Karen E Nelson

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Karen E Nelson

文章数：12篇

Science子刊：用益生菌保护珊瑚

珊瑚礁生态系统被称为水下“热带雨林”，具有保护海岸、维护生物多样性、维持渔业资源、吸引旅游观光等重要功能。通常珊瑚个体色彩绚丽，艳丽的颜色不逊色于陆地上的各种鲜花。但是近年来，随着地球气候的变化，海洋水温的升高，使得珊瑚与藻类和细菌的共生系统被打破，出现了严重的漂白现象。珊瑚漂白不仅仅是一种美的损失，更重要的是，这是一个环境指标，它预示着海洋生态系统的衰退和全球气候的毁灭性变化。因此如何通过人为干预的方法解决珊瑚漂白的问题是目前环境保护领域面临的重要课题。近来有假说认为珊瑚的共生微生物在协助珊瑚抵抗压力具有重要的作用，通过添加珊瑚益生菌可以一定程度上改善珊瑚漂白的现象。但是，对于其增强环境压力耐受的具体的机制，以及微生物操作能否降低珊瑚在胁迫下的死亡尚不清楚。近期一篇发表在Science子刊Science Advance上的研究，通过在培养珊瑚中添加筛选出的益生菌发现，益生菌可以触发共生菌的重建，引发珊瑚宿主遗传和代谢的改变，最终减轻珊瑚漂白和死亡率。

珊瑚漂白珊瑚益生菌热胁迫珊瑚死亡率共生体（holobiont）

新型抗生素研发

Nature：靶向革兰氏阴性菌的新型抗生素

革兰氏阴性菌特殊的双层膜结构可以保护其抵御抗生素的渗入，研发靶向这类细菌的抗生素极具挑战性。Nature上发表的一项研究，从线虫的肠道共生菌中鉴定出可以克服这一障碍的化合物darobactin，这种潜在的新型抗生素似乎可以靶向革兰氏阴性菌外膜上的一种关键蛋白BamA，从而发挥抗菌作用。

新型抗生素研发革兰氏阴性菌 Nonghua Lu Heping Zhang Wenjun Liu

肠道及口腔菌群或影响健康衰老

来自GeroScience上发表的一项最新研究，在65名70-82岁的老年人中，对比了健康衰老与非健康衰老的受试者的肠道菌群及口腔菌群，发现健康衰老与更高的口腔菌群多样性、肠道菌群中更高的Akk菌丰度、肠道及口腔菌群中更低的链球菌属丰度相关。

衰老 Oral microbiome . Gutmicrobiome . 16S rRNA Metagenomic analysis healthy aging Chronic disease

人体肠道菌群与宿主代谢之间的相互作用关系

本研究依托于twinsUK队列，对1004对双胞胎的粪便样本进行了宏基因组测序，得到菌群和代谢途径信息。并且，采集并测定了859例血液样本代谢物以及479例粪便样本代谢物信息。基于以上信息，分析了菌群、粪便和血液代谢物、代谢途径三者之间的相互关系，揭示了菌群与宿主之间的相互作用关系，以及可能的相互作用途径。

代谢组学肠道菌群

宿主-菌群互作

宿主生理和饮食，哪个对菌群影响更大？

ISME Journal发表的一项研究，从演化角度，分析比较了18种灵长目动物的肠道菌群组成，表明影响菌群的主要因素是宿主本身的生理演化，而非宿主食性。该结论与此前的部分研究有所不同，作者也进行了一些探讨。对菌群-宿主互作、菌群-宿主共演化感兴趣的专业人士不妨关注。

宿主-菌群互作灵长类动物微生物组食性

JAE：社交行为或可影响肠道菌群？

这是近期Journal of Animal Ecology[IF：4.474]发表的在灵长类动物红腹狐猴中进行的社交模式与肠道菌群的关联性研究，有些有趣的发现，不妨看看。

社交行为 cooperation Immunity lemur microbial transmission

口腔微生物

ME：儿童口腔菌群如何发育？对健康有何影响？（综述）

很值得一读的口腔菌群相关综述，特别是关注儿童口腔菌群与健康和疾病关系的群友，应该认真看看。

口腔微生物生物标记物儿童儿童龋齿 Kevin J Portunea

SR：室温收集、储存和运输菌群样本的新方法

很多人会关心在室温收集和处理样本，或者运输样本会对菌群的研究结果产生影响，这篇文章介绍的在室温收集并稳定样品的方法和KIT，相对完美地解决了相关问题，非常值得一读。

人体菌群功能研究室温标准化

抗生素使用

Microbiome：住一起的人，共享不被抗生素扰动的微生物

住在一起的人，其中一人吃抗生素，一人不吃，连续监测6个月身体各部位的菌群，发现菌群有住所特异性（就是共享一些菌群成员），这些特异性的微生物不受抗生素扰动。所以，珍惜家人，创建和谐家庭菌群，对一家人可能都有好处哦。

抗生素使用人体菌群阿莫西林阿奇霉素 Linda E Carstens

微生物生态学：给大猩猩吃抗生素，有何影响？

很多时候，出于伦理等限制，我们无法在人身上做太多抗生素如何影响菌群这样的实验，这时候大猩猩可以出场。这个研究就是用大猩猩作为研究对象，分析了头孢对大猩猩肠道菌群的影响，很值得看一看。

antibiotics bacteria Gastrointestinal microbiome gorilla Illumina MiSeq

PNAS：不同文库制备方法对微生物组测序影响巨大

去年发表在PNAS上的重要文献，对不同文库制备方法对基因组和功能属性影响做了详细研究分析，是很值得一读的方法学文献。

genomics Microbiome sequencing

联合微生物组计划

Science：呼吁发起“联合微生物组计划”

这是美国科学家在“国家微生物组计划”启动之前在Science上呼吁启动“联合微生物组计划”的文章，很值得没看过的人看一看，看看这样的大型计划会关注哪些领域，要有什么人参与，需要什么资源。

联合微生物组计划人类微生物组计划 Kenya Honda Dan R Littman