表观遗传学

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表观遗传学

文章数：6篇

表观遗传学

cfDNA中5-羟甲基胞嘧啶特征：用于肿瘤分型和分期

① 5hmC是与肿瘤发病相关的重要DNA表观遗传学修饰，采用敏感的化学标记基础上的低输入短枪测序方法，可对循环血cfDNA内低水平5hmC进行测序；② 对7种类型肿瘤、49例患者的游离5hmC进行测序，全基因范围描绘cfDNA中的5hmC，不同的特征可用于预测肿瘤类型与分期；③ cfDNA中5hmC的总体缺失与肺癌分期相关，而肝细胞癌和胰腺癌发生疾病特异性游离羟甲基小体的变化；④ 5hmC的测序与拷贝数变异体（CNV）分析可在循环肿瘤DNA分析中互补。

表观遗传学 5-羟甲基胞嘧啶游离DNA 肿瘤诊断 Sarah J Mitchell

肿瘤免疫治疗耐药：EZH2也掺和了一腿！

① 抗CTLA-4或 IL-2免疫治疗过程中，肿瘤内坏死因子-α（TNF-α）的产生和T细胞聚集导致黑色素瘤细胞中组蛋白甲基转移酶Ezh2表达增加，反过来沉默其自身的免疫原性和抗原提呈；② Ezh2失活逆转该耐药，与抗CTLA-4或 IL-2免疫治疗协同抑制黑色素瘤生长；③ 该抗肿瘤作用依赖于肿瘤内聚集的产生干扰素-γ（（IFN-γ）的PD-1（低）CD8+ T细胞和黑色素瘤细胞上PD-L1表达的下调；④ Ezh2是在靶向T细胞免疫治疗过程中调控黑色素瘤免疫逃逸的开关。

IL-2复合物抗CTLA-4 抗PD-1 表观遗传学免疫治疗

罕见细胞变异

罕见细胞变异导致药物耐药：Nature重磅发现

① 耐药可源自继发性突变，但某些实例中，不存在明确的遗传学原因，提示非遗传学罕见细胞变异的可能性；② 黑色素瘤细胞在单细胞水平呈现严重的转录变异，最终耐药，这种变异包括很小比例细胞内多种耐药因子的高水平的少见、半协调转录；③ 药物诱导细胞出现表观遗传学重组，将一过性转录状态状态转变为稳定耐药状态；④ 这类重组始于SOX10介导的分化缺失，随后激活新的信号传导通路，部分由转录因子JUN和/或AP-1和TEAD的活化介导。

罕见细胞变异继发性突变耐药表观遗传学黑色素瘤

肿瘤特异性T细胞

肿瘤特异性T细胞：表观遗传上，很有特点

① 肿瘤特异性CD8+T细胞（TST）在实体瘤中会失去功能导致肿瘤发展，免疫检查点抑制剂和过继性细胞治疗提出一个问题，如何预测病人对免疫治疗有反应；② 为研究表观遗传在TST中的情况，本文建立了T细胞特异性感染和肿瘤模型并结合ATAC-seq手段进行分析；③ 结果：鉴定了TST在肿瘤发生中表观遗传变化情况，初始TST遇到肿瘤抗原会分化成可塑性状态，之后转变为无能状态；④ 鉴定出表面分子CD101和CD38与TST表观状态有关，可用来预测病人应答情况。

肿瘤特异性T细胞表观遗传学

表观遗传学

KMT2D：乳腺癌表观遗传调控新靶点

① 雌激素受体（ER）阳性乳腺癌中常见PI3KA敏感性突变，磷脂酰肌醇-（3）-激酶（PI3Ka）抑制剂促进ER依赖性转录，诱导耐药，限制其疗效；② 抑制PI3K使乳腺癌ER靶位染色质处于开放状态；③ KMT2D是组蛋白H3赖氨酸4甲基转移酶，是FOXA1、PBX1和ER募集与活化所必需；④ 抑制PI3K增强KMT2D活性，通过表观遗传学调控因子的转录后修饰控制ER活性，为ER阳性乳腺癌的表观遗传学治疗提供理论依据和全新的靶点。

表观遗传学乳腺癌 PI3K通路甲基转移酶雌激素受体（ER）

表观遗传学

破解肿瘤表观遗传奥秘的“神器”：化学探针（综述）

① 动态和复杂的表观遗传学环境背景下，转录程序是肿瘤细胞特征的基础；② 染色质修饰的体细胞改变，是最常见的肿瘤扰动，急需靶向化学探针以解析这些复杂的、相互关联的基因调控回路；③ 有效的化学探针促进机制研究，同时为药理学提供概念验证，将药物衍生物转化为抗肿瘤药物；④ 开发与肿瘤病理发生相关联的表观遗传学效应蛋白的化学探针，如组蛋白甲基化探针、组蛋白乙酰化探针、DNA甲基化探针；⑤ 表观遗传学工具箱在研发领域应用广泛。

表观遗传学染色质修饰化学探针组蛋白甲基化组蛋白乙酰化