Athanasios Typas

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Athanasios Typas

文章数：13篇

Cell子刊：人肠道共生菌的转座子突变体文库Part II：应用（综述）

近期发表在Cell Reports上发表的这份综述文章延续同期综述文章，对人肠道共生菌的转座子突变体文库的应用进行了总结。作者主要对构建后的混合型文库和阵列型文库在体外和体内筛选的实验过程中的关键影响因素进行了讨论，同时详细讨论了体外筛选的实验结果与体内真实情况的关联性和可迁移性，体内筛选也面临着动物模型、复杂宿主因素如饮食、定植窗口期等的影响，需要注意体内和体外某些处理如抗生素处理的可翻译性，但也可能存在偏差，以及某些体内因素如免疫反应等可能很难被体外实验模拟。同时，文库产出丰富的数据集应向标准化以及开发共享方面发展，最终整合为细菌通用基因型-表型平台。

Cell子刊：人肠道共生菌的转座子突变体文库Part I：构建（综述）

近期发表在Cell Reports上发表的这份综述文章主要总结了随机Barcode转座子突变体在人类肠道共生菌上的应用，以及从文库构建到上机测序整个流程各步骤的技术方法和选择策略、优缺点等，对后续其他非模式菌株转座子突变体文库构建提供了详细全面的指南。

药物-菌群互作

Nature：抗生素伤害无辜肠菌，特定解毒剂或能保护

抗生素被用于对抗致病菌，但也会影响共生细菌，扰乱肠道菌群的组成，导致菌群失调和疾病。但不同种类的抗生素对不同肠道细菌的影响，仍然缺乏系统性研究。Nature最新发表的一项研究在前期工作（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1066456444）的基础上，进一步阐明了不同抗生素对肠道共生菌的活性谱，并鉴定出能减少抗生素对共生细菌“误伤”且不影响对致病菌效力的药物，为避免抗生素对肠道菌群造成不良影响提供了新策略。

药物-菌群互作抗生素肠道菌群

菌群-药物互作

Nature重磅：肠道细菌“吃”药，影响药物效果

药物与肠道菌群的相互作用是目前研究的一大热点。肠道菌群调节药物治疗效果的一个目前公认的主要机制，是菌群对药物的生物转化，而Nature最新发表的一项研究揭示了一种新的机制，即肠道细菌将药物积累在自身内。这种生物积累作用一方面直接减少了药物在人体内的生物利用度，另一方面也可通过改变细菌代谢来间接影响菌群组成。这一新机制的发现，扩展了人们对细菌-药物相互作用的认知，为进一步阐明菌群如何影响药物的个体化疗效和副作用带来新启示。

菌群-药物互作

新型抗生素研发

Cell：双重作用机制的新型广谱抗生素

面对抗生素耐药性的威胁，人们急需新型开发新型抗生素。《Cell》近期发表的一项研究，报道了一种具有双重作用机制的新型广谱抗生素，对革兰氏阳性和阴性菌均有强力杀灭作用，且不易产生耐药性。这种在单一化学分子骨架上集成多重抗菌机制的思路，或为未来的抗生素研发带来新启示。

新型抗生素研发 antibiotics broad spectrum Gram-negative pathogens Acinetobacter baumannii

肺炎链球菌

Cell子刊：感受态抑制剂阻止抗性基因传播

抗生素耐药性感染是全球公共卫生的主要威胁。某些用于治疗肺炎链球菌（Sp）感染的抗生素可促进其感受态形成和外源DNA摄取，从而加大了其成为多药耐药株的风险，因此亟需开发新的方法防止耐药性扩散。发表在Cell Host & Microbe的一项研究鉴定了一系列Sp感受态抑制剂，通过抑制细菌质子动力防止其感受态形成进而减少水平基因转移。研究表明，该作用方式与抗生素不同，细菌无法通过突变获得对感受态抑制剂的抗性。该研究为防止毒力因子和抗性基因的传播提供了新的策略。

肺炎链球菌感受态抑制剂 antibiotic resistance horizontal gene transfer Streptococcus pneumoniae

