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文章数：10篇

Nature子刊：武汉大学团队绘制大肠癌的增强子图谱

武汉大学的吴旻和叶梅作为共同通讯作者在Nature Communications发表文章，分析结直肠癌病人的肿瘤和癌旁组织的增强子和转录组变化，鉴定出多种CRC相关增强子和转录因子，可为结直肠癌的研究提供了重要的表观基因组资源和候选研究对象。

结直肠癌增强子超级增强子

Cell子刊：确保结肠特性的关键“开关”

不同肠段有不同的形态、结构和功能特征，这反映了不同肠段的干细胞群的组织特异性。在肠上皮细胞不断更新的过程中，这种组织特征是如何保持的？Cell Stem Cell近期发表的美国康奈尔医学院周乔团队的研究，为这一问题提供了解答。该研究揭示了成体肠道细胞的惊人的可塑性，鉴定出为肠干细胞和分化肠细胞赋予结肠特征的关键染色质因子SATB2，并阐释了SATB2调控回肠-结肠转化的分子机制。

结肠 SATB2 Intestine regeneration colonic mucosa stem cell conversion

SOX9阻断肠道分化，促进大肠癌进展

Gastroenterology近期发表的文章，发现SOX9是增强子驱动的干细胞样基因表达程序的中枢调节因子，可阻断肠道分户啊，促进结直肠癌进展，同时提示我们可针对SOX9开发靶向结直肠癌分化缺陷的疗法。

结直肠癌肠道分化 SOX9 增强子

鉴定增强子亚型，为肠癌治疗提供新策略

染色质失调是癌症的一个新特征。近期研究表明，在结直肠癌（CRC中存在增强子元件的畸变。然而，目前尚不清楚患者特异性的增强子特征是否能够应用于临床治疗。Gut近期发表的研究，通过对CRC进行全面地表观基因组分析，揭示了肿瘤发生过程中的染色质状态的演变，基于增强子特征定义了不同的患者亚型，并提出了针对不同亚型的治疗策略，为CRC精准治疗提供了新思路。

结直肠癌表观遗传增强子患者分层

Nature子刊：YAP/TAZ调控泛癌增强子或促进肿瘤维持

肿瘤的特征之一就是增强子功能失调，诱发异常的癌症转录程序和转录依赖性，导致表观遗传改变。Nature Communications近期发表的文章，通过对结直肠癌类器官的染色质状态进行分析，揭示出泛癌式增强子，且YAP/TAZ是其关键调控因子。提示我们YAP/TAZ共同促进增强子重编程，这是决定癌细胞状态的关键，可用于开发更好的治疗途径。

结直肠癌增强子表观遗传组 YAP/TAZ

PVT1-lncRNA或可作为大肠癌的预后生物标志物和潜在的治疗靶点

越来越多的证据表明，转录增强因子的失调在癌症发病中起着重要作用。发表在Molecular Cancer上的一项研究在全基因组范围内发现了大肠癌（CRC）中的增强因子——从PVT1基因座转录的PVT1长非编码RNA（PVT1 lncRNA），其转录活性受自身增强子甲基化介导的表观遗传控制。PVT1 lncRNA具有显著的高增强活性，最终负责调节MYC癌基因的表达。该研究结果表明，PVT1 lncRNA的表达是一个具有潜力的预后生物标志物和一个潜在的CRC治疗靶点。

结直肠癌 lncRNA PVT1 Myc 增强子

Nature：IBD风险相关增强子的作用机制

许多与自身免疫疾病及过敏性疾病相关的遗传变异集中在增强子区域，但大多数疾病相关增强子的功能尚未明确。染色体11q13.5上的基因多态性与克罗恩病、溃疡性结肠炎、I型糖尿病、哮喘等相关。来自Nature上发表的一项最新研究，在染色体11q13.5上鉴定出一个IBD风险相关的远端增强子，并发现了该增强子的作用机制：在CD4+ Treg中，该增强子通过招募转录因子STAT5及NF-κB，增强GARP蛋白的表达，以起到抑制结肠炎的作用。敲除该增强子的小鼠的Foxp3+ Treg缺失抑制结肠炎的能力，而在人Treg中，位于该增强子中的一个IBD相关SNP——rs11236797与GARP的表达降低相关。该研究提示，GARP或是治疗IBD的潜在靶点。

IBD Autoimmunity Gene regulation in immune cells Immunogenetics Treg

SWI/SNF(BAF) 染色质重组复合物

SWI/SNF缺失致癌机制：谱系特异性增强子失活

① 约20%恶性肿瘤存在SWI/SNF染色质重组复合物亚基的编码基因异常，在转录调控和抑制肿瘤中起重要作用；② 采用小鼠胚胎成纤维细胞和肿瘤细胞株模型，ChIP-seq等方法，SWI/SNF优先靶向远端谱系特异性增强子，与p300相互作用调控组蛋白H3赖氨酸27位点乙酰化，典型及非转录区的增强子对SWI/SNF的需求更大；③ SWI/SNF依赖性远端增强子是调控与发育过程相关基因表达的基础；④ 特定背景下，分化潜能的缺失，是SWI/SNF亚基缺失引起肿瘤形成的机制。

SWI/SNF(BAF) 染色质重组复合物谱系特异性增强子小鼠胚胎成纤维细胞 ChIP-seq分析

Leukemia：内含子区点突变驱动白血病发生

① LMO1（一个癌基因）在约60% T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）中高表达，LMO1基因增强子区存在脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽（APOBEC）标记突变（C到T）；② 对187例T-ALL标本测序，发现2.14%的病人在LMO1基因启动子上游4kb的内含子区存在一个特异点突变；③ 该点突变创造了一个MYB结合域，起到了增强子的作用，激发LMO1高表达；④ 其他类型的LMO1基因非编码区致癌驱动突变，可能存在于包括T-ALL在内的多种人类癌症中。

肿瘤 LMO1基因非编码区增强子驱动基因

Nature Genetics：遗传分析发现乳腺癌超级增强子

① 体细胞基因重排促进癌细胞的遗传变异，本研究系统分析了560个乳腺癌患者中基因充沛的情况，鉴定出了33个较大（>100kb）的串联重复的热点区域；② 这些串联重复的热点区，主要分布在乳腺癌遗传易感基因相邻位点（OR=4.28）、乳腺特异的超级增强子（OR3.54）；③ 这些串联重复区域，是双链DNA锻炼的高敏感区，是未来“二次打击”的高发区；④ 上述基因重排可能影响基因编码区，或基因转录调控序列，参与肿瘤的发生发展。

乳腺癌基因重排转录组增强子