RNA测序

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RNA测序

文章数：4篇

IL-4通过STAT6诱导AML凋亡

① 采用荧光标记AML细胞，鉴定出IL4是AML细胞生长和生存的选择性抑制剂；② RNA测序AML细胞，靶基因Stat6上调，富含凋亡相关基因表达特征，IL4诱导的AML凋亡与Caspase-3活化相关，IL4刺激AML细胞诱导Stat6磷酸化；③ 采用CRISPR/Cas9遗传学基因工程破坏Stat6，细胞耐受IL4诱导的凋亡；④ IL4处理导致小鼠模型白血病细胞负荷下降，改善生存期，IL4处理抑制数个AML亚型来源的CD34+CD38-AML细胞的生长和生存，而对正常的干细胞和祖细胞影响小。

白介素4 急性髓系白血病凋亡 CRISPR/Cas9遗传学基因工程 RNA测序

基于neoantigen的多肽疫苗：初显疗效

① 全外显子组测序配对肿瘤和正常细胞DNA，鉴定体细胞突变，RNA测序分析突变等位基因的表达，预测与患者的自体HLA-A或HLA-B结合的突变肽；② 合成长肽靶向至少20个新抗原，混合Toll样受体3和黑色素瘤分化相关蛋白5激动剂聚-ICLC制备靶向个体化新抗原的疫苗；③ 入组10例患者，获得97个独特的新抗原，疫苗诱导的多功能性CD4+和CD8+ T细胞分别靶向58个和15个新抗原；④ 6例接种，4例完全缓解持续25个月，2例复发后进行抗PD-1治疗，达到完全缓解。

黑色素瘤全外显子组测序新抗原 Neoantigen RNA测序肿瘤免疫治疗

肝细胞癌(HCC)

北大、世纪坛、安进强强联手：cell杂志发文揭秘肝癌免疫微环境

① 对6例肝细胞癌（HCC）患者的外周血、肿瘤和连接的正常组织中分离的5063个T细胞进行深度单细胞RNA测序；② 这些单个细胞的转录情况，及组装的T细胞受体（TCR）测序，根据其分子和功能特性，可鉴定出11个T细胞亚群，划定其发展轨迹；③ HCC中优先富集和强效地克隆扩增耗竭的CD8（+） T细胞和Tregs特定亚群，鉴定出每一亚群的特征性基因；④ 其中layilin基因在活化的CD8（+） T细胞和Tregs中上调，在体外抑制CD8（+） T细胞的功能。

肝细胞癌(HCC) RNA测序 T细胞受体(TCR) CD8(+) T细胞免疫治疗

BRAF基因突变

孔乙己说：BRAF基因有三种”写法“

① BRAF是一种丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶，参与高度致癌性的RAS/RAF/MEK/ERK信号通路；② BRAF在肿瘤发展中起重要作用，约7%肿瘤都携带有BRAF突变，最常见突变为V600E，但对BRAF基因的表达调控机制还不清楚；③ 本文对9种癌症类型超过4800位病人的RNA-seq数据进行分析，发现BRAF mRNA有三种亚型，它们在编码序列最后一部分，长度及 3'UTR序列上有所不同；④ 三种亚型的蛋白表达丰度在不同类型肿瘤中是不一样的，可根据其表达情况针对性治疗。

BRAF基因突变 RNA测序转录组分析 BRAF Exon-spanning reads