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holobiont
文章数:12篇
金小蜂
王关红等:金小蜂-微生物组间互作机制进展(综述)
近年来,随着微生物研究技术的发展,菌群研究得到了广泛关注,金小蜂(Nasonia)是研究昆虫行为、发育、进化遗传学、物种形成和共生关系的良好模式生物。近日,中国科学院动物研究所王关红及团队在Trends in Parasitology发表最新综述,系统的阐述了金小蜂作为微生物组研究模式生物的优势,以及研究方法,强调了宿主进化关系在微生物群组成中的重要性,并详细总结了金小蜂微生物组与宿主间的复杂互作进展。总之,该研究有助于更好地理解微生物在生命科学领域所发挥的关键作用,为进一步充分利用金小蜂研究模型提供重要借鉴意义。
金小蜂
宿主-微生物互作
wasp
holobiont
phylosymbiosis
宿主-微生物共进化
肠道细菌是否与宿主共同进化?
尽管肠道菌群显著影响宿主健康,但是推动宿主-菌群系统进化的机制缺乏定论。Cell Host and Microbe发表的观点文章质疑了“哺乳动物-共生微生物的系统发育同步性源于物种共进化”的理论,强调了地理隔离对哺乳动物、共生微生物进化的重要影响。地理隔离并不是物种形成的必要条件,只有排除这一影响因素,才有可能证明宿主-菌群系统发育同步性与物种共进化的关系。
宿主-微生物共进化
gut microbiome
coevolution
cospeciation
allopatry
饮食-菌群互作
Cell子刊:肠道菌群的饮食适应性受到宿主NF-kB信号和翻译过程调控
膳食营养素塑造了宿主-肠道菌群之间的复杂联系与相互作用,进一步促进宿主-微生物之间联系的灵活性,从而推动营养共生。然而,饮食依赖的宿主信号是否会影响宿主-微生物互作目前尚不清楚。Cell Reports近期发表的文章显示,果蝇中肠肠上皮细胞的NF-kB/Relish可通过调控饮食诱导的翻译及新蛋白合成,放大宿主-乳酸杆菌之间互作,调控肠道微生物组成。
饮食-菌群互作
commensal bacteria
Diet
holobiont
Intestine
扩增子测序
“扩增子”VS“宏基因组”——到底谁可以描绘宿主和微生物共生体进化蓝图
高通量测序使微生物组的研究走上了快车道,与宿主相关的微生物往往更受研究者青睐。不仅仅作为人类的第二基因组,微生物其实与大量的动植物都有互作关系。这一宿主微生物共生体对于生态系统的稳定、发展和进化尤其重要。在微生物协同宿主进化研究中,基于扩增子和宏基因组都可以对微生物群落结构进行表征。为了比较它们表征微生物群落和功能的异同,同时为广大研究者提供方法上的优化和参考,基于两种不同方法,作者使用不同环境的宿主相关微生物进行了深入的讨论。并且在宿主和微生物互作方面提出了自己独特的见解。相信在今后可以为我们研究宿主微生物进化之路提供有力的技术参考和重要的认识。
扩增子测序
宏基因组
分析方法
系统综述
Animal microbiome
宿主-菌群互作
从进化的视角看营养过剩与炎症性疾病(观点)
炎症性疾病在现代化社会中的发病快速增加,《mBio》近期发表的观点性文章,从进化的角度提出假说,特别强调了肠粘膜菌群的作用,以及禁食等对菌群的“重置”作用在健康中的意义,对于理解现代化、菌群失调与炎症性疾病的关联,有一定参考意义。
宿主-菌群互作
Dysbiosis
fasting
holobiont
host-microbe homeostasis
共生功能体
关注“共生功能体”研究
《Microbiome》近期发表一篇评论文章,总结了共生功能体概念的演变,以及近年来共生菌群-宿主互作领域的研究热点、潜在运用和发展方向,值得参考。
共生功能体
holobiont
hologenome
Host-Microbiota Interactions
metagenomics
共生功能体
共生藻影响宿主生物钟
兼性共生海葵的生物钟受共生藻类的影响,本研究监测了海葵基因表达和日常行为,对比有无共生藻对海葵节律性的影响,指出共生藻可以显著影响宿主的生物钟,甚至完全改变宿主原有节律。虽然宿主和共生生物类型较特殊,但该成果对研究宿主-共生生物互作、共生功能体共进化、共生微生物对宿主生物钟的调控等都有借鉴价值,值得专业人士关注。
共生功能体
生物节律
海葵
共生藻
Behaviour
共生体
共生体基因组研究:不断演变的概念(综述)
Microbiome近期发表综述,探讨了对共生体和共生基因组概念的认识,并提出共生微生物快速的遗传变异可为宿主的进化选择提供助力。
共生体
共生基因组
holobiont
hologenome
Yang Chen
水产养殖
将共生基因组学用于水产养殖
如何提高水产养殖业的产量?Trends in Biotechnology[IF:11.126]近期发表一篇观点文章,提出应综合多组学的数据和方法,将养殖鱼及其肠道菌群作为共生体,综合分析以找到提高产量、促进可持续生产的方法,并就具体问题进行举例,值得专业人士关注。
水产养殖
共生基因组
共生体
共生组学
aquaculture
合成菌群
Cell子刊:合成菌群在植物菌群研究中的机会
这是Cell Host & Microbe[IF:14.946]发出的关于如何利用混合不同菌株的“合成菌群”以促进植物菌群研究的观点文章,立足于植物,但对其他菌群,包括人类肠道菌群的研究也有启发意义。特别推荐!
合成菌群
植物菌群
microbiota
Microbiome
holobiont
植物核心菌群
TPS:植物的功能核心菌群
① 与宿主植物系统性相关的微生物群落被称为核心菌群;② 迄今为止核心菌群的定义基于菌群的分类学组成,但本文作者认为,应该基于菌群的功能;③ 功能核心菌群中包含携带有共生体必需功能基因的微生物载体;④ 功能核心菌群从强化的基因水平转移及基因载体(微生物)的生态富集开始建立;⑤ 功能核心菌群的传播途径根据环境限制因素及其对共生体适性的附加价值,随着植物的传代而发生变化。
植物核心菌群
agroecology
coevolution
core microbiota
holobiont
E. coli
Cell:大肠杆菌调节化疗药对线虫的效果
Cell出品,本就不俗,涉及抗癌,更是重磅,强烈推荐。
E. coli
氟尿嘧啶
秀丽隐杆线虫
癌症
共同代谢