呼吸道感染

呼吸道微生物群被认为是呼吸道健康的守门人，病毒感染会破坏其维持的微生物-宿主平衡。然而对于呼吸道病毒感染塑造的呼吸道菌群特征，以及这种塑造是否具有病毒特异性，目前仍不清楚。近日，中山大学中山医学院丁涛及团队在Microbiome发表最新研究，招募了包含735名上呼吸道症状的门诊患者，揭示了不同病毒感染下的口咽菌群表现出三种不同的生态失调模式，同时发现甲型流感病毒与上呼吸道微生物组多样性的变化有关，并提出致病细菌生长速度的增加是流感病毒感染的关键过程，值得关注。

呼吸道病毒感染口腔菌群研究论文基础研究高通量测序

婴儿肠道菌群

Lancet子刊：生命早期肠道菌群与儿童期呼吸道疾病息息相关（综述）

越来越多的研究数据表明，生命早期肠道菌群在肺免疫发育中发挥重要作用。近期发表于Lancet Microbe的一篇系统综述表明，生命早期（婴儿时期）肠道菌群α-多样性和某些菌属丰度较低与儿童期呼吸系统疾病风险较高有关。但是，相关研究存在不一致，未来还需要更多研究。

婴儿肠道菌群儿童呼吸系统疾病生命早期哮喘呼吸道感染

益生菌

益生菌可降低呼吸道感染风险

Advances in Nutrition上发表的一项荟萃分析结果，总结了39项随机对照试验（共8046名受试者）的数据，口服益生菌可降低呼吸道感染（RTI）风险，并改善RTI的持续时长及严重程度，而益生元及合生制剂的相关研究较少。

益生菌益生元合生制剂荟萃分析呼吸道感染

呼吸道合胞病毒

Lancet：最全数据估计，儿童呼吸道合胞病毒感染疾病负担

呼吸道合胞病毒研究论文儿童呼吸道感染

维生素D

Lancet子刊：补充维生素D无法降低老年人的急性呼吸道感染风险

一些观察性研究的结果发现，缺乏维生素D与急性呼吸道感染相关。D-Health试验是一项随机双盲安慰剂对照试验，旨在评估每月口服维生素D对急性呼吸道感染的影响。The Lancet Diabetes and Endocrinology上发表了该试验的最新数据分析结果，发现每月口服6000IU的维生素D，并未能显著降低老年人的急性呼吸道感染风险，仅对症状持续时间有轻微的减少作用。

维生素D 呼吸道感染研究论文老年人

洗涤菌群移植

张发明+张筱茵等：洗涤菌群移植用于呼吸道传染性疾病的专家建议

国家感染病临床医学研究中心张筱茵团队和南京医科大学第二附属医院张发明团队等合作，近期在 Elsevier出版集团旗下新刊Medicine in Microecology上发表文章，强调在呼吸道传染性疾病大流行期间，医生可以在安全和质量控制的基础上考虑对患者进行洗涤菌群移植（WMT），重点是治疗患者合并的肠道菌群失调，对于“从肠治肺”也非常重要。文章特别就呼吸道疾病爆发期间实施WMT的流程给出详细的专家建议，鼓励更多的医生尝试用WMT控制疾病，同时特别提醒要防止商业利益驱动的WMT滥用和不合法的行为。PubMed近期特别收录了本文，推荐专业人士参考。

洗涤菌群移植呼吸道感染 COVID-19

呼吸道感染

Cell子刊：生命早期菌群与呼吸道感染（综述）

呼吸道感染（respiratory tract infections，RTI）是导致全世界儿童较高发病率和死亡率的主要原因之一。这些感染范围从轻度上呼吸道感染或普通感冒到危及生命的疾病，包括下呼吸道感染（LRTI）或肺炎。通常认为RTI是由病毒或致病菌如流感嗜血杆菌和肺炎链球菌引起，但一些无症状感染现象表明这种观点似乎不够准确。研究表明，呼吸道和肠道菌群与RTI的发病机制有着明显的联系。宿主和环境因素可以在生命早期驱动呼吸道菌群的成熟，这反过来又与对RTI的连续易感性有关。此外，在RTI（包括病毒性细支气管炎）期间，局部微生物似乎通过复杂的相互作用发挥免疫调节作用，尽管这些因果关系尚未完全证实。发表在Cell Host & Microbe的一篇综述探讨了支持这些联系的流行病学证据以及内在机制。对生命早期呼吸道感染的长期后果和菌群在RTI发病各阶段的综合作用的理解有助于早期预防和干预治疗，以促进呼吸道健康。

呼吸道感染 respiratory microbiota respiratory tract infections RTI susceptibility Host-Microbiota Interactions

短链脂肪酸

Cell子刊：流感可影响肠道菌群，增加呼吸道细菌感染风险

呼吸道病毒感染后可能发生二次细菌感染。Cell Reports上发表的一项最新研究，揭示了流感病毒感染促进二次细菌感染的机制：甲型流感病毒感染抑制了小鼠的进食，导致小鼠的肠道菌群组成及代谢发生变化，降低了肠道及血液中的短链脂肪酸（尤其是乙酸盐）的水平，从而抑制了肺泡巨噬细胞的杀菌活性，以促进肺炎链球菌的感染。补充乙酸盐可通过激活游离脂肪酸受体2（FFAR2），可抑制流感病毒感染期间的细菌感染。

