Shalev Itzkovitz

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Shalev Itzkovitz

文章数：13篇

Nature子刊：脱落肠细胞的细胞状态和命运

传统的肠细胞更替的观点认为，肠上皮细胞从组织分离后立即死亡。与这一观点相反，近期发表于Nature Metabolism的一项研究表明，脱落的上皮细胞在小鼠中仍然可以存活几个小时，它们在脱落后，会进一步上调基因，包括抗菌程序。另外，不仅上皮细胞持续脱落，而且各种免疫细胞群也持续脱落。本研究提示，肠道中的脱落细胞可反映病理过程，因此可以用来探测胃肠道生物学。

粪便宿主转录组可预测IBD患者的组织学缓解

来自Gut上发表的一项前瞻性队列研究结果，对20名IBD患者及19名对照的结肠活检样本与粪便洗液进行分析后发现，相比于活检样本转录组，粪便宿主转录组可更好地预测患者的组织学炎症或缓解状态。

IBD 预后标志物研究论文前瞻性队列研究

回肠上皮细胞

Nature子刊：肠上皮的RNA是否能可靠地指代蛋白质？

使用转录组作为蛋白质组的可替代指标一直存在争议。空间转录组学已证明肠细胞基因表达有显著的分区现象，但这种分区性如何转化为蛋白质的含量尚不清楚。近期Nature Metabolism发表的研究显示，肠细胞沿着绒毛轴的蛋白和mRNA常常在空间上存在不一致性。许多基因的蛋白质呈带状分布于绒毛尖端，但mRNA呈带状分布于绒毛底部。该研究证明的不依赖空间的蛋白质合成延迟可以解释许多mRNA-protein不一致性的问题，并强调了利用肠上皮的蛋白质空间组学对于推断非稳态下的组织或细胞状态的重要性。

回肠上皮细胞 RNA与蛋白质的不一致性空间分布蛋白合成延迟

肠内分泌细胞

Nature子刊：人类胎儿肠道中存在可分泌胰岛素的细胞

Nature Medicine上发表的一项最新研究结果，从4个胎儿及2个新生儿中获取小肠样本，并进行单细胞测序分析，发现在胎儿发育早期阶段，肠内分泌细胞可分泌胰岛素，但在出生后，新生儿的肠内分泌细胞不再拥有此功能。

肠内分泌细胞胎儿发育研究论文基础研究胰岛素

神经-免疫互作

Cell子刊：肠神经如何调控肠道Treg？

来自Immunity上发表的一项最新研究，报道了肠道神经系统与肠道免疫系统的互作新机制：肠道神经元可通过产生IL-6，抑制可识别肠道共生菌群的肠道调节性T细胞（Treg）的分化，但可增加RORγ+ Treg的比例；而肠道共生菌群的定殖可抑制肠道神经元的IL-6表达，从而促进菌群特异性Treg的产生。

神经-免疫互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠） IL-6

肠道干细胞

Nature子刊：一个新的细胞类群——Lgr5+肠绒毛顶端特络细胞

肠道干细胞在维持肠上皮各类细胞的稳态中发挥重要的作用。Lgr5是肠道间充质干细胞的细胞标志，一直以来仅发现存在于肠道绒毛的隐窝间质中。近来一篇发表在Nature Communication的研究论文，通过应用激光显微切割的方法分离得到了肠绒毛隐窝至顶端的间质细胞，通过单细胞测序技术详细分析了这些基质细胞的空间分布特征，更重要的是发现了一类可以表达Lg5且分布于肠绒毛顶端间质的特络细胞（telocytes），清除这些细胞会导致绒毛顶端肠细胞基因表达的显著改变，影响肠道功能。这一新的细胞类群的发现，为肠道细胞稳态的维持提出了新的观点。

肠道干细胞 differentiation Extracellular signalling molecules intestinal stem cells Single-cell imaging

