生物标记物

多项研究已经报道个体患者队列中肠道微生物组与新冠疾病严重程度间的关联，但其生物标志物在国际队列中的稳健性仍然存在问题。近日，科克大学研究人员在Gut Microbes发表最新研究，对新冠患者的8项宏基因组和23项16S研究进行荟萃分析，发现肠菌结构改变在感染后7-30天会达到高峰，并鉴定出较准确的新冠患者微生物组生物标志物，构建了预测模型，值得关注。

新冠肠道菌群荟萃分析基础研究宏基因组

精氨酸

Science子刊：氨基酸或可使肿瘤细胞内密码子发生定向进化

不同生物体对特定密码子的利用具有偏好性，癌症代表了一种研究DNA序列进化的模型，并可能揭示密码子进化背后的因果因素。近期发表在Science Advances杂志上的一篇文章发现在人类癌症中精氨酸密码子经常突变为其他密码子，限制精氨酸摄入可诱导人结肠癌细胞中精氨酸密码子的突变。机制上，精氨酸限制导致了精氨酸转移tRNA和核糖体异常，从而使其向含有低精氨酸密码子的基因转变，因此，特定氨基酸的环境可以影响DNA序列进化。该发现表明特定密码子的突变可能成为癌症的新兴代谢标志物。

精氨酸结直肠癌定向进化生物标记物限制精氨酸

结直肠癌

多组学鉴定出潜在生物标志物，用于筛查腺瘤和结直肠癌

结直肠癌 (CRC) 筛查可降低其死亡率，但其敏感性和特异性有限。近日，发表在Gut Microbes上的这篇文章，开发了基于粪便菌群、蛋白质组和氨基酸谱的平台诊断，用于寻找CRC和腺瘤的潜在生物标志物组，改善腺瘤和CRC的无创筛查，从而降低结肠癌的发病率和死亡率。

结直肠癌腺瘤多组学分析生物标记物

细菌胞外囊泡

Cell子刊：体循环中的细菌胞外囊泡的起源、命运和功能（观点）

细菌通过产生大量的生物大分子并将其包裹在膜泡（细菌胞外囊泡（BEV））中，对人类宿主的（病理）生理产生影响。Trends in Microbiology发表的观点讨论文章，总结了系统性循环BEV的起源、转移、分布、功能、清除，并提出了相关的知识空白。对BEV进入上皮和免疫屏障的进一步研究，有助于了解BEVs在健康和疾病中的作用。

细菌胞外囊泡细菌外膜囊泡微生物组屏障功能障碍生物标记物

早发性结肠腺癌

早发性结肠癌的临床病理和分子特征

发生在年轻人(20-49岁)中的结肠癌(CC)，称为早发性CC (EO-CC)，发病率逐年增加。迄今为止，有限的证据表明早发性结直肠癌具有独特的临床病理和分子生物学特征，然而，关于早发性结直肠癌的具体特征，特别是直接比较早发性结和迟发性直肠癌分子特征的研究非常有限。Journal of the National Cancer Institute发表的文章中，通过分析Adjuvant Colon Cancer ENdpoint（ACCENT）数据库中的25项随机临床研究的35713例患者数据，结果发现，与LO- CC（迟发性结肠癌）相比，EO-CC具有不同的临床病理特征和分子特征。重要的是，研究表明，由选定的分子标记显示的肿瘤生物学，而不是疾病发病年龄，是EO-CC预后的主要因素。本研究结果提示，EO-CC可能与基因遗传更相关。

早发性结肠腺癌生物标记物

肺癌

国内团队：肠道微生物组特征或能预测早期肺癌

肠道菌群的改变涉及包括癌症在内的多种疾病。然而，肺癌的肠道菌群谱仍然很大程度上未知。来自中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所的季红斌、陈剑峰以及来自同济大学的张鹏研究团队在Gut Microbes发表最新研究，分析了早期肺癌患者和健康对照的肠道微生物群组成，发现并验证了13个可预测肺癌的高精度生物标记物。该研究揭示了肺癌患者的微生物群谱，建立了预测早期肺癌的特异性肠道微生物特征。

