Henrik Bjørn Nielsen

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Henrik Bjørn Nielsen

文章数：11篇

超重/肥胖女性孕早期代谢组与饮食、肠道菌群存在关联

本研究针对超重/肥胖的女性进行研究，发现了其饮食结构与血清代谢组、肠道菌群结构存在关联，为进一步研究超重/肥胖孕妇的干预策略提供了理论依据。

肠道菌群研究论文孕妇超重/肥胖孕妇代谢组学

全球微生物基因目录

Nature：复旦大学与多国合作构建全球微生物基因集并揭示其生物地理分布模式

复旦大学人类脑智能科学与技术研究院青年研究员路易斯·佩德罗·科埃略（Luis Pedro Coelho）、教授赵兴明、名誉教授皮尔·伯克（Peer Bork）与来自德国、西班牙、美国、英国等多国科学家合作研究，基于全球菌群的概念，将地球上不同栖息地的微生物作为统一系统，运用人工智能技术对1.3万个公开宏基因组样本进行挖掘，构建了迄今为止最全面的全球微生物基因集，为全球菌群研究迈出了重要一步。该研究同时发现，大多数基因具有栖息地特异性，跨越多栖息地的基因主要富集在抗生素耐药性基因和移动遗传元件。该研究对于理解抗生素抗性的产生，以及未来抗菌药物的研发具有重要的意义，对于理解微生物与人类健康的关系具有重要的作用，该研究将为地球生态研究和人类健康研究做出重要贡献。

全球微生物基因目录抗生素抗性基因可移动遗传元件栖息地特异性罕见基因

Cell 子刊：细菌传播策略如何影响人肠道菌的维持和进化？

人肠菌群之间不断地相互作用，并与我们的身体相互作用，进而影响我们的健康、免疫系统等，但人体肠道菌群是如何维持的呢？Cell Host and Microbe近期发表的文章，利用粪便样本宏基因组数据，研究了细菌持久性策略。结果发现人类肠道细菌有三种主要的传播策略：遗传持续性、空间持续性和顽强性传播策略（heredipersistent，spatiopersistent，and tenacious）。本研究结果有助于增加对不同的传播策略如何影响人类肠道微生物的长期持续，并对肠道菌群调节产生影响的认识。

传播策略肠道菌群

菌群-免疫互作

IgA缺陷者的肠道菌群失调

IgA缺陷可能导致复发性粘膜感染，可能与肠道菌群的变化相关。来自Gastroenterology上发表的一项最新研究，发现相比于IgA水平正常者，IgA缺陷者的肠道菌群多样性、组成及功能均显著改变，IgA缺陷者的肠道菌群有着更高的致病性及促炎性。另外，在部分IgA缺陷者的血清中可检测到IgA特异性IgG抗体，而这部分个体的肠道菌群失调更为明显。

菌群-免疫互作研究论文基础研究队列研究 IgA

变体自动编码器（VAMB）

Nature子刊：宏基因组的分箱和组装的新方法

丹麦哥本哈根大学Simon Rasmussen课题组的最新研究利用深度变体自动编码器（VAMB）改进了宏基因组的组装。该项研究成果发表在2021年1月4日出版的《自然-生物技术》上。其通过将宏基因组分箱与无监督的深度学习相结合，作者展示了在不同类型和大小的数据集上与最先进的方法相比的改进。他们的发现的重要性不局限于微生物组和宏基因组学领域，因为数据集成是许多生命科学研究领域的核心过程。通过跨多个组学数据集的数据集成，将大大提高精密医学领域的未来发现。

变体自动编码器（VAMB） k-mer 序列丰度平均核苷酸同一性（ANI）深度学习

益生菌干预

短双歧杆菌Bif195可改善阿司匹林引起的小肠损伤

小肠溃疡等肠道病变是阿司匹林等非甾体抗炎药的常见副作用，《Gastroenterology》发表的一项最新益生菌临床试验显示，服用短双歧杆菌Bif195可减轻长期低剂量阿司匹林引起的小肠损伤，具有临床转化应用价值，期待大规模临床试验对此进行验证。

益生菌干预 Aspirin bacteria bleeding microbiota

低谷蛋白饮食

Nature子刊：低麸质饮食怎样影响健康人的肠道菌群和代谢？

越来越多的人开始尝试低谷蛋白饮食，但其对健康人的影响尚未明确。Nature Communications上发表的一项最新研究，在60名健康中年人进行了一项随机对照交叉试验，发现低谷蛋白/麸质饮食可改变肠道菌群，减少氢气呼出量并改善腹胀，降低体重并减少炎症小体激活。

低谷蛋白饮食 Shahrad Taheri Hadeel Zaghloul Odette Chagoury

生物信息学工具

Nature子刊：带你玩转人微生物组和代谢组数据

本文介绍了一个曾被用于揭示肠道菌群在宿主胰岛素抵抗的背景下如何影响循环系统代谢物的数据挖掘方法。对应研究可参考此前日报中的报道：两种肠道细菌改变血清代谢组，增加糖尿病风险（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1095814020）。

生物信息学工具微生物组代谢组血液代谢组学 Ⅱ型糖尿病

Gut：全谷物可减重并缓解炎症，但不明显影响菌群

这是刚刚发表的一项随机交叉试验，对比了全谷物饮食和精细谷物饮食对有代谢综合征风险的参与者的影响，一定程度验证和说明了全谷物对身体的益处，值得关注的是，肠道菌群及其代谢产物、胰岛素敏感度等未发现明显变化。值得关注，特别推荐。

全谷物减肥炎症 COLONIC MICROFLORA Diet

血清代谢组学

Nature：两种肠道细菌改变血清代谢组，增加糖尿病风险

最新online的nature，关注肠道菌群如何影响血清代谢组、胰岛素抵抗、代谢和心血管疾病，值得一读。

血清代谢组学胰岛素抵抗支链氨基酸转运蛋白葡萄糖不耐受

Nature：二甲双胍对糖尿病人的肠道菌群到底有何影响？

去年Nature上的重量级研究，证实二甲双胍通过微生物调节而产生的药效是通过产生短链脂肪酸，并增加埃希氏杆菌达成的。强烈推荐重温经典。

二甲双胍二型糖尿病短链脂肪酸埃希氏杆菌 Grace Hewon Shin