菌群-疾病关联性

人体内存在着一个复杂而动态的微生物群落，会影响多种癌症的发生、发展、转移和治疗反应。近年来的研究表明，微生物群落在前列腺癌的发生和进展中可能发挥着一定的作用。然而，造成这种关联的具体机制尚不清楚。一篇发表在Nature Reviews Urology上的综述文章回顾了将肠道和尿道菌群与前列腺癌发生和发展联系起来的临床前和临床研究，为未来的研究提供了新的视角，并探讨了这些相互作用对于前列腺癌的预防和治疗的潜在策略。

前列腺癌微生物群菌群-疾病关联性

肠道真菌组

国内团队：艰难梭菌感染中的肠道真菌群落特征

肠道菌群失调是艰难梭菌感染（CDI）的重要因素，已有研究表明细菌菌群失调影响梭菌感染后是否发病及发病的严重程度，但肠道真菌在其中的作用尚不清楚。来自西北农林科技大学曹阳春和哈佛医学院的陈新华研究团队在Microbiology Spectrum上发表一项研究，分析了CDI患者和非CDI患者（包括携带者，腹泻但非携带者及健康者）的肠道真菌组成和血清免疫因子以及它们之间的关联，发现或可用于区分CDI的潜在生物标志物，提示肠道真菌在CDI中的重要作用。

肠道真菌组艰难梭菌感染免疫因子菌群-疾病关联性

心血管

李菁等：发现新的产TMA肠菌，或促动脉粥样硬化

氧化三甲胺（TMAO）是一种肠源性的菌群相关代谢产物，其在宿主肝脏中合成，在心脏疾病中扮演着重要角色。前体三甲胺（TMA）的生成离不开肠道菌群的参与。肠道中的部分菌群可产生三甲胺裂解酶，将直接饮食摄入或间接生成的胆碱、甜菜碱、肉碱类和TMAO转化为TMA，后者经门脉循环进入肝脏并被黄素单加氧酶氧化生成TMAO。TMAO是包括心血管疾病在内的许多慢性疾病的潜在风险因子。来自中国药科大学的李菁、齐炼文和尚靖与团队发表在NPJ Biofilms and Microbiomes上的一项研究系统分析了人类肠道菌群中能产生TMA裂解酶的菌属，并首次报告了一个产生TMA的Lachnoclostridium属细菌L. saccharolyticum WM1，它在动脉粥样硬化患者中大量存在。因此靶向Lachnoclostridium属细菌可能成为治疗动脉粥样硬化的潜在治疗靶点。

心血管菌群-疾病关联性三甲胺三甲胺裂解酶肠道菌群

口腔菌群

浙江工商大学：过敏患者的口腔菌群和代谢物特征

当前，过敏性疾病已经成为严重影响人体健康的全球性问题，其中尤以哮喘、过敏性鼻炎、过敏性皮炎以及食物过敏的现象较为普遍。针对过敏性疾病的表型研究有助于深入理解相关免疫学机制，为过敏性疾病的防控带来借鉴和支撑。来自浙江工商大学的傅玲琳教授团队在Allergy上发表一项研究，通过招募患有单致敏和多致敏表型的过敏患者，以“口腔黏膜免疫”为全新切入点，利用多组学联合分析技术，首次从“微生物群-唾液免疫平衡”角度揭示了不同表型过敏患者的口腔微环境变化以及“宿主-微生物群”的强烈相互作用，证实了多致敏表型与口腔微生态和局部免疫环境的失衡有关。该研究可为过敏性疾病的表型研究提供理论依据，并为多病态过敏性疾病的干预和治疗提供潜在靶点。

口腔菌群过敏宿主-微生物稳态细胞因子菌群-疾病关联性

菌群-疾病关联性

菌群与疾病的关联，很多不可靠？

肠道菌群与疾病/表型的关联研究具有重要意义，不仅能为疾病的诊断提供候选标志物，还可指导后续的机制研究。然而，菌群关联研究中常可见到不一致的结果。造成这一现象的原因可能有很多，比如DNA提取方法、生信分析流程、建模策略、混杂因素的校正等，都可能对研究结果产生影响。PLoS Biology发表的这项研究，提出了一种方法，可用于评估菌群关联研究结果的可靠性，并用该方法对已发表的部分微生物-疾病关联进行了系统性的评估。