短链脂肪酸 influenza A virus bacterial superinfection Gut microbiota microbial dysbiosis

合生制剂

合生制剂或可用于预防呼吸道感染

Advances in Nutrition上发表的一项荟萃分析结果，对16项RCT（涉及超过1万名受试者）进行总结后发现，补充合生制剂可显著降低呼吸道感染的发病率，且相比于婴儿及儿童，合生制剂在成年人中预防呼吸道感染的效果更好。

合生制剂 synbiotics probiotics Prebiotics respiratory tract infections

鼻咽菌群

儿童鼻咽菌群与呼吸道感染及胃肠道感染的关联

Clinical Infectious Diseases上发表的一项最新研究，对近200名委内瑞拉儿童的鼻咽菌群进行分析后发现，呼吸道感染与胃肠道感染均与鼻咽菌群组成的改变相关，且胃肠道感染儿童与呼吸道感染儿童的鼻咽菌群组成也不同，而鼻咽菌群与儿童接种肺炎球菌疫苗后的抗体应答水平关联较小。研究提示，潮湿的生活环境会增加胃肠道感染及呼吸道感染的易感性，需要根据区域菌群模式制定预防和治疗方法。

鼻咽菌群 respiratory microbiota Children rural infections

鼻腔菌群

鼻腔菌群结果如何影响婴儿期急性呼吸道感染

鼻腔菌群会调节局部免疫，从而影响呼吸道感染的发生发展。《Thorax》近期发表研究，纳入800余名健康婴儿，发现婴儿鼻腔菌群可以按照主要菌群类型分为5类，其中以莫拉克斯氏菌属为主的鼻腔菌群与发生消化道感染的风险相关。该结果提示莫拉克斯氏菌属可能是增加婴儿呼吸道感染及严重程度的因素。

鼻腔菌群呼吸道感染 Children Infant Lower respiratory tract infection

婴儿菌群

儿童口腔鼻咽部的菌群或揭示呼吸道感染发生

发表在《American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine》上的一个短篇报道提示，儿童在发生呼吸道感染之前一个月，其口腔鼻咽部菌群已有明显变化，并且这种变化规律呈现两者差异减少，并且在呼吸道感染过程中，鼻咽部菌群不断变化。文献报道这种规律同样在老年人中可以发现。菌群监测作为疾病发生风险的评估手段成为可能。

婴儿菌群 Microbiome nasal carriage 短篇报道婴儿

呼吸道感染

鼻咽和口腔的菌群差异丧失或增加呼吸道感染风险

《American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine》发表的一篇评论文章，简单阐述了婴幼儿呼吸道感染的母体和菌群因素，并围绕Man等人的研究（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1065415317）展开讨论，提出鼻咽和口腔间的菌群差异或影响呼吸道感染易感性。

呼吸道感染鼻咽部菌群 Microbiome nasal carriage

呼吸道感染

口腔与鼻咽部菌群差异与婴幼儿呼吸道感染

呼吸道感染鼻咽部菌群 child development respiratory microbiota

纯母乳喂养

中东战争地区报道：母乳喂养或能减少婴儿病原体感染风险

本文是Lancet增刊（《2018年巴勒斯坦被占领土研究》）上的一篇文章，简单报道了该地区前六个月纯母乳喂养的婴儿其胃肠道感染、呼吸道感染、中耳炎及尿道感染的比例均更低。注意到，战争地区的生活条件艰苦，众多感染疾病的发病率较高，而母乳喂养能够有效降低新生儿的感染性疾病。该研究结果提示，提高该地区的新生儿健康状况的一项“经济有效”的措施是：保障母乳喂养条件。

纯母乳喂养加沙地区战争地区婴儿感染性疾病

真菌感染

Cell：抗真菌Th17，是敌是友均由白色念珠菌决定？

辅助T细胞17（Th17）的功能是双刃剑，一方面起到免疫保护作用，但也可能与免疫相关病理有关。《Cell》近期发表研究，发现白色念珠菌是诱导人体（Th17 ）的主要致病共生菌，而且Th17 在不同感染状况下确实表现出免疫或促炎两种作用。本文结果对探究Th17的功能、研究人体炎症病因及机理具有参考价值。

真菌感染真菌-免疫互作白色念珠菌 microbiota anti-fungal immunity

宏基因组

复旦大学中山医院：宏基因组测序用于临床检测时的性能分析

本文介绍了复旦大学附属中山医院胡必杰团队将宏基因组测序技术用于临床病原检测上的实践经验。这些经验提示，宏基因组测序技术总体上显著优于传统的微生物学方法，是未来有望取代后者的传染病检测新技术。

