结肠

克罗恩病（CD）是一种慢性胃肠道疾病，在全球范围内发病率不断上升。CD的病理机制是多因素的，涉及遗传、免疫和环境因素的复杂相互作用，了解其病因需要进行系统性的研究。Immunity近期发表的文章，通过对CD病人的回肠和结肠进行单细胞转录组测序，定义了CD的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的特性，并揭示出疾病相关的成纤维细胞中胶原生成的新的调节因子。

克罗恩病（CD）单细胞转录组结肠回肠

肠道免疫

Cell子刊：解析小肠和结肠组织驻留记忆性CD8+ T细胞的异质性

组织驻留的记忆性CD8+ T（TRM）细胞是记忆性T细胞的一个亚群，在限制早期病原体传播和控制感染方面发挥关键作用。TRM细胞在不同组织中表现出差异，但其在小肠和结肠不同的解剖部位是否具有异质性，还需进一步研究。Immunity近期发表的文章，发现来自小肠和结肠不同解剖部位的CD8+ TRM细胞具有独特的分子和功能特性，且小肠TRM的形成和维持对转录的要求也具有差异。

肠道免疫小肠结肠组织驻留性记忆T细胞

结肠

Cell子刊：确保结肠特性的关键“开关”

不同肠段有不同的形态、结构和功能特征，这反映了不同肠段的干细胞群的组织特异性。在肠上皮细胞不断更新的过程中，这种组织特征是如何保持的？Cell Stem Cell近期发表的美国康奈尔医学院周乔团队的研究，为这一问题提供了解答。该研究揭示了成体肠道细胞的惊人的可塑性，鉴定出为肠干细胞和分化肠细胞赋予结肠特征的关键染色质因子SATB2，并阐释了SATB2调控回肠-结肠转化的分子机制。

结肠 SATB2 Intestine regeneration colonic mucosa stem cell conversion

肠道黏液

Science：重新认识结肠黏液层及其对菌群的调控

肠上皮会分泌由黏蛋白组成的黏液，将肠道菌群与肠粘膜分隔开来。此前的模型认为，结肠中的黏液主要是由远端结肠产生并紧密黏附在肠上皮外，形成一道连续的屏障，为菌群提供生态位的同时也保护肠上皮。然而，Science最新发表的来自美国俄克拉荷马医学研究基金会Lijun Xia团队的研究，提出了一个不同的模型。该研究发现，结肠内的菌群和粪便物质会被近端和远端结肠分泌的黏液依次包裹住，形成一个个封闭的粪团。其中，近端结肠分泌的富含O-聚糖的黏液，不仅直接接触菌群为其提供生态位、调节菌群的结构和代谢功能，还是限制菌群与肠粘膜接触的主要屏障，在维持宿主-菌群的健康互作中起到关键作用。

肠道黏液黏蛋白-2 结肠菌群-宿主互作黏蛋白型O-聚糖

肠神经系统

Cell：对肠神经系统的单细胞分析发现了什么？

尽管肠神经元数量稀少（比如在结肠中，神经元在结肠细胞总数中只占不到1%），肠神经系统（ENS）对肠道功能起到重要的调控作用。但由于技术限制，这些神经元难以从组织中分离出来，导致人们一直缺乏对ENS分子特征的系统性研究。Cell最新上线来自美国Broad Institute的研究，开发了两种可用于对ENS和其它组织进行单细胞核RNA测序的方法（RAISIN RNA-seq和MIRACL-seq），并用这些方法分析了小鼠和人体肠道中的160万个细胞及其中的6513个肠神经元，揭示了肠神经元的非凡的多样性。该研究鉴定出几十个神经元亚群，揭示了不同因素（年龄、物种、生物节律、所处肠段等）对ENS的组成和基因表达的影响，以及肠神经与其它肠道细胞之间的潜在互作，并为肠神经元通过神经-免疫互作机制参与肠道和肠外疾病提供了新证据。

