Tong Zhang

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文章数：13篇

香港大学张彤 Nature子刊：基于组学的抗生素耐药基因风险评估框架

病原微生物的抗生素耐药性已经成为威胁人类健康的关键因素。抗生素耐药基因（ARGs）是微生物耐药的主要机制，ARGs广泛存在于自然界中，然而并不是所有的ARGs都会威胁公共健康。因此，如何有效识别和评价潜在的高风险ARGs对于人类有针对性的开展主动预防具有重要的意义。近期国内香港大学张彤团队在Nature子刊，Nature Communications上发表了他课题组最新的研究成果，他们基于组学的信息成功开发一套崭新的ARGs评估框架，该框架以抗性基因是否高度集中于与人类相关的环境中、在微生物种间的可转移性，以及在宿主（人类）内的可致病性为主要因素，将ARGs按照风险程度分成了四个级别，系统地评估了ARGs对人类所构成的风险。

风险评估评估框架抗生素耐药基因研究论文基础研究

港大张彤：多维宏组学方法协同揭示复杂细菌群落对目标底物代谢的菌间相互关系

香港大学张彤教授团队与北京大学余珂博士研究团队，以生物降解菌群为研究模型，运用多维宏组学方法（宏基因组、宏转录组及目标性代谢组学联合）解析混合微生物群落内细菌间协同代谢关系。本文建立了一个综合的多维宏组学的分析体系，成功解译BPA降解群落中微生物的代谢能力和相互作用。该论文所构建的多维宏组学分析流程不仅适用于环境工程体系中微生物相互关系的预测，同样对其他自然环境或肠道微生物菌间相互关系的研究有启示性作用。

细菌互作 BACTERIAL INTERACTIONS Biodegradation Bisphenol A Integrated meta-omics

污水处理厂或为细菌耐药性防控重点

污水处理厂是抗菌素耐受基因积累和传播的主要场所之一。本研究通过在12座瑞士污水处理厂采样，发现耐受基因丰度和种类受菌群结构、处理过程等多种因素影响，而且存在发生耐受基因大规模转移的可能，强调了需要在耐药基因检测中考虑基因转移以及宿主致病性，值得参考。

耐药基因污水处理厂基因水平转移 Guido Rindi Guido Rindi

宏基因组方法分析空气中的抗性基因

本研究发现，养殖场和污水处理厂的气溶胶中存在大量抗性基因，说明这些耐药基因池中的抗性基因或可释放到空气中传播。

抗性基因宏基因组

抗生素耐药基因

港大张彤等：追踪抗生素耐药性污染来源的新方法

追踪抗生素耐药性污染的来源，有利于进行针对性治理。Microbiome近期发表来自香港大学张彤团队的研究，结合抗生素耐药基因（ARG）宏基因组数据和机器学习方法，使追踪ARG污染来源成为可能，对治理ARG污染有重要意义。

抗生素耐药基因生物信息学工具机器学习

抗生素耐药性基因

华农大+港大：抗生素如何影响肉鸡的粪便菌群

抗生素使用在肉鸡养殖中非常普遍，可导致耐药菌增加。华南农业大学曾振灵教授和香港大学张彤教授，两个团队合作的相关研究近期发表于Microbiome[IF：8.496]。该研究分析了抗生素使用所致的肉鸡粪便菌群和其中耐药基因的变化，相关发现或许可供养鸡场专业人员参考，以优化对抗生素耐药菌感染的治疗方案。

抗生素耐药性基因抗生素肉鸡 Antibiotic resistance genes Bacterial community

抗生素耐药基因

清华深圳研究生院：中国城市中的垃圾渗滤液含有大量抗生素耐药基因

Water Research[IF：6.942]近期发表了清华深圳研究生院的文章，表明中国城市中垃圾渗滤液中存在大量抗生素耐药基因，不容忽视，值得关注。

抗生素耐药基因垃圾渗滤液

抗生素耐药基因

Bioinformatics：在宏基因组中分析ARG的新工具

如何快速地鉴定并分析宏基因组样本中的抗生素耐药基因，近期Bioinformatics[IF：7.307]发表的这篇文章介绍了一种新的在线分析工具，其中包含了一个结构化的抗生素耐药基因数据库，推荐专业人士阅读。

抗生素耐药基因隐马尔科夫模型宏基因组 Martin Laclaustra Martin Laclaustra

港大：宏基因组+菌株培养，揭示抗生素生物降解机理

磺胺类药物是常见的抗生素，其对环境造成的污染可促进相关耐药基因的传播。香港大学张彤教授团队，通过结合宏基因组学和菌株分离培养技术，鉴定并分离出活性污泥中可降解磺胺嘧啶的主要细菌，揭示其生物降解机制。该研究在近期的Environmental Science & Technology[IF：6.198]发表，或有助于开发出治理环境抗生素污染的生物降解技术，值得专业人士关注。

宏基因组降解抗生素菌群协作 J Alfredo Blakeley-Ruiz Robert L Hettich

生物地理学

北大倪晋仁院士等：长江流域的浮游及沉积菌群

这是北大环境科学与工程学院倪晋仁院士与香港大学张彤教授团队合作在Microbiome[IF：8.496]近期发表的对长江流域菌群的研究，首次分析了4300公里长江流域内浮游和沉积菌群的时空分布，值得关注。

生物地理学长江沉积物浮游生物 Bacterial communities

Microbiome：抗生素抗性基因在全球饮用水中普遍存在

这是香港大学研究团队近期在Microbiome上发表的对全球不同城市的饮用水样本中的抗生素抗性基因（耐药基因）的大样本量分析成果，结果很值得关注，尤其是发现中国河南省的相关基因丰度最高，一定程度显示了我国应对抗生素耐药性的严峻形势。

饮用水水平基因转移抗性组抗生素耐药基因 antibiotic resistome

FM：利用纳米孔测序技术定量分析城市污水中的抗性组

这是香港大学团队利用MinION纳米孔（Nanopore）测序技术定量分析污水处理厂中的大肠型细菌的耐药基因的研究，Nanopore正在蓬勃向前，从研究到转化应用，都会有很多惊喜，值得特别关注。

城市污水抗性组表型基因型 MinION纳米孔测序

抗生素耐药性

ISME：抗生素耐药与金属抗性基因的共同出现

环境中广泛传播的金属压力可能通过共同选择抗生素耐药性基因及金属抗性基因，促进抗生素耐药性的出现，这篇文章关注抗生素耐药与金属抗性基因的共同出现，值得读一读。

抗生素耐药性金属抗性 Alessandro Tanca Sergio Uzzau