single-cell genomics

搜索
登录

single-cell genomics

文章数：4篇

Cell：复杂而多样的海洋浮游菌群

海洋细菌和古菌在全球生物地球化学中扮演重要角色。Cell近期发表的一项研究，使用随机化的单细胞基因组学方法构建了1个全球热带海洋参考基因组（GORG-Tropics）数据集，揭示了海洋浮游细菌和古菌的复杂和多样性。

海洋菌群 genomics Reference database microbial ecology plankton

溃疡性结肠炎

Cell：溃疡性结肠炎中哪些细胞和基因出了问题？

上周Cell发表的又一篇单细胞RNA测序研究，对18名溃疡性结肠炎（UC）和12名健康人的结肠粘膜样本进行单细胞RNA测序，揭示出基因表达模式和细胞类群的变化在UC发生和药物应答中的作用，以及风险基因与特定细胞类型和功能通路的关系。

溃疡性结肠炎 INFLAMMATORY BOWEL DISEASE ULCERATIVE COLITIS Inflammation anti-TNF resistance

脂肪组织巨噬细胞

Cell：脂肪组织中的一类抗肥胖免疫细胞

脂肪组织中的免疫细胞与代谢疾病有密切关联。《Cell》发表的一项最新研究，通过单细胞RNA测序，发现了脂肪组织中的一类具有代谢保护作用的免疫细胞——脂质相关巨噬细胞，有助于抵抗脂肪细胞肥大、炎症和代谢紊乱。脂质受体Trem2是巨噬细胞感知胞外脂质的主要感受器，可在代谢失衡时驱动保护性的组织免疫细胞应答，因而Trem2或许可作为代谢疾病的潜在治疗靶点。

脂肪组织巨噬细胞 single-cell genomics IMMUNOLOGY Metabolism Macrophages

生物信息学

赵方庆等：菌群研究新策略——单细胞宏基因组学（综述）

Protein & Cell中国肠道大会专刊发布中科院赵方庆团队的综述，回顾并讨论了单细胞基因组学和宏基因组学联用的技术手段和分析方法，也讨论了目前存在的挑战。两种技术联用，可以有效规避原有菌群研究方法的局限性，具有可观的运用前景，值得专业人士关注。

生物信息学单细胞基因组学宏基因组学 Bioinformatics metagenomics