预后标志物

预后标志物研究论文结直肠癌肝转移 GPNMB SERPINB2

预后标志物溃疡性结肠炎研究论文类固醇队列研究

Nature子刊：RNF43突变可预测BRAF V600E突变型转移性大肠癌对抗BRAF/EGFR联合治疗的应答

近期，抗BRAF/EGFR联合治疗（encorafenib+cetuximab）被FDA批准用于BRAF V600E突变的转移性结直肠癌治疗，但有大部分的患者不应答。Nature Medicine上发表的一项最新研究结果，发现在接受抗BRAF/EGFR联合治疗的微卫星稳定的转移性结直肠癌患者中，RNF43的失活突变与更高的应答率、更长的无进展生存期及总生存期相关。

预后标志物研究论文 BRAF V600E突变转移性结直肠癌 RNF43

药物反应

国内团队：肠道菌群可预测类风湿关节炎患者对甲氨蝶呤的应答

山西医科大学第二医院的李小峰团队在Rheumatology上发表的一项队列研究结果，在类风湿关节炎患者中发现，以普氏菌属为主的肠型与患者对甲氨蝶呤治疗的临床应答相关。

药物反应菌群-药物互作研究论文队列研究甲氨蝶呤

瘤内菌群

国内团队JAMA子刊：鼻咽癌患者的瘤内细菌负荷可作为预后指标

JAMA Oncology近期发表了中山大学肿瘤防治中心柳娜团队的研究，纳入802名鼻咽癌患者，分析了瘤内菌群与患者预后的关联，表明瘤内细菌负荷可作为鼻咽癌患者的预后指标，对于患者分层和临床决策有潜在的指导意义。

瘤内菌群鼻咽癌预后标志物

减肥手术

肠道菌群影响减肥手术对2型糖尿病的疗效

减肥手术 Roux-en-Y胃旁路术研究论文 2型糖尿病预后标志物

结直肠癌

JAMA子刊：结直肠癌术后复发监测，ctDNA并不优于传统手段

JAMA Network Open上发表的一项回顾性队列研究结果，在48名结直肠癌切除患者中发现，相比于传统的影像+癌胚抗原检测，循环肿瘤DNA（ctDNA）检测的敏感度更低（53.3% vs. 73.3%）。

结直肠癌研究论文回顾性队列研究预后标志物循环肿瘤DNA（ctDNA）

IBD

粪便宿主转录组可预测IBD患者的组织学缓解

来自Gut上发表的一项前瞻性队列研究结果，对20名IBD患者及19名对照的结肠活检样本与粪便洗液进行分析后发现，相比于活检样本转录组，粪便宿主转录组可更好地预测患者的组织学炎症或缓解状态。

IBD 预后标志物研究论文前瞻性队列研究

IBD

IBD病程及疗效预测的潜在生物标志物（综述）

Gastroenterology上发表的一篇评论文章，详细讨论了可能用于IBD患者的病程预测及疗效预测的潜在生物标志物，包括临床因素、遗传因素、转录组、蛋白组、菌群、细胞亚群等。

IBD 预后标志物疗效预测标志物综述

低FODMAP饮食

肠道菌群或可预测IBS患者对低FODMAP饮食的应答

低FODMAP饮食对肠易激综合症（IBS）患者有益。来自Gut上发表的一项最新研究，对比了56名IBS患者在低FODMAP饮食干预前后的粪便菌群变化，发现干预前的肠道菌群组成及功能与患者对低FODMAP饮食的临床应答相关。

低FODMAP饮食 IBS 研究论文基础研究饮食-菌群互作

结直肠癌

秦环龙团队：大肠癌中的“坏”细菌，或能在免疫治疗中发挥“好”作用

很多研究显示，结直肠癌（CRC）中的具核梭杆菌是促癌的“坏”细菌，能增强CRC的化疗耐药性、抑制免疫。同济大学附属上海第十人民医院秦环龙和蔚青作为共同通讯作者在Signal Transduction and Targeted Therapy上发表的一项最新研究却发现，具核梭杆菌对CRC治疗可能也有“好”的一面——增强抗PD-L1免疫治疗的效果，并阐释了相关作用机制。这些发现揭示了具核梭杆菌在CRC免疫治疗中的新作用，并为临床预测PD-1/PD-L1阻断治疗的疗效提供了潜在的生物标志物。

