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流式细胞术
文章数:7篇
合成菌群
多种技术评估合成菌群的动态变化
在良好控制条件下生长的合成群落是解读驱动群落动态的机制的重要工具,但随机性对肠道群落动态的影响程度尚未确定。Gut Microbes发表的研究,试图用一个自动发酵系统来解决这个问题,该系统允许有更多的生物重复,以研究确定的人类肠道群落的动态变化,并通过流式细胞仪获得总细胞数。结果表明,用16S rRNA基因测序法评估的合成群落中观察到的变异性,主要是由于技术变异性造成的。在HPLC和流式细胞仪数据中看到的低变异性表明这是一个高度确定的系统。
合成菌群
动态变化
16S rRNA基因测序
流式细胞术
HPLC
真菌
新技术可用于检测抗共生真菌的体液免疫
Microbiome最近发表的文章,开发出一种Fungi-Flow,用于检测针对共生真菌的体液免疫反应的流式细胞术,在人类肠道真菌群落中鉴定出两个与系统体液反应相关的生态系统。该技术或为研究真菌群在抗共生的体液免疫和体内稳态方面提供有力工具。
真菌
流式细胞术
IgG
克罗恩病
基于肠道菌群的细胞指纹图谱预测克罗恩病状态
大多数研究利用16S rRNA测序技术分析克罗恩病患者的肠道菌群变化。来自ISME Journal上发表的一项最新研究,发现基于流式细胞术绘制的粪便菌群的细胞指纹图谱可很好地反映出克罗恩病患者的肠道菌群群落结构变化,或可作为诊断工具以鉴别克罗恩病。
克罗恩病
研究论文
基础研究
队列研究
流式细胞术
噬菌体
饮食中的原噬菌体诱导剂是如何影响肠道菌群的?
在人体肠道内,每一个细菌细胞约含有1个病毒样颗粒(VLP)。这些VLPs大部分是dsDNA噬菌体。人类肠道中的大多数噬菌体属于温和噬菌体,并作为原噬菌体整合到细菌宿主的基因组中。研究表明,许多常见的食物和/或环境化合物可通过激活原噬菌体改变肠道菌群组成。Gut Microbes发表的文章,研究了三种常见肠道细菌和一种条件致病菌对117种常用食品、化学添加剂和植物提取物的反应。结果显示,包括甜菊糖和蜜蜂蜂胶提取物在内的11中化合物,显示出物种特异性生长抑制的原噬菌体诱导作用。以上结果表明,不同的食物可以通过调节温和噬菌体来改变肠道细菌的丰度,本结果或可为调节人类肠道微生物组提供了一条新的途径。
噬菌体
饮食-菌群互作
Bacteriophage
gut microbiome
Diet
肝脏免疫
Cell子刊:肝脏驻留NK细胞通过PD-1-PD-L1轴抑制T细胞功能
Immunity上发表的一项最新研究,发现肝脏驻留NK细胞可通过PD-1-PD-L1轴抑制肝脏T细胞的抗病毒活性,为肝脏免疫耐受产生的机制提供了新的研究方向。
肝脏免疫
PD-L1
antiviral responses
conventional NK cells
hepatic T cells
炎症性肠病
Cell:单细胞水平分析结肠间充质细胞,为IBD治疗铺路
肠道间充质细胞度对维持肠上皮细胞稳态至关重要,但是这些细胞的内部差异和分工,人们还所知甚少。Cell近期上线的一项研究,对健康和结肠炎个体的结肠间充质细胞进行单细胞水平分析,根据基因表达特征鉴定出4个新亚群,并重点研究了两个亚群的特征和作用,其中的S4亚群与结肠炎密切相关。该研究还比对了人体和小鼠中这些亚群的异同,相关发现对于揭示炎症性肠病的病理机制和开发新疗法,都有重要意义。
INFLAMMATORY BOWEL DISEASE
mesenchymem
stromal cell
crypt niche
Wnts
Crohn’s disease
MicroRNA 301A:结直肠癌治疗新靶点
① 炎症性肠病(IBD)和结直肠癌的肠道组织,microRNA-301a (MIR301A)表达升高;② 实验材料包括:153例IBD、6例结肠炎相关肠癌(CAC)和35例健康人活检小肠上皮细胞(IECs),结肠癌细胞株,右旋葡聚糖硫酸钠和氧化偶氮甲烷处理小鼠模型;③ 表达MIR301A的IECs钙粘蛋白1的表达下调,MIR301A的靶点为BTG抗增殖因子1(BTG1) mRNA,下调其表达,减少上皮完整性,促进小鼠结肠炎及肿瘤发生。④ 下调结肠组织中MIR301A,有望用于治疗IBD和CAC。
Crohn’s disease
炎症性肠病(IBD)
microRNA-301a (即MIR301A)
结肠炎相关肠癌(CAC)
小肠上皮细胞(IECs)