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Gregory M Barton
文章数:6篇
AKK菌
Nature子刊:Akk菌的首套遗传操作系统
这是发表在Nature Microbiology上的一份工作,作者基于pSAM_Bt质粒,密码子优化转座酶himar1C9成功构建针对嗜黏蛋白阿克曼氏菌(Akk菌)的转座子插入质粒pSAM_Akk,并通过大肠杆菌接合的方式获得了Akk菌的转座子插入突变文库。其中突变体混合文库包括721个基因序列上2680个独特插入、198个基因间序列插入和5个tRNA序列插入,单个突变体单独培养文库包括406个基因序列上1063插入、58个基因间序列插入和2个tRNA序列插入。通过混合文库分别接种到体外胃黏蛋白为唯一碳源的限制性培养基、体内四种小鼠模型(无菌小鼠、接种8种核心肠菌的小鼠、常规饲养小鼠和黏蛋白缺陷鼠)中,进行转座子测序以鉴定关键基因。Akk菌需要氨基酸生物合成途径以积累黏蛋白糖,同时表达大量糖苷水解酶以实现代谢生长。在体内,Akk菌表达纤毛和MUL外周蛋白复合体以实现黏蛋白的利用积累。MUL基因帮助Akk菌与其他肠菌竞争以实现定植,在无菌小鼠体内会抑制结肠甾醇生物合成相关基因的表达。这份工作成功实现了重要候选益生菌嗜黏蛋白阿克曼氏菌的遗传操作,为后续机理研究和益生菌开发提供技术基础。
AKK菌
细菌遗传学
细菌-宿主互作
AKK菌
不同Akk菌分离株的基因型及表型差异
来自mBio上发表的一项最新研究,从人粪便中分离出了71株Akk菌,并对比鉴定了不同分离株的基因型及表型差异。
AKK菌
研究论文
基础研究
菌群-免疫互作
BCR与TLR协同调控B-1细胞对自身和菌群的免疫应答
B-1a细胞可分泌天然IgM,在介导组织稳态及抑制感染中发挥重要作用。来自eLife上发表的一项最新研究发现,BCR信号及TLR信号在B-1a细胞中起到协同作用,共同促进B-1a细胞对菌群及自身抗原的应答,在抑制自身免疫反应、维持组织及肠道稳态中发挥重要作用。
菌群-免疫互作
菌群-免疫互作
BCR
TLR
B-1细胞
菌群-宿主互作
Science:共生菌引起的肠道适应性免疫应答,具有个体差异
肠道菌群可调节适应性免疫,从而影响宿主健康,但对其背后的机制和规律人们仍所知甚少。《Science》发表的一项最新研究发现,嗜粘蛋白阿克曼氏菌(Akk菌)可诱导限菌小鼠的抗原特性的T细胞应答,促进生成IgG1抗体;但在菌群复杂的小鼠中,Akk菌引起的T细胞应答则存在个体差异,提示菌群内其它成员以及有个体差异的其它因素,可能影响针对Akk菌的T细胞反应。这些发现有助于解释特定共生菌对宿主免疫影响的个体间差异,也再次提示靶向菌群的干预方法,需建立在个体化的基础上。
菌群-宿主互作
适应性免疫
肠道T细胞
T细胞应答
Akkermansia muciniphila
Toll样受体
Immunity:肠上皮中Toll样受体的表达蓝图
肠上皮细胞(IEC)中的Toll样受体(TLR)信号,对于维持肠道稳态有重要作用。Immunity近期发表一项研究,制作了5个TLR(TLR2/4/5/7/9)的转基因报告小鼠,揭示了不同TLR在不同肠道区域的时空表达图谱,及IEC对微生物刺激的应答多样性,为研究肠道疾病与健康中的先天免疫、菌群-宿主互作等问题,提供了重要资源。
Toll样受体
肠上皮细胞
潘氏细胞
先天免疫
肠道稳态
母体IgG
Cell:妈妈的抗体,后代的保护神?
Cell像菌群月刊不?
母体IgG
母体IgA
粘膜辅助性T细胞
Alan Mcnally
Alan Mcnally