-宿主间的氮循环对于宿主的健康发挥着重要作用。有趣的是，高湿度环境下奶牛肠道尿素-氮循环会发生异常，提示高湿度可能影响肠道菌群。但目前湿度对肠道菌群影响的研究尚属空白。近期国内南昌大学谢明勇院士团队在Journal of Advanced Research上发表了一篇工作，通过对高湿环境小鼠的肠道菌群、Na/K ATP 酶、红细胞形态、以及结肠氨代谢进行了动态检测，发现短期高湿度的暴露可以增加宿主结肠尿素流入，改变肠道菌群组成，影响结肠尿素氮代谢，从而影响宿主的健康。这一研究为高湿度对人类健康的影响，提供了重要的证据。

高湿度胃肠道疾病结肠尿素氮肠道菌群红细胞Na/K ATP酶

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Cell子刊：小鼠肠道宏基因组包含460万个基因和660个基因组的基因集

通常，参考基因目录的生成涉及特定于样品的组装，基因预测以及基因条目的全数据集聚类，以减少冗余。但是，这种方法导致基因条目的物种分类学分辨率降低。这是由于高度相关但截然不同的基因的聚类以及缺乏高分辨率的分类学信息所致。大规模宏基因组学方法面临的一个具体挑战是将特定的16S rRNA基因序列与MAGs连接起来，这通常导致连接率较低。在这里，作者提出了一种综合的方法和相应的计算流程来构建整合的基因目录，从而显著改善了基因条目的物种分类学分辨率，并将基因链接到MAGs(宏基因组装配的基因组）和重建的全长16S rRNA基因。整合的小鼠肠道宏基因组目录（iMGMC）由298个可公开获得的新测序的宏基因组样本构建而成。此外，本文提出了一组另外的MAGs，它们是从898个宏基因组测序样品的单独单样品组装中获得的，与整合到iMGMC中的MAGs一起组成了1,296种细菌水平的细菌基因组。

小鼠肠道菌群基因目录微生物组宏基因组装配基因组 Mouse gut microbiota

小鼠肠道菌群

刘双江+刘宏伟：小鼠肠道微生物资源库（mGMB）——研究肠道菌群的新资源

小鼠是研究肠道菌群的最常用的模式生物，但可培养的小鼠肠道微生物资源仍非常匮乏，阻碍了对肠道微生物的功能性研究。中科院微生物所刘双江和刘宏伟与团队通过大规模分离培养，构建了小鼠肠道微生物资源库（mGMB），包括126种细菌及其基因组（含77个新菌种），大幅扩充了可培养的小鼠肠道细菌库，为后续展开以小鼠为模型的宿主-肠道菌互作和菌群功能研究，打下坚实的基础。相关成果已在Nature Communications发表，值得专业人士关注。

小鼠肠道菌群 Microbiome symbiosis 小鼠肠道微生物资源库

菌群数据库

哈尔滨医科大学：gutMDisorder——疾病和干预与肠道菌群关联性的数据库资源

为了方便科研人员了解在疾病和干预中的肠道菌群失调，哈尔滨医科大学团队开发了gutMDisorder数据库，汇总了在人类和小鼠中证实的肠道微生物与疾病或干预之间的关联性信息，并为用户提供下载和检索等功能，相关成果近期在Nucleic Acids Research发表，值得专业人士关注。

菌群数据库人肠道菌群小鼠肠道菌群菌群-疾病关联性菌群-干预关联性

肠道菌群或参与砷毒作用

砷可通过抑制肝X受体/类视黄醇X受体（LXR/RXR），破坏脂质代谢紊乱，导致心脏病。作者通过对常规小鼠和抗生素处理小鼠进行不同剂量的砷暴露处理，选择血清和肝脏组织，进行相关基因表达、胆固醇和脂质水平的检测，发现肠道菌群参与调节砷暴露导致的LXR/RXR信号及胆固醇和脂肪酸的紊乱，因此提出肠道菌群或可作为调控目标或手段降低砷毒影响。值得注意的是，原文作者最后提到了本实验仍存在处理时间短、剂量不足、未考虑性别因素和抗生素处理后的无菌鼠可能影响实验结果的不足，未来仍需进一步实验。

砷暴露小鼠肠道菌群小鼠脂质代谢紊乱胆固醇代谢紊乱

小鼠肠道菌群

小鼠肠道菌群的葡萄糖醛酸酶组（GUSome）

肠道菌群编码的葡萄糖醛酸酶（β-glucuronidase，GUS）在药物代谢、药物毒性、肠道癌变和宿主-菌群相互作用中发挥重要作用。之前，人肠道菌群的 GUSome 中发现了279个独特的GUS，并依据蛋白质活性位点将其分为六类。本研究则针对于小鼠这一模式生物，开展了类似的研究。

小鼠肠道菌群 β-葡萄糖醛酸酶 beta-glucuronidase gut microbiome mouse metagenomics