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qPCR
文章数:12篇
大脑微生物组
脱靶扩增或可导致帕金森患者脑部细菌检测假阳性
最近的研究表明,人类大脑存在微生物。这些微生物或与帕金森病(PD)和阿尔茨海默病(AD)中所见的神经炎症变化有关,或作为健康患者大脑样本中的大脑微生物组而存在。Microbiome最近发表的研究,通过检测健康和帕金森患者个体大脑不同区域微生物组成,及作为种间对照的小鼠大脑微生物组成,结果发现,没有证据支持帕金森病患者大脑中存在微生物组或细菌感染,检测到的细菌信号是由外源DNA污染和宿主DNA假阳性扩增引起的。
大脑微生物组
脱靶扩增
DNA污染
二代测序
16S rRNA 基因
尿道菌群
通过输尿管支架表面结垢研究尿道菌群
《Microbiome》近期发表研究,采用测序、qPCR、培养及显微镜多种方法,发现研究输尿管支架菌群特征,可以通过该菌群特征为患者分型,有助于确定有益菌群、探索泌尿系感染防治新方法。
尿道菌群
输尿管支架
biofilm
Cultivation-independent methods
Encrustation
儿童哮喘
特定肠道古菌与儿童哮喘风险相关
Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项研究发现,一种常见的肠道古菌Methanosphaera stadtmanae在儿童肠道菌群中存在与否,与儿童哮喘风险显著相关,提示肠道古菌可能在过敏的发生发展中起到调节作用。
儿童哮喘
Allergy
Archaea
Childhood Asthma
Cross-sectional
肠道古菌
肠道古菌与儿童健康
产甲烷古菌是肠道菌群的重要组成部分,但是目前对于其与儿童健康的研究并不常见。本研究主要关注2类具体菌属,M. smithii和M. stadtmanae,分析其与儿童哮喘的关系,为进一步揭示肠道古菌在健康中的作用提供思路。
肠道古菌
Allergy
Archaea
Childhood Asthma
Cross-sectional
粪菌移植
何种操作影响粪菌移植效率?
粪菌移植的有效性依赖于成功存活的微生物数量、多样性和功能。《EBioMedicine》近期发表研究,发现有氧操作和冻融会显著降低粪菌移植物的活性和菌群功能。该结果对指导粪菌移植操作、提高移植有效性有参考作用。
粪菌移植
Bacterial viability
Fecal microbiota transplantation
qPCR
Propidium monoazide
阴道菌群
体外受精结局可能和阴道菌群有关
体外受精(IVF)是辅助生殖技术中一种常见的手段。目前的高通量测序技术可以很好获得女性阴道中所有的菌群信息,但是相对的时间及经济成本较高。而qPCR技术相对成熟,可以半定量检测阴道中部分异常细菌的存在与否(如阴道加德纳菌、奇异菌属)。该研究提示,16S测序对IVF结局的预测并没有qPCR好,这给近年来大力推崇高通量测序的微生物研究界一个反思:可能阴道菌群的主要标志物就是乳酸菌和几种异常菌?根本没有必要做所有菌属的测序?期待未来有更多阴道菌群在临床上预测、治疗等方面实证性的研究。
阴道菌群
体外受精
不孕不育
qPCR
16S扩增子高通量测序
室内菌群
Microbiome:爬行时产生的飞尘影响婴儿接触的菌群
这是上周Microbiome[IF:8.496]发表的关于婴儿爬行时接触的呼吸带菌群的研究,发现该位置的空气中真菌和细菌水平远超成人呼吸带,菌群构成也存在差异,这说明什么目前还难下断论,家有小宝宝的人可能应该关注一下。
室内菌群
qPCR
16S rRNA
Infant exposure
Indoor microbial exposure
微生物生态
Microbiome:测序虽好但无法分辨细菌是死是活,怎么办?(综述)
这是一项非常重要的方法学综述,提出一个很重要的问题——用测序方法分析的微生物无法区分是死是活,那么有什么其他方法可以解决这个问题呢?好好看看这篇综述!
微生物生态
DNA sequencing
Flow cytometry
Infectivity
Live/dead
抗生素耐药基因
中科院土壤所:长期使用粪肥,土壤中耐药基因明显增加!
这是中科院南京土壤研究所林先贵教授和团队发表在JOURNAL OF HAZARDOUS MATERIALS[IF:6.065]的研究,对长期使用粪肥的土壤中的耐药基因进行分析,发现耐药基因有可能通过动物粪便传播到土壤中。很有意义的研究,特别推荐。
抗生素耐药基因
粪肥
Antibiotic resistance genes
Class 1 integron
Manure
qPCR
家庭微生物组:独栋住宅内的细菌有何特点?
研究家庭环境里的微生物,一直是菌群领域的热点,这篇文章,关注独栋住宅空气里的细菌多样性,很值得一读。
qPCR
bacteria
family residences
homes
microbial ecology
婴儿肠道菌群
PLoS One:什么因素塑造婴儿菌群?
一个实验设计很值得参考的研究,值得大家看一看。
婴儿肠道菌群
qPCR
RT qPCR
胎粪
分娩方式
肠道寄生虫
EJCMID:肠道里的寄生虫和细菌有什么关系?
有无寄生虫在肠道里,细菌组成和比例一样么?
肠道寄生虫
肠道细菌
qPCR