Rodolphe Barrangou

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Rodolphe Barrangou

文章数：11篇

胆盐水解酶

Nature子刊：揭示乳酸杆菌改变胆汁酸组成分布促进定植抗性的新机制

胆汁酸（BA）介导宿主与微生物之间的互作，影响艰难梭菌感染机体。已知胆盐水解酶（BSH）通过对结合胆汁酸去结合改变BA库，但其结构选择性，以及对艰难梭菌的影响尚未可知。Nature Microbiology发表的文章对此进行了探讨。

胆盐水解酶艰难梭菌研究论文

PNAS：双歧杆菌的基因组和表观遗传学，共同影响CRISPR的基因组编辑结果

双歧杆菌是人肠道中普遍存在的一种共生细菌属，与人体健康密切相关。PNAS发表的文章，利用内源性I-G型CRISPR-Cas系统，并采用外源性CRISPR碱基编辑器进行乳双歧杆菌的基因组工程，证明基因组和外源性背景都会驱动不同菌株的编辑结果。本研究结果提示，菌株间的变异会影响基因组编辑的部署，强调了为不同的细菌菌株开发个性化的基于CRISPR的基因组工程方法的必要性。

CRISPR 双歧杆菌表观遗传学 B. animalis subsp. lactis Bifidobacterium longum subsp. Infantis

胆盐水解酶

益生菌适应性：乳酸杆菌编码胆盐水解酶为哪般？

初级胆酸来源于宿主，在代谢过程中经过肠道与菌群互作生成次级胆酸。在这个过程中，肠道共生菌编码胆盐水解酶（BSHs）起到关键作用。PNAS发表文章，从肠道环境如何选择细菌的角度，阐述了益生菌乳酸杆菌拥有相对的BSHs多样性，因而影响其适应性和定植能力。

胆盐水解酶乳酸杆菌研究论文

嗜酸乳杆菌在宿主肠内时，双方的基因表达有何变化

嗜酸乳杆菌NCFM是一株被广泛应用的益生菌。mBio近期发表研究，通过双RNA-seq技术，对NCFM在小鼠肠道内时双方的基因表达变化以及NCFM的基因组稳定性进行了分析，为揭示其益生作用和机制提供了新证据。

益生菌嗜酸乳杆菌NCFM

全球食品供应链：如何革新？（综述）

该文章由Annual Review of Food Science and Technology编辑委员会主刀撰写。针对COVID-19疫情暴露的全球食品供应相关问题，比如供应链的弹性和稳固、食物的持续性生产与供应、食物与健康、食品安全等，文章分别给出了相应的革新和技术改革方案。其技术革新方案涉及农业生产、生物技术、生命科学、大数据、人工智能等各方面，值得相关人士阅读参考。

未来食品食品生产环境影响纳米技术基因编辑

CRISPR技术在食品工业中的应用（综述）

近年来，基于CRISPR的技术使基因组编辑相关领域产生了革命性的进展。Trends in Microbiology上发表的一篇综述文章，详细介绍了基于CRISPR的基因编辑技术在食品工业中的应用，包括：去除致病菌或腐败菌、增强发酵剂及益生菌等有益菌的活性等。

CRISPR food Microbiome 综述食品工业

CRISPR-Cas构建工程益生菌的机遇与挑战

《Current Opinion in Biotechnology》近期发表评论，讨论了CRISPR-Cas运用与构建工程乳酸杆菌、开发生物治疗手段的潜力和相关研究，同时指出了该技术的风险。对开发新型益生菌和基于乳酸杆菌的生物治疗手段具有参考价值。

益生菌转基因观点评论益生菌 CRISPR-Cas系统

使用菌群 CRISPR 间隔序列研究人病毒组（综述）

CRISPR-Cas 系统中的间隔序列是病毒感染后的印记，因此可以通过分析间隔序列来获得人体不同部位病毒组的管窥之见。在本综述中，作者分别总结分析了肠道、口腔、生殖道和皮肤等不同部位宏基因组中间隔序列暨病毒组的特征，值得相关研究人员参考。

病毒组 CRISPR-Cas systems CRISPR spacers Virome phages

mBio：嗜酸乳杆菌可帮助宿主吸收饮食中的植物糖苷

源于植物的化学物质中包括很多有保健功能和药用价值的成分，比如一些酚类和多酚类物质，这些物质在体内的生物活性和利用度受到肠道菌群的影响。近期发表在mBio[IF：6.956]的论文对肠道共生菌中的嗜酸乳杆菌代谢植物糖苷的机制进行了分析，或可为研究相关植物化学物质的药用机理带来启示，推荐专业人士搭配相关评论文章（http://www.xunludkp.com/papers/read/1034976146）共同阅读。

嗜酸乳杆菌

mBio：嗜酸乳杆菌可帮助宿主吸收饮食中的植物糖苷

源于植物的化学物质中包括很多有保健功能和药用价值的成分，比如一些酚类和多酚类物质，这些物质在体内的生物活性和利用度受到肠道菌群的影响。近期发表在mBio[IF：6.956]的论文对肠道共生菌中的嗜酸乳杆菌代谢植物糖苷的机制进行了分析，或可为研究相关植物化学物质的药用机理带来启示，推荐专业人士搭配相关评论文章（http://www.xunludkp.com/papers/read/1034976146）共同阅读。

嗜酸乳杆菌植物糖苷

功能基因组学

对213株乳杆菌及其相关菌属进行比较基因组学研究扩展乳酸杆菌的生物应用潜力

① 乳酸菌的代谢多样性、种属不明确、与其他重要的乳酸菌之间关系的不确定性，使得开发利用乳酸菌变得复杂，且乳酸菌催化的生物转化能力尚未开发；② 发布213株乳杆菌及其相关菌属的基因组序列，发现73个核心基因，描述修饰碳水化合物和蛋白质的编码基因目录；③ 乳酸杆菌有广泛且多样性的新CRISPR-Cas免疫系统，可用于基因编辑；④ 揭示乳酸杆菌在自然和工业环境的宿主相互作用因子和细菌素的系统基因组学分布，及工艺过程中承受压力的机制。

功能基因组学乳杆菌