菌群代谢功能

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菌群代谢功能

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李后开+朱瑞新等：冠心病患者肠菌与机体代谢有何特征？

先前研究表明，肠道菌群失调与冠心病间存在密切的关系，但目前关于临床稳定性冠心病心绞痛患者（SCAD）的肠道菌群与机体代谢特征尚不完全清楚。近日，上海中医药大学李后开、同济大学朱瑞新、上海中医药大学张卫东、北京中医药大学附属东直门医院沈晓旭及团队在Microbiology Spectrum发表最新研究，纳入42名稳定性冠心病心绞痛患者（SCAD）和46名健康人，发现患者肠菌α多样性显著降低，29个物种丰度显著改变。此外，患者肠道中富集的Ralstonia Pickettii可能是其体内不饱和脂肪酸降低的重要原因。总之，该研究为探究SCAD形成的机制提供了新证据，值得关注。

冠心病肠道菌群研究论文基础研究菌群代谢功能

菌群分析方法

拉曼结合原位杂交实现单细胞水平菌群代谢分析

这是发表在PNAS上的一份工作，作者结合受激拉曼散射的优势进行单细胞稳定同位素探测以及双光子FISH，以高通量方式识别细胞，同时实现对胞内直径约为1µm的低浓度代谢物检测。该技术相较传统自发拉曼技术，具备通量高、成像速度快的优势。在原位跟踪人体肠道微生物的黏膜糖觅食相关行为时，作者发现黏膜糖代谢通常由拟杆菌门主导，但在岩藻糖代谢方面梭菌表现优于拟杆菌门。

菌群分析方法菌群代谢功能肠道菌群拉曼光谱单细胞水平

自闭症谱系障碍

王娟+康禹：新方法揭示自闭症肠道菌群的“新”问题

自闭症谱系障碍（ASD）与肠道菌群失调密切相关，但确切机制并不清楚。由于肠道菌群非常复杂、个体差异很大，对比疾病人群和健康人群的分析方法有时难以排除干扰去找到真正与疾病相关的菌群特征。北京大学医学部孤独症研究中心王娟、中科院北京基因组研究所康禹与团队在Science Advances发表的一项最新研究中，提出了一种“类配对”（quasi-paired）队列研究策略，能将原本的队列转化为配对队列，不仅控制了个体多样性，而且增加了统计功效。通过这种方法，他们挖掘出与ASD高度相关的菌群代谢功能特征，表明ASD患儿存在菌群解毒能力不足的问题，这可能造成了内/外源性毒素在体内的积累，从而导致发生ASD的一个主要病理变化——线粒体功能紊乱。此外，基于ASD相关微生物解毒酶的诊断模型可以较好的分辨出ASD患儿，并与ASD临床评分存在一定关联。这些发现阐释了肠道菌群在ASD发病机制中的一种新作用，提示旨在恢复菌群解毒功能的干预方法或能用于治疗ASD，该研究提出的类配对队列策略，对于进行疾病相关菌群研究也有重要参考意义。

自闭症谱系障碍肠道菌群菌群代谢功能解毒作用队列研究

肠道菌群的组成及代谢功能变化与帕金森病的进展相关

多项研究报道了帕金森病（PD）患者的肠道菌群变化，但菌群变化导致的功能性后果尚未明确。《BMC Biology》上发表的一项最新研究，对比分析了PD患者与对照的菌群组成及代谢功能差异，发现PD相关的特定菌群组成变化与疾病严重程度相关，特定的菌群代谢功能也与疾病表型相关，提示PD患者的菌群组成变化可造成菌群代谢功能的改变，从而影响宿主的代谢及疾病进展。

帕金森病 Computational modelling gut microbiome Metabolic modelling Parkinson’s disease

上海海洋大学：塑料微粒影响鱼类肠道功能

塑料微粒广泛存在于水体环境，易被水生动物如浮游生物、贝类和鱼类摄入并在体内聚集，不仅严重影响鱼类健康和生存，还会对深海的生态系统和吃鱼的人类健康造成负面影响。上海海洋大学的温彬和陈再忠团队发表在《Science of the Total Environment》上的一篇文章，以孔雀鱼为研究对象，探究了聚苯乙烯塑料微粒对鱼肠道功能和菌群组成的影响，表明长时间的塑料微粒暴露可降低鱼类的消化性能、诱导肠道免疫反应并导致肠道菌群失衡，加深了对塑料微粒毒性机理的理解。

环境健康 Microplastic microbiota dysbiosis Digestion Immunity

肠道菌群的组成及代谢与帕金森病患者的肠道健康相关

Movement Disorders上发表的一项横断面队列研究，对比分析了帕金森病患者与健康人的肠道菌群差异，发现患者的菌群组成及代谢功能均发生了显著变化，其中，血清中有害菌群蛋白水解产物的增加与患者的便秘症状密切相关。

帕金森病帕金森病横断面队列研究菌群代谢功能

秦满+陈峰等：牙菌斑菌群代谢能力与儿童龋齿有啥关系？

与菌群结构和组成相比，菌群代谢潜力或许能更好的反映疾病状态。Frontiers in Microbiology近期发表了来自北京大学附属口腔医院秦满团队与陈峰团队合作、田靖为第一作者的研究，主要分析了患龋儿童和健康儿童的牙菌斑菌群代谢单一碳源的能力差异，发现前者有更为广泛的代谢能力，包括能利用多种致龋碳源。该研究还表明，从口腔菌群代谢层面来区分患龋和无龋个体时，Biolog分析是一个潜在的有效工具。

儿童龋齿 childhood caries Oral microbiota Metabolism sole carbon source utilization

人体肠道微生物

探究人体肠道细菌和古菌共生的代谢基础

人类肠道微生物的组成非常复杂，其中大部分是细菌，还有一部分古菌。细菌Christensenellaceae（克里斯滕森菌科）和古菌Methabacteriaceae（甲烷短杆菌科）在人类肠道中广泛存在。这两个科的物种间相互作用以及它们对人体健康的影响尚不明确。《mBio》上发表的一项研究发现，由细菌C. minuta（小克里斯滕森菌）产生的氢气可作为古菌M. smithii（史氏甲烷短杆菌）产甲烷的底物，从而实现二者在肠道内的共生，且这种氢气的种间传递广泛存在于在低BMI人群中丰度较高的克里斯滕森菌科和甲烷短杆菌科之间，表明二者的肠道内共生可能对人体有一定健康作用。

人体肠道微生物共生 Human gut methanogens Microbiome