结直肠癌癌症免疫疗法具核梭杆菌预后标志物 gastrointestinal cancer

DNA甲基化

中山六院：CD8+ TIL的DNA甲基化可用于评估结直肠癌患者的预后

肿瘤浸润淋巴细胞（TIL），尤其是CD8+ TIL可用于预测肿瘤患者对免疫治疗的应答及预后，但目前仍需要依赖于组织病理学分析。中山大学附属第六医院的骆衍新团队及Huichuan Yu团队在Journal for ImmunoTherapy of Cancer上发表的一项最新研究，发现基于CD8+ TIL的DNA甲基化特征，可很好地反映CD8+ TIL的数量及CD8B基因的表达水平，并可用于预测结直肠癌患者的预后。另外，CD8+ TIL的DNA甲基化特征还与微卫星稳定性相关，同时也可能用于预测肺癌、宫颈癌、乳腺癌患者的预后。

DNA甲基化研究论文肿瘤浸润淋巴细胞结直肠癌预后标志物

预后标志物

浙大二院：影响结肠癌患者预后的关键免疫基因

浙江大学医学院附属第二医院的丁克锋团队在Clinical and Translational Medicine上发表的一篇Letter，鉴定出了11个与结肠癌预后相关的关键免疫基因，并通过单细胞测序揭示了这些基因影响结肠癌预后的潜在分子机制。

预后标志物基础研究研究论文结直肠癌单细胞测序

肿瘤耐药

Nature子刊：特定突变特征可促进大肠癌患者对西妥昔单抗的耐药性

EGFR单抗可有效治疗KRAS/NRAS野生型结直肠癌，但通常会导致获得性耐药。Nature Ecology & Evolution上发表的一项最新研究，对比了21名接受西妥昔单抗治疗的结直肠癌患者在基线及疾病进展时期的突变特征，发现一种化疗相关突变特征——SBS17b可促进西妥昔单抗耐药突变（KRAS/NRAS Q61H及EGFR S492R）的产生，且这种突变特征与西妥昔单抗治疗后的较差预后相关。

肿瘤耐药 EGFR单抗研究论文基础研究结直肠癌

乙肝相关慢加急性肝衰竭

高志良、杨瑞馥等：肠道菌群或可作为乙肝相关慢加急性肝衰竭的预后标志物

中山大学附属第三医院的高志良团队、军事医学科学院微生物流行病研究所的杨瑞馥团队与合作者在Gut Microbes上发表的一项最新研究，对比分析了乙肝病毒相关慢加急性肝衰竭（HBV-ACLF）患者、慢性乙肝（CHB）患者、乙肝病毒相关性肝硬化（HBV-LC）及健康对照的肠道菌群差异，发现HBV-ACLF患者中的球菌/杆菌比升高，肠球菌属等与HBV-ACLF的进展相关，而粪杆菌属等与病情缓解相关。

乙肝相关慢加急性肝衰竭研究论文基础研究预后标志物

ctDNA

国内团队：ctDNA或可预测结直肠癌的术后复发风险

中山大学的徐瑞华团队、王峰团队、复旦大学的蔡三军团队与浙江大学附属第二医院的丁克锋团队在Journal of Hematology and Oncology上发表的一项前瞻性队列研究结果，在240名接受手术的II/III期结直肠癌患者中发现，术后或辅助化疗后的ctDNA阳性与更高的复发风险相关，而基于ctDNA可较准确地预测患者的复发风险，并相比于影像学手段提前5个月检测到复发。该研究结果提示，ctDNA或可用于结直肠癌的术后复发风险预测及复发监测。

ctDNA 研究论文结直肠癌预后标志物前瞻性队列研究

循环肿瘤DNA（ctDNA）

中山大学：ctDNA用于肠癌肝转移切除术+辅助化疗的预后预测

中山大学的徐瑞华团队、李宇红团队等在Theranostics上发表的一项最新研究，在91名接受结直肠癌肝转移切除术（CRLM）+辅助化疗的患者中发现，术后及辅助化疗后可检测到循环肿瘤DNA（ctDNA）与较差的预后（更短的无复发生存期）相关，其中辅助化疗后的ctDNA状态可更好地预测患者的预后。

循环肿瘤DNA（ctDNA）研究论文预后标志物结直肠癌肝转移辅助化疗

肿瘤微环境

肿瘤微环境中的髓系免疫细胞影响大肠癌预后

Journal for ImmunoTherapy of Cancer上发表的一项最新研究，对结直肠肿瘤微环境中的CD14+ 单核细胞及CD15+ 粒细胞进行分析，发现成熟的CD14+ HLA-DR+ 细胞的浸润及其与肿瘤细胞的接近与更好的结直肠癌预后相关，而未成熟的CD14+ HLA-DR- 细胞的浸润则相反。