肺癌 Gut microbiota early-stage lung cancer Biomarkers noninvasive diagnosis

生物标记物

Lancet：利用生物标记物，改善克罗恩病治疗的效果

这是针对同期发表的临床研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1054681896）的评价，简要介绍研究并肯定临床意义。值得与研究原文一起精读，特别推荐。

生物标记物钙网蛋白 C-反应蛋白克罗恩病 Epp Sepp

生物标记物

Lancet：严格多监控两个指标，能更有效治疗克罗恩病

这是Lancet[IF：47.831]最新online的重要临床研究，发现在针对克罗恩病人的治疗中，增加粪便钙网蛋白及C-反应蛋白指标的严格监控，可以显著改善疗效，帮助克罗恩病人缓解。这是很重要的发现，对临床具有指导意义，值得好好看看。

生物标记物钙网蛋白 C-反应蛋白克罗恩病抗TNF-α疗法

炎症性肠病

Gut：肠道菌群作为IBD的生物标记物？未来可期

肠道菌群与许许多多的疾病都已经建立起了相关性，很多后续研究自然而然会关注是否可以利用肠道菌群来指示特定疾病。目前看来，相关研究处于起步阶段，比如在IBD领域，有证据表明菌群失调与疾病相关，但利用菌群就能指征甚至“确诊”IBD，还充满挑战。Gut上这篇文献，值得好好读一读。

炎症性肠病生物标记物 Andréa G Grottoli Andréa G Grottoli

坏死性小肠结肠炎

JP：一文通晓坏死性小肠结肠炎的所有潜在标记物（综述）

这篇文章系统性总结了坏死性小肠结肠炎（NEC）的生物标记物，包括微生物和非微生物标记物，关注于此的人，应该好好读一读！

坏死性小肠结肠炎生物标记物 Gut Infant Preterm

粪便菌群

SR：通过粪便菌群预测克罗恩病病情，靠谱么？

通过粪便菌群作为克罗恩病生物标志物，评估病情变化，区分病变期和缓解期的患者，会是一种靠谱的策略么？这篇文章值得读一读。

粪便菌群克罗恩病生物标记物 Keisha Findley Vence LBonham

精准医疗

AJG：IBD的精准治疗，都已发现什么标记物？（综述）

关于针对IBD精准医疗的生物标记物的综述，很值得一读，特别推荐。

IBD 精准医疗生物标记物 Hong Chen Hong Chen

口腔微生物

ME：儿童口腔菌群如何发育？对健康有何影响？（综述）

口腔微生物生物标记物儿童儿童龋齿 Kevin J Portunea

肠道菌群

Oncotarget：哪些细菌和分子与大肠癌患者预后有关？

青岛大学附属医院团队的最新研究，值得看一看。

肠道菌群结直肠癌生物标记物预后 Xutao Hong

炎性肠病

Gut：蛋白组学，区分儿童克罗恩病和溃疡性结肠炎？

采用蛋白组学和多元统计分析进行CD和UC的生物标志物识别，转需。

炎性肠病克罗恩症溃疡性结肠炎蛋白组生物标记物

结肠直肠癌

基于微生物的模型提高了结肠病变粪便免疫化学检测的敏感度

① 检测490名结直肠癌（CRC）患者粪便肠道菌群多样性，研究肠道菌群相对丰度及粪便中血红蛋白浓度的关系；② 基于微生物的随机森林模型法检测到癌变率91.7%和结直肠腺瘤率45.5%，而粪便免疫化学法（FIT）检出率分别为70%和37.7%；③ Porphyromonas assaccharolytica、Peptostreptococcus stomatis、Parvimonas micra和Fusobacterium nucleatum与CRC相关；④ 益生菌的减少，如毛螺菌科细菌，与传统FIT联用，能显著提高腺瘤的检出率。

结肠直肠癌粪便免疫化学检测生物标记物肠道菌群 Zhang-Rong Xu

肠型

Nature：人类肠道微生物组有三种肠型（2011）

经典回顾，2011年，MetaHIT团队通过数据比较分析，认为有三种肠型的存在，虽然后来有很多科学家（比如参与HMP的美国科学家）对此提出质疑，但肠型这个概念，在此后5年，直到今天，还是有其影响力。

肠型人类微生物组计划生物标记物 Wen Ren Zhe Xun