菌群-疾病关联性

古菌群/组

唐啸宇+郑庆飞等：人体古菌组代谢对于肿瘤微环境和癌症发生发展的潜在影响

随着研究的深入，人们越来越意识到古细菌与包括癌症在内的人类疾病有关。古细菌利用独特的代谢途径产生多种代谢物，这些代谢物是宿主与微生物相互作用的直接联系。然而，关于人类相关古菌多样性的知识仍然非常有限，对其代谢产物对肿瘤微环境和致癌作用的病理影响知之甚少。近日，深圳湾实验室化学生物学研究所唐啸宇课题组与俄亥俄州立大学郑庆飞课题组合作，在美国微生物学会期刊Microbiology Spectrum上发表一项研究，通过大数据分析，系统展示了古菌与癌症之间的潜在关联，为癌症的预防、诊断和治疗提供全新的思路和策略。

古菌群/组大数据分析菌群-疾病关联性菌群代谢产物

人肠道菌群

Nature子刊：抗生素用药史影响菌群-疾病关联

Nature Communications近期发表来自爱沙尼亚微生物组队列的研究，结合宏基因组和电子健康数据分析，扩展了人们对于菌群-宿主互作的认知，特别是抗生素使用史对于肠道菌群与疾病关联的影响，强调了纵向的长期健康数据记录对研究菌群-疾病关联的重要性。

人肠道菌群标志物菌群-疾病关联性抗生素

肠易激综合征

侯晓华+宁康+丁震：腹泻型IBS患者的肠道菌群特征

肠易激综合征（IBS）是一种功能性肠病，以腹痛或腹部不适为主要症状，影响全球约10%的人口。虽然IBS的病理生理学尚不清楚，但已发现肠道菌群失调是IBS的潜在致病机制之一。目前，大多数分析腹泻型肠易激综合征（IBS-D）的研究主要基于粪便样本，但粪便菌群不能完全代表肠道菌群。来自华中科技大学的侯晓华、宁康、丁震等人在Microbiology Spectrum上发表一项研究，利用多个肠道部位的样本来描述IBS-D患者的肠道菌群特征，发现直肠粘膜的微生物群落更适用于IBS-D的诊断。

肠易激综合征菌群-疾病关联性肠道菌群疾病诊断腹泻型肠易激综合征

痛风

国内团队：痛风患者的肠道菌群特征

有证据表明，肠道菌群与关节炎疾病（包括痛风）之间存在关联。然而，在痛风中，肠道细菌如何以及哪些细菌影响宿主尿酸盐降解和痛风炎症仍不清楚。来自华南师范大学的王璋和广东省中医院的黄清春、黄闰月与团队在NPJ Biofilms and Microbiomes上发表的一项研究，对102名痛风患者和86名健康对照的307份粪便样本进行了宏基因组分析，发现痛风患者的肠道菌群结构显著异于健康对照，并与其他自身免疫病患者更为接近，表明肠道菌群失调与宿主尿酸盐降解和全身炎症的失调有关，或可作为痛风的非侵入性诊断标志物。

痛风宏基因组菌群-疾病关联性疾病预测肠道菌群

帕金森病（PD）

预防帕金森病，保持肠道健康很重要（综述）

炎症性肠病（IBD）是一种引起胃肠道或肠道炎症的慢性疾病，因为免疫系统攻击肠道中的健康组织细胞和生活在那里的有益细菌。既往的研究已经提出，肠道炎症会影响帕金森病（PD）的发展。肠道功能障碍可能是帕金森病早期症状，甚至是先于帕金森病并导致其发生的元凶。确定与帕金森病前驱阶段有关的风险因素或有助于进行疾病早期干预研究，这可能会改变或减缓疾病进展。发表在Gut上的一篇综述文章，详细比较了这两种疾病的异同，指出它们可能具有相同的遗传学特征和可能的生物学联系。该文章强调了通过调节和改善肠道功能来预防和缓解PD疾病的重要性。

帕金森病（PD）炎症性肠病菌群-疾病关联性富亮氨酸重复激酶2 肠-脑轴

肠道菌群

薛丽香+徐立+蔡军：肠道菌群与心血管疾病（综述）

肠道菌群组成、特异性菌种或菌群的变化与各类疾病的发生有密切的相关性。最近的研究表明，心血管疾病（Cardiovascular disease，CVD）也可能与肠道菌群失衡有关。北京大学第三医院的薛丽香、首都医科大学附属北京朝阳医院的徐立和阜外医院蔡军等人发表在Protein & Cell上的一篇综述文章，系统阐述了肠道菌群失调与高血压、动脉粥样硬化和心力衰竭等CVD的相关性以及对CVD的发生和发展的潜在影响，并指出调控肠道菌群有望作为心血管疾病的潜在治疗新靶点。