肿瘤微环境研究论文 CD14+ 细胞 CD15+ 细胞结直肠癌

预后标志物

江南大学附属医院：FOXP3及CTLA4表达影响大肠癌预后

在多种癌症中，FOXP3及CTLA4的过表达与免疫抑制性肿瘤微环境及较差的预后相关，但在结直肠癌中的情况似乎相反。江南大学附属医院的黄朝晖团队在Oncogene上发表的一项最新研究，发现FOXP3及CTLA4的高表达均分别与结直肠癌患者较长的总生存期相关，但对于FOXP3高表达+CTLA4极高表达的结直肠癌患者，其总生存期显著短于FOXP3低表达患者及FOXP3高表达+CTLA4相对低表达患者，且其肿瘤微环境表现为免疫过载特征。

预后标志物研究论文队列研究 CTLA-4 FOXP3

结直肠癌

陈豪燕+洪洁+房静远：肿瘤微环境的基因表达特征，影响大肠癌预后

来自上海交通大学医学院附属仁济医院的陈豪燕、洪洁、房静远与研究团队在npj Precision Oncology上发表的一项最新研究，通过分析来自18个数据库的2269份结直肠癌患者的RNA测序数据及来自4个数据库的单细胞RNA测序数据，鉴定出了6种结直肠癌患者的肿瘤微环境基因表达特征亚型，可能影响患者的总生存期、无病生存期及对不同治疗（化疗、EGFR抑制剂）的应答。

结直肠癌化疗耐药肿瘤微环境预后标志物研究论文

结直肠癌

中山大学：预测大肠癌辅助化疗预后的新标志物

CMTM6是PD-L1的调控因子，在多种肿瘤中表达，可调节肿瘤免疫微环境。中山大学的刘然义团队在Journal for ImmunoTherapy of Cancer上发表的一项最新研究，纳入156名接受辅助化疗及77名未接受化疗的结直肠癌患者，发现肿瘤组织中的CMTM6及PD-L1的高表达与更多的淋巴细胞肿瘤浸润及更好的预后相关。

结直肠癌研究论文基础研究 CMTM6 PD-L1

肠-脑轴

尹恝+周宏伟+何彦：脑卒中与肠道菌群失调的双向互作

中风（脑卒中）是导致死亡和残疾的一个重要原因，目前仍缺乏有效的神经保护防治手段。中风的许多风险因素都与肠道菌群有关，然而，中风和肠道菌群之间的作用关系仍待深入研究。Gut最新发表了来自南方医科大学珠江医院尹恝、周宏伟和何彦与团队的一项研究，揭示了中风与肠道菌群失调之间的双向互作关系：缺血性脑卒中会迅速引发肠道菌群失调、肠杆菌科细菌过度生长，而这种菌群失调反过来会加重脑梗死。该研究进一步阐明了这一现象背后的生物学机制，为临床预后预测和防治干预，提供了具有转化价值的新思路。

肠-脑轴中风肠道菌群肠杆菌科预后标志物

液体活检

国内团队：ctDNA甲基化检测或可用于大肠癌诊断及术后监测

来自温州医科大学的丁春明团队、金胜男团队及温州医科大学附属第一医院的徐昶团队在PNAS上发表的一项最新研究，开发了一种利用qPCR定量分析DNA甲基化的ctDNA检测方法，能够以超过80%的灵敏度及特异性诊断结直肠癌，并可有效地预测患者的术后复发。

液体活检研究论文基础研究结肠癌生物标志物

克罗恩病

张婷、刘占举等：肠道菌群组成及代谢影响英夫利昔单抗对儿童克罗恩病的疗效

上海市儿童医院的张婷团队、于广军团队及上海市第十人民医院的刘占举团队在Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现克罗恩病（CD）患儿肠道菌群中的短链脂肪酸（SCFA）产生菌减少，且粪便中的SCFA及非结合胆汁酸的水平降低，而英夫利昔单抗（IFX）治疗可通过富集SCFA和胆盐水解酶（BSH）产生菌，从而抑制炎症，并恢复胆汁酸代谢。另外，该研究鉴定出了与对IFX治疗持续应答相关的特定菌属及粪便代谢产物。