Nature Reviews：一文读懂肝脏内的细胞分区（综述）

肝小叶是肝脏的结构和功能单位，以中央静脉为中心，呈多面棱柱状。肝小叶中的细胞功能和基因表达并非均一性的，而是呈现多种区带化（zonation）特征。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology发表的这篇综述对此进行了详细介绍，值得专业人士参考。

肝脏 Xiaoyan Wu Yaoyao Xia Congrui Zhu Wenkai Ren

Cell：又是单细胞水平！肠绒毛不同区域的细胞有不同功能

肠上皮细胞具有多样化的功能，不仅参与各种营养物质的吸收，还要防御肠内微生物的入侵。Cell近期发表的一项研究，用单细胞空间转录组学方法，揭示了小肠绒毛中，肠细胞广泛的区域和功能异质性，将对肠上皮细胞基因表达和功能的认知的精度，又提高了一个水平，相关方法学也可用于其他组织器官的类似研究。这是Cell近期连续发表的第2项肠道领域的单细胞水平研究，另一项研究见此（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1064546867），scRNA-seq等单细胞分析技术不断成熟，将越来越多的出现在高水平研究中。

肠绒毛激光捕获显微切割转录组测序单细胞RNA测序单细胞转录组学

Cell：抗生素治疗后，益生菌干预不利于菌群复原

抗生素治疗后常用益生菌来调理菌群失调，但尚不清楚该过程中益生菌在肠粘膜菌群重建中扮演什么角色。Cell刚刚发表来自以色列魏茨曼研究所两位Eran等主导的另一项研究，表明抗生素治疗后的益生菌干预，并不利于肠粘膜菌群和肠道基因表达的复原，而自体粪菌移植（aFMT）可使其快速恢复。这些发现提示，aFMT或个性化益生菌干预，应是抗生素后促进菌群复原的更佳方法。

益生菌抗生素肠道菌群 Mohammad Miri Ramezanali Khamirchi

肠粘膜菌群

Cell：未来趋势——个性化益生菌干预

益生菌被认为有益健康甚至能预防疾病，然而益生菌在肠粘膜的定殖情况仍待研究。Cell刚刚发表了来自以色列魏茨曼研究所两位Eran等主导的最新研究，分析了小鼠和人体消化道不同部位的样本，提出不应用粪便菌群来近似估计肠粘膜菌群。还通过多组学方法，着重分析了益生菌在人体肠粘膜的定殖情况和规律，及其对宿主的影响。这些结果表明，益生菌干预的效果可存在很大的个体间差异，因此个性化干预应是未来研究和转化应用的趋势。

肠粘膜菌群益生菌粪便菌群肠粘膜菌群个性化干预

肠道干细胞

Nature：肠道干细胞需要来自特络细胞的Wnt信号

美国宾夕法尼亚大学近期一项研究在Nature发表，该研究在小鼠中鉴定出位于肠上皮下的一种大而罕见的间充质细胞——特络细胞（telocyte），是向肠隐窝分泌的Wnt配体的重要来源，在肠道干细胞增殖和肠上皮更新中起关键作用。

肠道干细胞特络细胞 Wnt信号通路

天然淋巴细胞

Cell：肠道菌群塑造天然淋巴细胞谱系和调控

最新上线的Cell，介绍小肠天然淋巴细胞的转录及表观遗传学特征，3种经典天然淋巴细胞亚型的细胞因子表达及代谢活性之间的区别，以及肠道菌群对此有什么影响，很大的article，又特别关注了肠道菌群和ILC。菌群和ILC，还会有很多令人激动的进展。

ILC 天然淋巴细胞表观基因组先天淋巴细胞微生物群

Science：肠道菌群等因素影响小胶质细胞的发育

Science上最新的一项研究，确定人自身基因、肠道菌群以及各种影响免疫活性的环境因素，都会影响小胶质细胞的发育，同时鉴定出三个细胞发育的关键事件阶段。推荐关注的人必读！

表达谱神经发育肠脑轴小胶质细胞全基因组关联分析