城市化

古菌可算是肠道菌群中的"少数分子"，但在人体健康中也有不可忽视的作用。然而相较于细菌和真菌，目前仍缺乏对肠道古菌的研究。中山大学附属第六医院左涛和吴小剑、昆明医科大学第一附属医院缪应雷和曾仲，作为共同通讯作者在Microbiome发表最新研究，通过宏基因组测序，描述了不同地区和民族的健康中国人的肠道古菌组特征及其与环境和宿主因素的关系，强调了地域、城市化、民族和饮食对人肠道古菌组变异性的贡献，表明城市化对古菌的影响可能与人体健康有关。

肠道古菌组地域民族城市化饮食

城市化

城市化下野生动物和人肠道菌群的趋同演化

城市化菌群的人源化研究论文

中国人菌群

陈卫+李明锟+陆文伟：主食、民族、城市化等因素如何影响中国人的肠道菌群

江南大学的陈卫院士、陆文伟和中国科学院北京基因组研究所李明锟与团队在NPJ Biofilms and Microbiomes上发表的一项最新研究，对我国不同地区、不同民族的2678名健康志愿者的粪便菌群进行分析，同时收集记录地理、人口、饮食、城市化、生活方式和采样月份等信息，鉴定出了中国人群肠道菌群的4种肠型，并分析了地理区域、主食类型及城市化等不同因素对肠道菌群的影响。

中国人菌群研究论文基础研究城市化饮食

环境菌群

国内团队：学校室内菌群或影响学生的哮喘和鼻炎等风险

来自发达国家的研究揭示，城市化及室内菌群暴露与哮喘及鼻炎的风险增加相关。华南农业大学的孙峪团队、邓诣群团队与复旦大学的赵卓慧团队在Microbiome上发表的一项最新研究，随机选取了山西的9所城市或农村的高中，并收集了1332名高中学生的数据，发现与发达国家相似，城市学校中的哮鸣和鼻炎患病率也显著高于农村学校。另外，城市学校与农村学校的室内菌群组成存在显著差异，城市学校中的潜在病原体富集，而农村学校中的短链脂肪酸（在炎症疾病中可能起到保护性作用）代谢基因与通路富集。同时，该研究鉴定出了与哮喘、鼻炎及鼻结膜炎相关的特定细菌及寄生虫。

环境菌群研究论文基础研究哮喘鼻结膜炎

城市化

Nature子刊：城市化相关的饮食及代谢变化促进炎症

Nature Immunology上发表的一项队列研究结果，对比了323名健康坦桑尼亚人（253名城市居民、70名乡村居民）的免疫及代谢表型，发现城市生活与促炎免疫表型相关，而食物源性及内源性代谢产物的差异可解释城市居民与乡村居民在炎症应答上的差异。

城市化研究论文队列研究炎症

菌群-免疫互作

城市化相关菌群变化可能增加婴儿的特应性疾病风险

菌群-免疫互作特应性疾病研究论文基础研究婴儿

肠道DNA病毒组

Cell子刊：国内团队绘制人类肠道DNA病毒组图谱

香港中文大学的Siew C. Ng和昆明医科大学的Yinglei Miao合作在Cell Host and Microbe发表文章，绘制了中国人群的肠道DNA病毒组图谱，揭示了基于群体的变异以及宿主和环境因素在人类肠道DNA病毒组形成过程中的重要性。

肠道DNA病毒组 Virome metadata Diet metacommunity

城市化

Nature子刊：城市化如何影响家庭中的化学物质和微生物群落？

城市化进程对人类的文化和健康都有巨大影响。Nature Microbiology近期发表的一项研究，通过代谢组学和测序分析，评估了城市化对房屋和人体的化学物质暴露和包括细菌、真菌和微真核生物（如：单细胞寄生虫）在内的微生物群落的影响，以及化学物质暴露与微生物群变化的关系。该研究重点分析了真菌群落组成和多样性的变化，发现化学制剂（如清洁剂、抗菌剂）的使用与城市化相关的微生物群改变和室内真菌多样性的增加有关。

城市化环境菌群微生物组人体菌群 Juan José Alba-Linares

空气菌群

中科院城环所苏建强团队：厦门周边空气菌群的季节性和地区性差异

中科院城环所苏建强研究员日前发表了对厦门周边空气中微生物组的研究结果，发现空气菌群随季节变化，且具有城乡差异。

空气菌群环境科学 16S扩增子高通量测序空气污染空气病原体

炎症性肠病

IBD发病率与人口密度、城市化及GDP相关

American Journal of Gastroenterology上发表的一项在13个亚太国家或地区中进行的前瞻性人群研究的结果，发现在人口稠密的区域，或是城市化程度更高的区域，IBD发病率更高。值得注意的是，在中国，GDP与IBD发病率呈正相关。

炎症性肠病炎症性肠病城市化人口密度人群研究

城市化

Cell子刊：城市化对婴儿与成人肠道菌群的影响

城市化

炎症性肠病

Nature Reviews：一文读懂城市化如何影响菌群和炎性肠病

发展中国家的快速城市化伴随着炎症性肠病（IBD）发病率上升。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology近期发表了香港中文大学团队主笔的观点性综述，对比了肠道菌群的城乡差异，详细探讨了城市化进程中多种因素对城市居民肠道菌群的影响，及其与IBD风险和病理的关联。干货极多，推荐专业人士关注。

炎症性肠病城市化肠道菌群饮食抗生素

卫生假说

FM：环境“脏”一点，对肠道健康有好处？

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]最近发出的一篇观点文章，较为系统地阐述了环境因素对于人体肠道微生态系统建立的影响，介绍了对比原始部落、农场与城市人群的肠道菌群多样性和慢性疾病发生之间联系的研究，并对未来拓展环境与微生态相关研究做了展望。非常值得细读，强烈推荐！

卫生假说老朋友假说城市化 Fredrik Bäckhed Kassem Makki

城市化

Microbiome：城市化，让中国人的菌群西化

这是一堆美国人为了研究发展中国家的城市化如何对人体肠道菌群进行影响的文献，发现城市化中的中国人的肠道菌群，正在“西化”，变得不健康，毒性和耐药基因增加。很值得关注和警惕的现象，特别推荐。

城市化耐药基因毒性基因

城市化

COES：城市化到底如何影响人类健康？（综述）

这是一篇很有意义的文章，系统性介绍了城市化和城市生活对人类健康的影响。强烈推荐感兴趣的人好好看看。

城市化城市环境 Justin CY Wu Justin CY Wu

城市化

Lancet子刊：警惕低质量饮食带给贫困人口的慢性病

现如今，在这世界上很多地方，肉比菜贵，很多低收入人群可以吃到很多肉，但这样的饮食一般不太健康。Lancet子刊上这篇文章特别关注于此，很有意义，特别推荐认真阅读。

城市化贫富差距非传染性疾病 David T Riglar Pamela A Silver

微生物多样性

ISME：城市化对微生物的影响貌似没有想象的严重

① 生物多样性受到栖息地大小和慢性干扰（压力）的限制，而城市绿地的生境规模往往会减少；② 对曼哈顿的小型道路中间带和大型公园中的细菌、真菌和蚂蚁群落进行分析；③ 中间带和公园的细菌物种丰度无显著差异，但群落组成差异显著；④ 蚂蚁群落的组成和丰度都有所不同，中间带的蚂蚁种类比公园少；⑤ 真菌的组成和丰度均无显著差异，但生境之间几乎没有共同的类群；⑥ 与大型生物相比，微生物的多样性和组成对生境斑块化或城市压力的敏感性较低。

微生物多样性城市化