Aspen T Reese

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文章数：5篇

利用DNA元编码评估人类饮食

文章提出基于人体粪便样本，利用DNA元编码评估人类饮食中的植物成分的可行性。这或许也意味着，类似的方案也可以用于评估人类膳食中的动物和菌类成分。

DNA元编码膳食成分 Prasenjit Dey Aftab Alam

营养与健康

Nature子刊：氮源或为哺乳动物大肠菌群的主要限制因素

养分是调控微生物群落的基本因素之一，而大肠作为消化道的最末端的一个消化器官，是肠道菌群的主要集聚地之一。宿主饮食对大肠菌群的主要影响因素在于什么地方呢？答案是氮源，即食物中蛋白质的含量。

营养与健康蛋白质限制 Mingyao Liu Bing Du Chengfei Zhang

利用机器学习模型预测霍乱弧菌易感性

霍乱是世界范围内的一个公共卫生问题，如今只是部分了解其感染的风险因素。本文前瞻性地研究了霍乱患者的家庭接触，以比较那些感染霍乱患者的人。使用基线肠道菌群数据构建了易感性的预测机器学习模型。鉴定了与霍乱弧菌易感性相关的菌群，并在体外测试了这些菌群与霍乱弧菌的相互作用。结果证实，异常肠道菌群是与霍乱弧菌易感性相关的宿主因子。

霍乱弧菌 Vibrio cholerae Microbiome machine learning 菌群

菌群变化影响肠道氧化还原动态

eLife上发表的一项最新研究，发现抗生素处理小鼠后不仅改变肠道菌群组成，同时引起肠道氧化还原电势的变化，而菌群组成趋于正常后，氧化还原电势也恢复。

抗生素氧化还原电势 antibiotics Gut microbiota Human

微生物多样性

ISME：城市化对微生物的影响貌似没有想象的严重

① 生物多样性受到栖息地大小和慢性干扰（压力）的限制，而城市绿地的生境规模往往会减少；② 对曼哈顿的小型道路中间带和大型公园中的细菌、真菌和蚂蚁群落进行分析；③ 中间带和公园的细菌物种丰度无显著差异，但群落组成差异显著；④ 蚂蚁群落的组成和丰度都有所不同，中间带的蚂蚁种类比公园少；⑤ 真菌的组成和丰度均无显著差异，但生境之间几乎没有共同的类群；⑥ 与大型生物相比，微生物的多样性和组成对生境斑块化或城市压力的敏感性较低。

微生物多样性城市化