Phillip B Pope

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Phillip B Pope

文章数：8篇

多组学分析

国内团队：多组学分析揭示梅花鹿早期生命发育的代谢适应性

反刍动物的胃肠道（GIT）微生物组及其代谢反应，极大地影响了宿主的代谢和生长。然而，对宿主-微生物组在生命早期的关键发育阶段影响尚不清楚。Microbiome近期发表的来自吉林农业大学李志鹏团队+西北工业大学邱强团队+挪威科学家的研究成果，提出了一种综合的多组学方法，同时解决了梅花鹿（Cervus nippon）在三个关键的早期生命阶段的五个GIT区域的微生物群的分类和功能属性，以及肝脏、肌肉、尿液和血清的代谢特征，为GIT微生物组和反刍动物早期代谢生长下的相关机制提供了一个全面的观点。

多组学分析代谢组学梅花鹿生命早期

Nature子刊：食品添加剂黄原胶对肠道菌群有何影响

食品添加剂黄原胶是一种具有独特流变学特性的复杂多糖，在加工食品中被广泛用作稳定剂和增稠剂。目前尚不清楚黄原胶对人肠道菌群会有什么影响。Nature Microbiology近期发表的这项研究对这一问题进行了探索，发现人肠道中的一种瘤胃球菌可分解黄原胶，产生的寡糖可被另一种肠菌利用。参与消化黄原胶的细菌基因在工业化人群中广泛存在，但在原始部落人群中没有，也为黄原胶对人肠道菌群的影响提供了佐证。

黄原胶肠道菌群食品添加剂

反刍动物胃肠道菌群

毛胜勇等：反刍动物全消化道微生物组基因集+1万个MAG

胃肠道菌群在反刍动物的健康中有重要作用，但此前研究大多聚焦瘤胃菌群，而忽略了反刍动物胃肠道其他区域的菌群。Microbiome近期发表了南京农业大学毛胜勇、吉林农业大学李志鹏、西北工业大学邱强、中科院亚热带农业生态研究所王敏与团队的研究，通过宏基因组分析，首次构建了反刍动物全消化道微生物基因集，获得了超过10000个宏基因组组装基因组（MAG），鉴定出近9000种潜在的新细菌和古菌，大幅扩充了对反刍动物全消化道菌群的认知，为深入研究胃肠道菌群对反刍动物健康和生产的影响提供了重要资源。

反刍动物胃肠道菌群宏基因组组装基因组

菌群导向性食物

Nature子刊：膳食纤维如何精准调控肠道微生物组

Nature Communications上发表的文章基于菌群导向性食物（MFD）的概念，从挪威云杉中提取加工得到乙酰化半乳葡甘露聚糖（AcGGM），靶向调节肠道产丁酸菌特有的甘露糖降解酶活性。文章采用断奶仔猪作为模型，28天内不同时间点、多个肠道位点采样，实验设计精良、数据分析全面、逻辑连贯，非常值得一读。

菌群导向性食物断奶仔猪肠道微生物膳食纤维研究论文

β-甘露聚糖

Nature子刊：β-甘露聚糖的主力分解者Roseburia intestinalis

β-甘露聚糖广泛分布于植物性食物中。《Nature Communications》近期发表研究，应用多组学和酶学发现了并证实了罗氏弧菌Roseburia intestinalis在分解β-甘露聚糖中的主导作用，提示β-甘露聚糖有望用于靶向性促进有益细菌的生长，对开发膳食干预手段、益生菌和益生元产品均有参考价值。

β-甘露聚糖蛋白组学转录组学 Roseburia intestinalis β-甘露聚糖

瘤胃微生物

Nature子刊：驼鹿瘤胃菌群通过互营养谱写碳代谢乐章

瘤胃菌群具有很强的植物多糖降解与利用能力。多组学分析发现，在驼鹿瘤胃菌群中，主要参与植物多糖碳代谢的物种来自于拟杆菌门，编码了 91% 的糖苷水解酶基因。特别是该门下所属的 RC9 肠道菌群体和普氏菌属微生物编码了一半以上的多聚糖利用位点。不同物种之间团结协作，最终完成了分解植物纤维的任务。

瘤胃微生物瘤胃代谢瘤胃病毒宏基因组宏蛋白组学

肠道菌群功能

上海生科院等：白蚁肠道菌群如何适应食木饮食

中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所黄勇平团队等的最新研究在ISME Journal发表，揭示了降解木质食物的白蚁肠道菌群的功能特征，发现了多种与降解植物细胞壁多糖相关的酶，值得关注。

肠道菌群功能白蚁 Jennifer L Gommerman Conglei Li

土壤病毒组

Nature子刊：土壤病毒组影响碳循环

土壤病毒组影响土壤细菌的动态变化、代谢状况和生化功能。本文通过研究永久冻土不同解冻层次中病毒组信息，发现土壤病毒组不仅影响细菌宿主对气候变化的适应性，并可能通过编码特定酶直接参与对碳循环的调节，从而影响土壤细菌在气候调节中的作用，对研究微生物与气候变化的关系具有参考价值，值得专业人士关注。

土壤病毒组碳循环土壤细菌气候变化 Heinrich Jasper