Seth Rakoff-Nahoum

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Seth Rakoff-Nahoum

文章数：9篇

Nature子刊：阴道菌群维持，淀粉酶起大作用！

发表在《Nature Microbiology》上的一项系统性的研究表明，阴道中存在至少6种来自细菌的支链淀粉酶，这种淀粉酶的存在可以使包括卷曲乳酸杆菌在内的阴道各种微生物分解糖原，维持阴道菌群结构。

阴道菌群淀粉酶糖原降解

人体器官芯片技术助力阴道菌群研究

虽然人体阴道菌群结构相对简单，但是目前还没有很好的模型能够复现人体的阴道菌群微环境，限制了阴道炎相关药物的研发和阴道上皮-菌群相互作用的机制研究。近年来，随着人体器官芯片技术的快速发展，借助器官模型开展菌群研究成为热点。本研究基于此，开发了阴道器官芯片，并借助该系统诠释了其在卷曲乳杆菌、阴道加德纳菌定植时菌群-宿主的相互作用。

阴道菌群研究论文器官芯片阴道微环境

Cell子刊：一文速览肠道菌群（综述）

在过去的二十年里，我们对肠道菌群的了解几乎呈指数级增长。近日，Current Biology发表关于肠道菌群的最新综述，重点讨论了肠道菌群影响宿主的基本机制，以及肠道菌群的组成是环境因素、亲代遗传、饮食、宿主/微生物与微生物互作等因素共同作用的结果，并从进化生物学、人类健康角度做了展望。总之，该综述为未来推动肠道菌群相关领域向前发展提供了参考。

肠道菌群宿主微生物互作综述基础研究

Cell：饮食和菌群代谢物如何影响肠菌？从糖和丁酸的互作窥视冰山一角

肠道环境中的各种化学物质，比如饮食成分和代谢产物，都可影响肠道菌群的组成。这些物质如何塑造菌群，目前仍有很多未知。Cell发表的一项最新研究，揭示了糖和菌群代谢物丁酸对常见的肠道拟杆菌生长的影响。该研究表明，拟杆菌菌种/菌株的生长适性是一种基于糖和丁酸相互作用的涌现性质（emergent property），无法通过单一因素的作用来直接预测。拟杆菌对丁酸的抵抗/敏感性，与细菌在特定环境下（如可用糖的种类）的酰基辅酶A代谢状态有关，丁酰辅酶A的积累可能介导了丁酸对拟杆菌的毒性作用。在遗传层面，拟杆菌的酰基辅酶A酶的遗传变异，影响其对丁酸的抵抗能力。总之，该研究揭示了饮食和菌群代谢物对特定肠菌生长适性的复杂作用，强调了不能通过逐个研究单一因素再将其进行加和的方法来推断多因素共同作用对肠菌的影响。

肠道菌群丁酸饮食糖拟杆菌

早产儿肠道菌群发育

Nature：微生物之间的相互作用如何驱动早产儿肠道菌群的演变？

早产儿的肠道菌群的发育轨迹是可预测的：先锋菌群首先在肠内定植，随后是有序的不同微生物的演替变化。环境和宿主因素以及微生物之间的相互作用，都可能影响菌群的动态变化，但这些因素在肠道菌群发育中分别起什么作用尚不清楚。Nature最新发表的一项研究，通过定量测量178名早产儿出生1.5月内的肠道菌群中的细菌、真菌和古菌的绝对丰度的动态变化，结合生态模型以及体外和体内验证实验，揭示了在相对丰度研究中被掩盖的肠道菌群演变特征及其背后的生态学驱动因素，并揭示了微生态系统与宏观生态系统在群落组装规律上的相似性。

早产儿肠道菌群发育生态学绝对丰度微生物生态学

菌群内互作

肠道菌群内部互作方式和研究方法（小综述）

研究肠道菌群的动态变化规律，需要了解菌群内部不同微生物之间的互作关系。《Current Biology》近期发表的一篇小综述，从生态学的角度，介绍了肠道菌群内互作的类型、相关研究进展和研究方法，非常值得专业人士关注。

菌群内互作生态学 Hui Wang Jianping Ye Ying Wang

Nature：肠道菌群是如何进行内部合作的？

最新nature，值得一看。

Nature：肠道菌群是如何进行内部合作的？

最新nature，值得一看。

肠道菌群合作进化拟杆菌菊粉

Cell子刊：细菌啊，上皮不是你想留，想留就能留！

① 宿主的上皮是微生物群落的重要界面，但宿主如何调控微生物群落的机制尚不清楚；② 文章提出假说：宿主利用不同的粘附分子对某些特定的微生物进行选择；③ 模拟计算预测，宿主介导的粘附可增加微生物的竞争优势，并为生长缓慢的物种创造生态避难所；④ 宿主分泌大量粘液等基质，能通过粘附将阳性选择转化为阴性选择，粘附是一个强大的机制，能积极或消极地选择微生物群落；⑤ 粘液聚糖和IgA分子可影响微生物的粘附。

宿主选择差异性粘附菌群