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文章数：12篇

三代测序技术

Nature子刊：基于三代测序的宏基因组分析助力完整微生物进化研究

微生物是自然界中种类繁多的一类生物，与人类健康、环境等均有这密切的关系，然而由于此前技术的限制，人们对于微生物的鉴定和认识远远低于自然界实际的微生物种类和数量，因此构建微生物的完整的进化树更是镜花水月。近年来随着三代测序技术的的成熟和实施成本的大幅下降，基于三代测序的宏基因组技术已经开展在微生物学领域的研究，成为有效鉴定微生物的研究方法，使得很多此前无法开展的研究具有了可能。近期一篇发表在Nature子刊，Nature Methods的评论就三代宏基因测序技术的出现对研究微生物进化方面进行了评述，对于该技术在该领域的作用进行了前瞻性预测。

三代测序技术宏基因组学细菌与古细菌基因组百科全书 GEBA 其他

多组学技术

群落生态方法分析组学数据

随着多组学技术的不断发展，人们可以通过元条形码研究、宏基因组学、元转录组学、元代谢组学以及宏蛋白组学等多种技术对待检测样本的分子池进行测量，生成海量的多元数据集，进而对这些数据集进行分析，从而找到规律，解决科学问题。很显然，对于这些海量的数据集的分析，传统的单分子的分析方法已经不再适用。因此，对于这些数据集的分析，人们借鉴了传统群落生态学的分析方法，即找出这些分子的ɑ和β多样性，从而评估分子特征对样本特征的影响。然而，待检测样本和数据采集的方法和过程均会产生偏差和数据噪音，这些偏差和噪音会严重影响对分子多样性的评估，进而影响结论的准确度。近期一篇发表在Microbiome的评论文章对实验技术产生的偏差和数据噪音对分子多样性的影响进行了探讨，讨论了在何种条件下这些偏差会显著影响对数据集的ɑ和β多样性的分析，进而强调如何采用群落生态学中常用的新方法来改进多元分子数据的解释和集成。

多组学技术元数据集影响因素分子生态学（MME）数据技术偏差

部分随机、患者偏好试验

Lancet子刊：部分随机、患者偏好试验助力解决IBD临床研究患者招募难题（评论）

长期以来，随机对照试验（RCT）被认为是评估炎症性肠病（IBD）临床干预措施的金标准。但是，RCT面临着日渐严重的患者招募率和参与率下降的问题。很多患者也因对干预措施有强烈的偏好或反对而拒绝参加RCT。近日，Lancet Gastroenterology & Hepatology发表评论指出，初步数据表明部分随机、患者偏好的临床试验可以解决选择偏差和低可靠性问题，有望成为破解IBD临床试验患者招募难题的替代选择。

部分随机、患者偏好试验炎症性肠病（IBD）随机对照试验评论

航天微生物学

航天微生物学亟待发展

微生物是地球上最大类群的生物，与人类的健康和疾病息息相关。但随着人类不断的开展太空探索，这些微生物也随着宇宙飞船与人类一起进入了外太空。例如在“和平”号空间站，人们已经检测到234种微生物。空间站的这些微生物群落与宇航员的健康和生存的环境稳态有着密切的关系，因此人类如何通过调控空间站的微生物从而实现对于外太空生存环境的管理是未来外太空探索的一项重要的任务。近期一篇发表在Nature子刊Nature Microbiology上的评论对于空间站微生物群落的研究进行了简单的总结，并对未来的方向提出了新的看法。

航天微生物学航天员健康飞行器可持续性微生物新表性微生物新机制

微生物组创新

Nature子刊：微生物组创新助力可持续发展（评论）

联合国可持续发展目标以生物经济战略为主要策略，实现可持续发展和减缓气候变化。Nature Microbiology发文，阐述联合国采用‘可持续发展目标’中关于微生物组创新的部分。值得借鉴和响应。

微生物组创新可持续发展目标评论政策建议

关于加强SARS-CoV-2与微生物组研究的倡议（评论）

尽管COVID-19大流行是由SARS-CoV-2单一病毒引起的，人类微生物组整体却与疾病息息相关，并同时影响疫苗的反应、效力。在mSystems上，新进成立的微生物组中心联盟（MCC）COVID委员会通过调查，向其成员发出倡议，通过协调、协助的方式促进微生物组在COVID-19大流行中的研究整合，加大微生物学家在新冠肺炎研究中参与程度，包含技术支持、规章条例的改善、交流、基础病理研究以及与公众的对话等，值得参考。

新冠疫情微生物组 COVID-19 MCC SARS-CoV-2

Lancet子刊：微塑料入侵人体，但其影响尚未知（评论）

越来越多的证据表明，环境中积聚的微塑料逐年增长。近期The Lancet Gastroenterology and Hepatology发表的一篇评论文章，阐述了人们摄入微塑料的可能来源（双壳软体动物、瓶装水和茶包等），及几条微塑料可能影响人体健康的机制。但作者指出，现有证据可以表明人体已被微塑料侵入，但需要更多研究来探讨微塑料是否以及如何影响人体健康。

微塑料营养胃肠道健康评论

Lancet子刊：肠道疾病患者不应尝试生酮饮食（评论）

生酮饮食在治疗癫痫上有一定效果，且动物实验表明生酮饮食的神经保护作用可能由肠道菌群介导。那么，肠道疾病患者可以采取生酮饮食吗？The Lancet Gastroenterology and Hepatology近期发表的一篇评论文章，对此提出了三个值得担忧的原因。作者指出，目前缺乏关于生酮饮食对肠道疾病患者肠道功能，营养素摄入和肠道菌群影响的证据，且生酮饮食对健康的长期影响，特别是肠癌的影响，尚不清楚。因此，建议肠道疾病患者还是采取平衡的饮食模式。

生酮饮食营养评论 Jóhann P Hreinsson Jóhann P Hreinsson

儿童社会经济地位

如何看待儿童社会经济地位与成年期炎症因子水平有关这样的研究结论？（评论）

本篇评述从3个方面对上一篇Meta分析的结果进行了解读，回应了人们最关注的3个问题。由于Meta分析本身需要整合不同的研究结果，在回答一个临床问题的同时，也有可能带来更多的问题，需要人们关注。对上一篇Meta分析感兴趣的读者，可结合该评论一同阅读，更好地理解原作者的研究意义。

儿童社会经济地位评论炎症因子荟萃分析 Curtis Huttenhower

Nature Reviews：肠道菌群是食物过敏的关键因素？

《Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology》近期发表评论，通过总结已有的动物研究和人类菌群移植研究，强调了肠道菌群很可能在食物过敏中发挥重要作用，并指出菌群调控手段有望用于缓解食物过敏。

食物过敏菌群-宿主互作评论食物过敏菌群调控

病原菌溯源

Nature Reviews：利用“机器学习”鉴定感染源会有多精确？

肠道沙门氏菌是全球食物中毒的主要原因，其多种血清亚型与特定宿主相关。本文介绍了两个团队独立开发的用于伤寒沙门氏菌溯源的“机器学习”模型，比较并探讨了两种模型的差异性，对开发病原菌溯源的数据分析平台具有参考价值。

病原菌溯源机器学习评论方法学机器学习

Gut：菊粉的益生元作用：不仅与双歧杆菌有关

这是对之前我们分享过的一篇文章（http://www.xunludkp.com/papers/read/1062555528）的评论，被评论的论文很精彩，这个评论其实也不错，一起推荐给大家。

菊粉 inulin 其他以人为对象的临床试验随机双盲对照实验（RCT）