宿主基因组

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宿主基因组

文章数：7篇

微生物代谢物

中科院动物所：盲肠微生物来源的SCFA与宿主遗传对肉鸡饲料效率有何影响？

提高饲料效率是现代动物生产最重要的目标。控制饲料效率性状的调控机制极其复杂，短链脂肪酸（SCFA）作为微生物群的重要代谢物，可用于改善宿主遗传学和肠道微生物群的综合效应。然而，SCFA与肠道微生物群和调节饲料效率的宿主遗传学间的关系尚不清楚。近日，中科院动物所赵桂苹及团队在Microbiome发表最新研究，盲肠的克里斯滕森菌科被确定为代表性类群，有助于宿主遗传学和SCFA对鸡饲料效率的综合影响，值得关注。

微生物代谢物饲料效率研究论文基础研究 SCFAs

中外合作：宿主基因组和肠道微生物组之间的相互作用增加精神疾病风险

人类肠道微生物群与精神疾病具有相关性。基于微生物组的遗传性，对人类基因组和肠道微生物组的全基因组关联研究（mbGWAS）揭示了重要的宿主-微生物组相互作用。然而，由于先前对mbGWAS的研究样本量不足，在特定肠道微生物组特征和心理状况之间建立因果关系仍然具有挑战性。四川大学的王强和美国的Gui Hongsheng合作在Brain Behavior and Immunity发表文章，开发出新的统计遗传学策略，可增强mbGWAS的能力，研究的遗传学发现为微生物群与精神疾病之间的生物学多效性和因果关系提供了新的见解。

精神疾病宿主基因组肠道微生物组

宿主基因组多态性

刘小敏+张涛+贾慧珏：基因决定口腔微生物组组成

人类口腔内有超过十亿的口腔微生物组，这些微生物不仅仅在口腔中发挥重要的作用。而且可以通过吞咽的方式进入消化道的其他位置，例如肠道，从而影响肠道微生物组，对人体的健康产生重要的影响。多个宏基因组研究均提示，口腔微生物组与风湿性关节炎、结肠癌、2型糖尿病等疾病有一定的关系。肠道微生物组的研究发现，人类遗传因素与肠道微生物组组成具有相关性。但是，高度动态变化的口腔微生物组是否也与宿主遗传因素具有一定的相关性呢？这一问题目前尚没有证据证明。近期深圳华大生命科学研究院刘小敏、张涛和贾慧珏作为共同通讯作者，在Cell Discovery上发表的最新工作，首次通过大样品基因组测序探索了宿主基因组对口腔微生物的影响，发现了5个影响口腔微生物组的显著性位点，并应用人工智能学习的方法探索了基因组和微生物对牙周疾病的预测性能，取得了较好的结果。

宿主基因组多态性宏基因组关联分析 miRNA 机器学习口腔菌群

宿主基因组

Science子刊: 长期除草剂诱导选择下的宿主基因组与微生物组的共适应

物种分化以及物种分化的因素一直是生命领域备受关注的科学问题。作者用实验进化的方法验证了宿主基因组-宿主微生物组共进化。为此，作者将丽蝇蛹集金小蜂（Nasonia vitripennis）暴露于广泛使用的除草剂莠去津（atrazine），长达85代。研究结果表明，莠去津暴露不仅介导了微生物组内的适应性变化，赋予了宿主对莠去津毒性的抗性，而且还对宿主基因组施加了选择性压力，并改变了宿主基因的表达和免疫反应。此外，微生物组移植实验显示，暴露于莠去津的对照组成虫的存活率有降低，而在移植组中并未发生降低。这些结果表明，杀虫剂导的选择介导的宿主-微生物组适应，最终导致新的宿主基因组-微生物组的平衡。

宿主基因组宿主微生物组共进化莠去津选择压力

宿主基因组诱导肠道菌群改变，进而影响表型

多项研究显示，肠道菌群组成在塑造哺乳动物脂肪沉积过程中具有重要作用。也有研究显示，宿主基因组可影响构成肠道微生物群的某些物种的丰度。Computational and Structural Biotechnology Journal近期发表的文章，通过研究猪的脂肪沉积，阐释了宿主基因组如何通过诱导肠道菌群的改变而影响表型性状，进而导致表型的改变。

肥胖肠道菌群宿主基因组

FM：宿主基因如何影响菌群？（综述）

最近肠道菌群研究领域最火的方向莫过于宿主基因如何影响肠道菌群，这篇综述发表的时间节点也很巧，值得好好看一看。

GWAS 共进化宿主基因组共生细菌基因组 Christos Giatsis

宿主基因组

Nature Genetics：人的基因组与肠道菌群组成有何关联？

Nature Genetics上另一篇最新online的文章，在1098个实验对象中鉴定出与33个细菌分类群丰度相关的58个宿主SNP，并在另外463个实验对象中重复出了其中4个SNP，这4个SNP分别与毛螺菌属等4个属的细菌相关。结合另一篇文献看，我们或许可以这么下结论：人肠道里长什么细菌，至少有一部分是自己的基因决定的。

宿主基因组肠道菌群 Peter S Jørgensen Ramanan Laxminarayan