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病毒-宿主互作
文章数:7篇
人类肠道病毒组
肠道病毒组与肠道疾病(综述)
肠道微生态系统不仅包括肠道细菌,还有大量的病毒、真菌、少量的古细菌和原虫。这些微生物之间的平衡在维持人体健康方面起着重要作用。其中,肠道病毒组的组成非常复杂,并且个体之间存在显著的差异。近期发表在Gut期刊上的一篇综述文章总结了肠道病毒组研究的最新进展,有助于更好地理解病毒组失调如何与肠道疾病的发病机制相关,并探讨了调节病毒组组成对改善肠道疾病管理的临床干预的潜力。
人类肠道病毒组
病毒-宿主互作
肠道疾病
病毒组
Nature子刊:助力从Hi-C数据中识别高质量病毒基因组新工具—ViralCC
将高通量染色体构象捕获(Hi-C)技术引入宏基因组学,可以从微生物群落中重建高质量的宏基因组组装基因组(MAGs)。尽管最近利用Hi-C测序恢复了多种真核生物、细菌和古细菌基因组,但很少有基于Hi-C数据的工具被设计用于检索病毒基因组。近日,美国南加州大学研究人员在Nature Communications发表最细研究,开发了一种新的基于宏基因组Hi-C数据的开源分箱工具ViralCC(https://github.com/dyxstat/ViralCC),用于恢复高质量病毒基因组及检测病毒-宿主对,并在多种真实和模拟数据中应用,发现其分箱性能较好,值得进一步测试。
病毒组
ViralCC
研究论文
基础研究
Hi-C测序
病毒鉴定
Nature:宏基因组学解析巨病毒的多样性及与宿主的相互作用
巨病毒(Giant virus),属于核质大DNA病毒(nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDVs),基因组可以达到几个兆碱基大小,病毒体甚至比小细胞生物体尺寸类似甚至更大。这些病毒能够广泛地感染从原生生物到动物等一系列真核生物。但是目前关于巨病毒的了解还仅限于与原生生物和藻类共生的病毒分离株。发表在《Nature》上的一项研究,基于目前公开的众多宏基因组数据,重建了2000多种NCLDV基因组,并分析了其分布模式、代谢特点及与宿主的相互作用。该研究为未来巨病毒的研究提供坚实的基础理论和广泛的资源,为巨病毒多样性以及其与宿主的相互作用提供了更为全面的分析和见解。
病毒鉴定
核质大DNA病毒
宏基因组
水平基因转移
代谢重编程
肠道病毒
Nature子刊:宿主甲基转移酶SETD3帮助肠道病毒复制
肠道病毒感染可引发脊髓灰质炎在内的多种疾病,但肠道病毒如何利用宿主细胞功能促进自身复制及传播还不完全明确。来自Nature Microbiology上发表的一项最新研究,通过CRISPR筛选鉴定出肠道病毒的复制需要宿主细胞中的SET域蛋白3(SETD3)的参与。
肠道病毒
病毒-宿主互作
SET域蛋白3(SETD3)
Maria Angela Guzzardi
Maria Angela Guzzardi
肠道免疫
Nature子刊:肠道病毒感染通过IFN-I与IL-22抑制肠道损伤
Nature Microbiology上发表的一项最新研究,发现诺如病毒感染可通过引起小鼠结肠中的IFN-I应答,以促进天然淋巴细胞产生IL-22,从而在DSS诱导的肠道损伤及鼠柠檬酸杆菌引起的肠道感染中起到保护性作用。
肠道免疫
肠道免疫
动物实验
诺如病毒
IFN-I
病毒
Cell子刊:分泌型非结构蛋白有望用于开发诺如病毒疫苗
诺如病毒感染肠道上皮簇状细胞,导致小鼠产生症状。《Cell Host and Microbe》近期发表研究,发现鼠类诺如病毒分泌的NS1蛋白可抑制肠上皮成簇细胞中IFN-γ介导的免疫应答,促进病毒感染,而且NS1蛋白在小鼠中表现出良好的免疫原性。该结果对于了解诺如病毒感染机制,以及开发相应疫苗具有参考价值。
病毒
病毒-宿主互作
IFN-λ
NS1
norovirus
猪流行性腹泻病毒
南农大杨倩等:猪流行性腹泻病毒空气传播的致病机制
猪流行性腹泻病毒(PEDV)可给养猪业带来巨大损失,除了粪口消化道途径,近期研究显示空气传播也是导致PEDV爆发的原因。Nature Communications近期发表南京农业大学杨倩团队的研究,揭示了PEDV感染仔猪鼻上皮细胞后,搭乘免疫细胞的“便车”,经血液循环达到肠道,最终感染肠上皮细胞的感染机制,相关发现对于PEDV的防治有重要参考价值。
猪流行性腹泻病毒
病毒感染
病毒传播
病毒-宿主互作
仔猪