肠道菌群心血管疾病 action mechanism cardiovascular diseases Gut microbiota

呼吸道感染

Cell子刊：生命早期菌群与呼吸道感染（综述）

呼吸道感染（respiratory tract infections，RTI）是导致全世界儿童较高发病率和死亡率的主要原因之一。这些感染范围从轻度上呼吸道感染或普通感冒到危及生命的疾病，包括下呼吸道感染（LRTI）或肺炎。通常认为RTI是由病毒或致病菌如流感嗜血杆菌和肺炎链球菌引起，但一些无症状感染现象表明这种观点似乎不够准确。研究表明，呼吸道和肠道菌群与RTI的发病机制有着明显的联系。宿主和环境因素可以在生命早期驱动呼吸道菌群的成熟，这反过来又与对RTI的连续易感性有关。此外，在RTI（包括病毒性细支气管炎）期间，局部微生物似乎通过复杂的相互作用发挥免疫调节作用，尽管这些因果关系尚未完全证实。发表在Cell Host & Microbe的一篇综述探讨了支持这些联系的流行病学证据以及内在机制。对生命早期呼吸道感染的长期后果和菌群在RTI发病各阶段的综合作用的理解有助于早期预防和干预治疗，以促进呼吸道健康。

呼吸道感染 respiratory microbiota respiratory tract infections RTI susceptibility Host-Microbiota Interactions

菌群-疾病关联性

年龄可能影响对疾病相关菌群特征的鉴别

对疾病、菌群与年龄三者之间关联的研究较少。来自eLife上发表的一项最新研究，发现随着年龄的增长，个体将逐渐获得与疾病相关的菌群特征，并鉴定出一个与年龄增长相关的分类群集合，该集合的变化在多种疾病中均可发现。该研究结果提示，年龄相关的菌群变化可能影响对菌群-疾病关联的研究。

菌群-疾病关联性年龄 Shuai Yuan Jie Chen Xue Li

菌群数据库

哈尔滨医科大学：gutMDisorder——疾病和干预与肠道菌群关联性的数据库资源

为了方便科研人员了解在疾病和干预中的肠道菌群失调，哈尔滨医科大学团队开发了gutMDisorder数据库，汇总了在人类和小鼠中证实的肠道微生物与疾病或干预之间的关联性信息，并为用户提供下载和检索等功能，相关成果近期在Nucleic Acids Research发表，值得专业人士关注。

菌群数据库人肠道菌群小鼠肠道菌群菌群-疾病关联性菌群-干预关联性

宏基因组分析工具

分析菌群与疾病关联的新工具MicroPro

宏基因组分析工具菌群-疾病关联性病毒 Jatin Nagpal John F Cryan

特发性肺纤维化

特发性肺纤维化与呼吸道菌群的因果关系（评论）

研究表明，环境和宿主之间的相互作用在特发性肺纤维化（IPF）的发生和发展中起到一定的作用，特别是微生物感染因素在IPF发病与进展中具有重要的意义。呼吸道菌群失调与IPF密切相关，但关联性并不等于因果性。发表在American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine上的一篇评论文章指出，对于呼吸道菌群和IPF因果性的研究充满了挑战。尽管小鼠模型的研究表明，呼吸道菌群失衡通过促进宿主炎症加剧IPF进程，但由于博莱霉素诱导的IPF小鼠模型难以体现真实疾病状态，并且由于人类IPF疾病研究的局限性，因此需要更多的临床证据来证实人类呼吸道菌群与IPF的因果关系，从而为个性化治疗提供理论指导。

特发性肺纤维化 IPF Microbiome bleomycin 因果关系

代谢疾病

Nature子刊：肠道菌群、短链脂肪酸和代谢疾病有因果关联

肠道菌群与2型糖尿病、肥胖等代谢异常具有相关性。Nature Genetics近期发表的一份通信研究，通过结合全基因组基因分型、肠道宏基因组和代谢产物数据，利用双向孟德尔随机化法分析，发现肠道菌群和特定代谢产物与人体代谢具有因果关系。该方法和结果对菌群-疾病相关研究具有重要参考价值。

代谢疾病肠道菌群肠道菌群代谢物孟德尔随机化法代谢疾病

生物信息学工具

生物信息学工具菌群-疾病关联性分类树进化树 Alexei Verkhratsky

菌群-疾病关联性

Nature子刊：肠道菌群与常见疾病和药物的大规模相关性研究

Nature Communications本周上线一项可能是迄今最大规模的肠道菌群与常见疾病和药物的关联性研究，不仅鉴定出许多新关联，还表明某些菌群标志物可用于反映整体健康情况，而非特定疾病。这些发现为未来肠道菌群与人体健康的研究提供了大量宝贵的数据参考，值得特别关注。

菌群-疾病关联性菌群-药物关联性肠道菌群英国TwinsUK队列 Mustafa Raoof