肠神经系统 Enteric nervous system ENS enteric neuron single cell

结直肠癌

大肠癌患者亲属应何时开始筛查？

虽然结直肠癌（CRC）筛查指南认为有必要对高危个体进行早期筛查，例如具有CRC家族史的人，但并没有明确证据证明这些高危个体应提前多少年开始进行筛查。最新发表在Gastroenterology的研究收集了瑞典全国家庭癌症数据集的数据，为CRC患者的近亲或远亲确定了风险适应的CRC筛查起始年龄。

结直肠癌 familial colon rectal inherited

脆弱拟杆菌

Nature子刊：hsRNA-seq揭示出脆弱拟杆菌在结肠不同空间的生理机能

《Nature Microbiology》发表的文章，利用杂交选择RNA测序（hsRNA-seq）对分布在小鼠结肠腔、粘液或上皮组织的脆弱拟杆菌进行转录组分析，揭示出其在结肠不同空间的生物机能。同时，与传统RNA-seq相比，hsRNA-seq对粘液和组织的脆弱拟杆菌基因组的读写能力分别提高了48倍和154倍，可对不同生物地理位置进行高保真的比较。

脆弱拟杆菌 Bacterial host response microbial ecology Microbiome RNA sequencing

肠神经系统

Nature：肠道菌群如何作用于结肠神经，调控肠道蠕动？

肠道蠕动对消化健康和抵御肠道致病菌入侵有重要意义，肠腔内环境（比如饮食和菌群因素）可作用于肠神经，从而调控肠道蠕动，比如清除菌群的小鼠呈现肠神经元兴奋性降低、肠道运输时间变长等表型，但背后的分子机制尚不明晰。Nature上线的一项最新研究表明，肠神经回路中的芳香烃受体（AHR）信号，是连接菌群等肠腔环境因素与肠神经功能的枢纽，在肠道运动调控上有重要作用。用药物或饮食干预来调节控制肠道蠕动的肠神经元的AHR活性，或能改善肠道蠕动障碍相关的胃肠疾病。

肠神经系统 Enteric nervous system Neurophysiology 菌群-宿主互作肠道菌群

活体成像

Nature子刊：活体成像在细胞层面看清小鼠结肠内的动态变化

活体内显微技术可以在动物中以单细胞分辨率观察动态过程，但受限于结肠的自主运动，以及容易引起结肠梗阻，这种技术一直无法在结肠中应用。Nature Communications近期报道了一种新方法，可解决小鼠结肠活体成像时的上述问题，能实现对在若干天内对小鼠结肠同一部位在细胞层面进行一系列的活体成像，可用于研究结肠内的多种生理过程。

活体成像结肠荧光成像 Chrysothemis C Brown Chrysothemis C Brown

人肠上皮细胞

国内团队：单细胞分析揭示人类不同肠段上皮细胞的组成和功能差异

肠上皮细胞在消化吸收营养物质、抵抗微生物感染和分泌激素方面，有重要作用。目前，对于肠上皮细胞类型的认知大多来源于小鼠研究，对人类肠道细胞类型的特异性标志物和功能划分尚不清楚。清华大学陈晔光和杨雪瑞团队，与北京大学第三医院付卫团队的合作研究，首次在单细胞分辨率上，对人类不同肠段（回肠、结肠和直肠）的上皮细胞基因表达谱进行了分析，为进一步研究人类肠细胞的组成和功能，及其在相关疾病中的作用，打下重要基础。

人肠上皮细胞单细胞RNA测序回肠结肠直肠

慢性心理应激

菌群如何影响慢性压力中的行为

Brain Behavior and Immunity发表的一项研究，通过对无菌小鼠和有菌的SPF小鼠进行对比，表明在慢性社会压力下，菌群可影响HPA轴活性和糖皮质激素的局部代谢，并改变应激行为。

慢性心理应激小鼠菌群结肠肾上腺

氧化锌

FM：饮食中高含量的氧化锌调节断奶仔猪的回肠和结肠菌群

广东农科院团队的研究，推荐阅读。

氧化锌断奶仔猪肠道菌群回肠结肠

肠道菌群

FP：交感神经如何与肠道菌群互作？

一篇关于交感神经和肠道菌群互作的文献，很值得一读，特别推荐。

肠道菌群免疫细胞交感神经系统驱动骨髓结肠