新型抗生素研发

Nature：靶向革兰氏阴性菌的新型抗生素

革兰氏阴性菌特殊的双层膜结构可以保护其抵御抗生素的渗入，研发靶向这类细菌的抗生素极具挑战性。Nature上发表的一项研究，从线虫的肠道共生菌中鉴定出可以克服这一障碍的化合物darobactin，这种潜在的新型抗生素似乎可以靶向革兰氏阴性菌外膜上的一种关键蛋白BamA，从而发挥抗菌作用。

新型抗生素研发革兰氏阴性菌 Nonghua Lu Heping Zhang Wenjun Liu

Nature子刊：膳食脂肪扰动小鼠肠道菌群的定植抵抗作用

菌群可帮助宿主抵抗致病菌定植，Nature Microbiology近期发表的一项研究表明，消化高脂食物引起的胆汁分泌，可削弱小鼠肠道菌群对鼠伤寒沙门氏菌的定植抵抗作用，而特定大肠杆菌也对胆盐有较好的耐受性，因而可与致病的沙门氏菌竞争，减少小鼠的肠道感染。这些发现对于研究致病菌-菌群-宿主之间的相互作用具有参考意义。

定植抵抗高脂饮食膳食纤维肠道感染鼠伤寒沙门氏菌

抗生素影响

Nature子刊：健康成人的肠道菌群对抗生素扰动有较强的恢复力

Nature Microbiology本周上线的一项重要研究表明，健康成年人的肠道菌群经短期广谱抗生素扰动后，整体上有较强的恢复能力，但也有少数潜在的有益菌种和菌株在半年后仍无法恢复，抗生素耐药基因的携带情况可影响细菌在恢复过程中的定植和生存。这些发现提示，健康成年人偶尔短期服用抗生素，应该不会对菌群造成明显的长期不良影响，但长期和经常性服用抗生素的后果，以及抗生素对儿童和老年人菌群的影响，仍需更多研究。

抗生素影响人体肠道菌群抗生素耐药基因

抗生素耐药性

Nature：药物联合制剂有望抵御抗生素耐药性

药物联合制剂可用于抗击抗生素耐药性细菌感染，但是联合制剂的抗菌功效缺乏研究，也很少用于临床。本研究通过检测79种有抗菌作用的化合物的近3000种组合和计量，发现抗菌药物/物质的相互作用中拮抗作用比协同作用更为普遍，而且药物/物质的抗菌机制、细胞靶点影响药物间相互作用模式。本研究对于开发窄谱抗菌药物、恢复抗生素有效性和控制抗生素耐药性均有参考价值，值得专业人士关注。

抗生素耐药性药物间相互作用联合用药 Christopher E Lawson Katherine D McMahon

肠道菌群体外培养

Nature子刊：96株肠道菌的体外培养和代谢分析

目前大部分可培养的肠道细菌只能生长在成分复杂、化学组成不明确的培养基中，大大限制了对菌群代谢的研究。本周Nature Microbiology上线的一项研究，分析了96株肠道菌在19种培养基中的生长代谢特性，为用体外实验和计算机建模研究菌群代谢，拓宽了道路。

肠道菌群体外培养细菌代谢细菌生理学 Bacterial physiology Bacterial techniques and applications

非抗生素类药物

Nature: 非抗生素药物同样影响肠道细菌

Nature[IF：40.137]发表研究指出，以人体结构作为靶位的非抗生素类药物，其对肠道细菌可产生类似抗生素的抑菌效应，指示这些药物的胃肠道副作用很可能源于对肠道细菌的影响。非抗生素药物的抑菌效应，暗示细菌存在广谱的耐药机制，很可能是抗生素耐药性积累的风险因素之一。该研究对于控制药物副作用、拓展药物运用范围和管控抗生素耐药性具有重要参考价值，值得专业人士关注。

非抗生素类药物抑菌副作用肠道细菌 Non-antibiotic drugs Antibiotic-like side effects

药物-菌群互作

COM：如何系统性研究药物对肠道菌群的影响（综述）

这是Current Opinion in Microbiology[IF：6.635]发表的系统性介绍药物如何影响肠道菌群以及如何研究相关机制的重要综述，干货很多，能给人的启发也很多，值得好好看看。

药物-菌群互作 Francesco D'Aiuto John E Deanfield Nikos Donos