克罗恩病研究论文预后标志物英夫利昔单抗儿童克罗恩病

转移性结直肠癌

夏丽敏+吴开春：CXCL12-HOXB5-CXCR4回路促进结直肠癌转移

结直肠癌转移的分子机制尚未完全明确。西京医院的夏丽敏和吴开春与研究团队在Theranostics上发表的一项最新研究，发现CXCL12可通过上调HOXB5的表达，以反式激活CXCR4及ITGB3的表达，从而在体外及体内促进结直肠癌转移。在结直肠癌患者中，HOXB5的表达与CXCR4及ITGB3的表达正相关，并与肿瘤转移、肿瘤复发、较短的生存期相关。在结直肠癌小鼠模型中，敲低HOXB5可抑制CXCL12介导的结直肠癌转移，而CXCR4抑制剂处理也可减少HOXB5介导的结直肠癌转移。该研究结果提示，CXCL12-HOXB5-CXCR4信号通路可促进结直肠癌转移，而HOXB5或可作为结直肠癌患者的预后标志物。

转移性结直肠癌研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）细胞系实验

结直肠癌

南京鼓楼医院：基于特定基因表达谱预测结直肠癌患者的总生存期

南京鼓楼医院的Pin Wang团队及邹晓平团队在Clinical and Translational Medicine上发表的一篇letter，鉴定出78个与结直肠癌患者总生存期相关的基因，并基于其中的15个基因计算预后分数，可显著区分出总生存期长、中等及较短的3组患者。

结直肠癌研究论文基础研究预后标志物

胃食管腺癌

胃食管腺癌患者的预后预测模型

影响进展期胃食管腺癌（mEGAC）患者预后的因素尚未明确。来自Gut上发表的一项最新研究，对比了短生存期与长生存期mEGAC患者的外显子组、转录组、免疫谱及病理学表型，并基于特定基因（APOBEC）的突变状态、特定基因的表达谱、4号染色体杂合性、印戒细胞组织学表型建立的预后模型，可显著区分出预后较好及较差的mEGAC患者。

胃食管腺癌预后标志物研究论文队列研究

菌群-药物互作

肠道菌群影响甲氨蝶呤对RA患者的疗效

约50%的类风湿关节炎（RA）患者对甲氨蝶呤治疗不产生充分的应答，但缺乏可预测患者应答的预后标志物。Arthritis and Rheumatology上发表的一项最新研究，对比分析了对甲氨蝶呤治疗应答及不应答的RA患者在治疗前的肠道菌群差异，发现基于菌群建立的模型可较准确地预测患者对甲氨蝶呤治疗的应答。另外，体外共培养肠道菌群与甲氨蝶呤的结果表明，肠道菌群对甲氨蝶呤的代谢或清除可能抑制甲氨蝶呤的治疗效果。

菌群-药物互作研究论文基础研究队列研究类风湿关节炎

IBD治疗

粪便菌群或可预测英夫利昔单抗治疗IBD的效果

约1/3的IBD患者对英夫利昔单抗（IFX）治疗不应答，但目前尚无可预测IBD患者对IFX的应答的生物标志物。Journal of Crohn's and Colitis上发表的一项队列研究结果，对比了在接受IFX治疗前后，应答及不应答的IBD患者的粪便菌群（包括细菌及真菌）差异，发现应答患者与不应答患者在治疗前的粪便细菌及真菌组成均有显著差异，而基于细菌分类群可较准确地预测患者对IFX治疗的应答情况。

IBD治疗研究论文队列研究 IBD 英夫利昔单抗

流感

金梅林等：肠道里特定双歧杆菌保护小鼠抵抗流感

近年研究显示，肠道菌群可能通过调节宿主免疫应答，来影响宿主对流感的抵抗力。《Genome Biology》最新发表了来自华中农业大学金梅林团队、陈玲玲团队与诺禾致源团队的合作研究，采用半致死剂量的H7N9流感病毒感染小鼠，对600多份样品进行16s测序以及170多份样品进行宏基因组测序，分析不同感染结局（存活vs死亡）的小鼠的肠道菌群组成和功能，以及粪菌移植等试验，揭示出与流感感染严重程度密切相关的肠道菌群变化特征，发现在流感感染后数量增多的动物双歧杆菌等肠道菌及其相关的特定代谢物具有抗流感作用。同时，利用共现网络分析与随机森林分析建立了一种在预测流感感染小鼠的预后/严重程度方面具有诊断潜力的模型，表明动物双歧杆菌等肠道菌或许能用于预防流感和作为流感预后的标志物。这些发现进一步阐释了肠道菌群与流感感染及其预后的关系，相关研究方法也值得专业人士参考。

流感 influenza gut microbiome Heterogeneous response LD50