宏基因组病原检测宏基因组测序细菌培养法呼吸道感染

毛细支气管炎

婴儿毛细支气管炎特征，与后续幼儿喘息风险相关

Journal of Allergy and Clinical Immunology近期发表一项前瞻性队列研究，通过聚类分析对1岁内患毛细支气管炎（BC）的婴儿进行分类，首次分析BC类别、鼻咽菌群和免疫因子与3随时发展为反复喘息（RW）的关联，为BC的鉴别分类、跟踪治疗、避其发展成RW提供新的研究方向。

Asthma Cluster Analysis respiratory syncytial virus Respiratory infections Rhinovirus

低聚乳糖

Nutrients：配方奶粉中添加低聚乳糖/聚葡萄糖，或可减少过敏高危婴儿的呼吸道感染

在婴儿配方奶粉中添加益生元（低聚乳糖/聚葡萄糖），可显著降低过敏高危婴儿的呼吸道感染，且可改善婴儿的肠道菌群。但要注意，配方奶粉+益生元，仍不可替代母乳喂养的作用。

低聚乳糖聚葡萄糖益生元婴儿配方奶粉呼吸道感染

假白喉棒状杆菌

FM：假白喉棒状杆菌，潜在的呼吸道益生菌？

这是较为少见的分析特定菌株作为呼吸道益生菌潜力的研究，值得特别关注！

假白喉棒状杆菌合胞病毒肺炎链球菌呼吸道感染

呼吸道感染

AJRCCM：鼻咽菌群是呼吸道感染的预言家？

这是介绍我们之前分享的一项呼吸道菌群研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1083264260）的小文章，没有图，但老规矩，值得特别推荐读一读！

呼吸道感染鼻咽菌群 airway Microbiome Respiratory disease

呼吸道感染

JAMA：精确检出病毒，并不总是呼吸道感染儿童的必需！

呼吸道感染 Ana S Luis Jonathon Briggs Xiaoyang Zhang D Wade Abbott

呼吸道菌群

AJRCCM：婴儿呼吸道菌群的成熟受何因素影响？

American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine[IF：13.204]上关于婴儿呼吸道菌群发育和成熟的重要研究，特别推荐。

呼吸道菌群风险因素呼吸道感染 development Nasopharynx

猪

兽医微生物学：在猪呼吸道疾病中，菌群的作用（综述）

关于菌群在猪的呼吸道疾病中作用的综述，关注畜牧业相关菌群的人可以重点看看。

猪呼吸道感染猪繁殖与呼吸综合征病毒 Swine Microbiome

益生菌消费

PLoS One：益生菌对呼吸道感染的临床和经济影响

① 使用益生菌可预防呼吸道感染（RTI）；② 采用微观模拟分析模型和相关数据库及文献资料，评估加拿大人群中使用益生菌对RTI发作和天数，以及抗生素剂量和缺勤天数的影响，从医疗支付和生产率的角度估算相应的经济影响；③ 使用益生菌可节省RTI天数，减少抗生素使用量和病假天数；④ 相应成本的投入费用减少额占到医疗支付中1.3-8.9百万美元，生产总值中61.2-99.7百万美元；⑤ 表明益生菌减少RTI相关事件的潜力，可能对加拿大有一个实质性的临床和经济影响。

益生菌消费呼吸道感染微观模拟分析模型医疗支付经济影响

哮喘

AFM：益生菌不能减少哮喘患者的抗生素使用

在冬季，哮喘患者容易受到呼吸道感染的困扰，口服益生菌可否降低这其中需要的抗生素使用呢？在英国的1300余人的RCT，发现口服益生菌并不会对呼吸道感染、哮喘加重以及抗生素处方减少有影响。

哮喘随机对照实验口服益生菌呼吸道感染抗生素使用

益生菌

Medicine：益生菌帮助预防儿童呼吸道感染？

① 系统性回顾共23个包含了6269名（新生-18岁）儿童的随机对照试验，对益生菌在儿童呼吸道感染的疗效进行meta分析；② 结果显示益生菌显著降低了至少有过一次呼吸道感染的儿童的数量；③ 服用益生菌的儿童呼吸道感染天数、由于感染而请假的天数均显著低于安慰剂组；④ 然而，服用益生菌或安慰剂的儿童疾病发作时间并无显著差异。（MC特别说明：益生菌功能是菌株特异性的，非本研究所用菌株声称本文提及的功能，不是不严谨就是伪科学！）

益生菌随机对照试验呼吸道感染宏基因组数据分析 Tamas Dolowschiak

鼻咽微生物

Cell子刊：婴儿鼻咽菌群直接影响呼吸道疾病严重程度

科学家通过分析孩子鼻咽微生物的组成，发现：① 婴儿的鼻咽微生物的组成不太复杂，由6个属组成；② 具体由哪些种类构成它们，决定了孩子是否容易被感染以及感染的严重性；③ 早期链球菌的定殖与哮喘风险的增加有关；④ 抗生素的使用会干扰微生物的定殖。

鼻咽微生物链球菌呼吸道感染哮喘 Katrine Whiteson