Genome Biology

搜索
登录

Genome Biology

文章数：8篇

GB：肥胖相关菌群如何影响肠道表观基因组

这是近期在Genome Biology[IF：11.908]发表的肥胖相关的菌群研究。总体来说，饮食对菌群有强大的塑造作用，菌群-饮食的互作可“重编”肠道上皮的表观基因组，改变相关基因表达，从而影响肥胖风险。有意思的是，移植了肥胖菌群的小鼠即使吃普通食物，也表现出一定程度的血糖问题，而正常菌群则可以帮助小鼠在吃高脂食物时少长肉，再次强调肥胖和代谢问题中菌群的作用。值得关注，推荐给大家。

肥胖结直肠癌表观遗传学转录因子基因表达

多组学研究

GB：一文读懂菌群多组学分析（必读综述）

这是Genome Biology[IF：11.908]发表的关于如何通过整合多组学数据对菌群进行研究分析的必读综述，这是很有指导意义的方法学干货集合，值得专业人士细读精读。

多组学研究分子流行病学定量分析 Lee-Ching Lew Heping Zhang

参考基因组

GB：不依赖于参考基因组的宏基因组分析算法——MetaGen

一篇宏基因组学方法学相关文献，推荐专业人士阅读。

参考基因组宏基因组分析 Binning metagenomics Mixture model

强制性脊柱炎

Genome Biol：强直性脊柱炎的肠道菌群特征

这是浙江中医药大学、锐翌基因等团队合作的成果，对强直性脊柱炎患者的肠道菌群以及相关基因进行了分析，值得好好看看，特别推荐。

强制性脊柱炎 Ankylosing spondylitis Human gut microbiome Biomarkers Pathogenesis Yang Shen Jintian Xu Songnian Hu

Gene prediction

赵方庆团队：无需参考基因组而直接识别基因的新算法

中科院北京生科院赵方庆老师和团队关于基因构建的方法学文献，很值得一读。

Gene prediction phylogenomics Transcriptome de Bruijn graph Giovanni Cammarota

肠道菌群研究

GB：如何避免菌群研究得到不正确生物学结论？（综述）

最近发表在Genome Biology [IF 11.313]的一篇重要综述，特别提醒大家在研究中需要避免技术上的偏差而导致的不正确的生物学结论，非常好的文章，强烈推荐给大家！

肠道菌群研究 Robert Häsler Philip Rosenstiel

Fecal microbiome

GB：通过3666名双胞胎确定的粪便菌群与肥胖的相关性

这是一群大佬合作在Genome Biology 发表的重要文章，对3666名双胞胎的粪便菌群及肥胖情况进行分析，再次确认粪便菌群的低多样性与肥胖相关，特别是内脏脂肪与细菌的相关性。这篇文章MC之前没有重点推荐，其实非常重要，强烈推荐阅读！

Fecal microbiome Genetic association Heritability Obesity Twins

病原体检测

Genome Biology：新的交互式宏基因组分析工具

生物信息分析的新工具，转需！

病原体检测宏基因组分析交互式分析 Kyungsun Han Hojun Kim