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Ruijin Guo
文章数:9篇
皮肤细菌基因组
聂超+郭锐进:揭开人体皮肤微生物组的神秘世界面纱
皮肤表面的各种皮肤环境构成了复杂的生态系统。皮肤微生态系统的特点之一是生物量低,这大大限制了通过测序对微生物物种的全面识别。近期华大生命科学研究院聂超、郭锐进与团队在Advanced Science发表研究,构建了包含813个原核生物物种和5,779个微生物组装基因组的人体皮肤基因组目录,为研究皮肤微生物组及其在皮肤健康中的作用提供了重要的参考数据库。
皮肤细菌基因组
微生物多样性
Metagenomic shotgun sequencing
次级代谢物
单核苷酸变异
菌群-肠-脑轴
马现仓+朱峰:抗疫医护人员的长期肠道菌群失调与创伤后应激症状的关联
西安交通大学第一附属医院的马现仓和朱峰作为共同通讯作者,在Journal of Affective Disorders发表研究,揭示了新冠一线抗疫的医护人员中,因抗疫应激引发的长期肠道菌群紊乱和与其相关的创伤后应激症状,为理解应激性精神障碍的肠道菌群特征,以及寻找潜在干预靶点,带来新启示。
菌群-肠-脑轴
应激
肠道菌群
医护人员
精神分裂症
马现仓+贾慧珏等:精神分裂症患者的肠道微生物组特征
肠道菌群可作用于肠脑轴,与神经疾病的发生存在密切关联。Nature Communications最新发表了来自西安交大一附医院马现仓团队和华大基因贾慧珏团队等的合作研究,鉴定出精神分裂症相关的人肠道微生物组的组成和功能特征,为进一步研究其发病机制和治疗方法提供了新线索。有兴趣的读者不妨结合阅读一下他们团队去年发表的一篇相关论文(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1099252167),会有更多收获。
精神分裂症
Risk factors
schizophrenia
宏基因组关联分析
肠道微生物组
强直性脊柱炎
国内团队:强制性脊柱炎患者的肠道菌群组成及功能变化
来自北京协和医院的张烜团队与华大基因的揭著业团队在Journal of Autoimmunity上发表的一项最新研究,对比分析了强直性脊柱炎患者与健康人的肠道菌群后发现,患者的菌群组成及功能发生变化,且患者的菌群可能通过分子模拟触发自身免疫反应。
强直性脊柱炎
Ankylosing spondylitis
Diagnostic marker
Gut microbiota
inflammatory arthritis
菌群-肠-脑轴
马现仓+贾慧珏等:肠道菌群异常可影响色氨酸代谢,促进小鼠精神分裂症状
Molecular Psychiatry最新发表了由西安交通大学附属第一医院马现仓和华大基因贾慧珏等主导的研究,用粪菌移植等方法表明肠道菌群异常可促进精神分裂症,一定程度上与菌群引起的色氨酸代谢异常(色氨酸-犬尿氨酸-犬尿喹啉酸通路上调)有关,提示菌群-肠-脑轴在精神分裂症中的重要作用。
菌群-肠-脑轴
精神分裂症
粪菌移植
小鼠
色氨酸代谢
刘良+贾慧珏等:干酪乳杆菌可改善大鼠关节炎
《Microbiome》发表了来自澳门科技大学刘良和华大基因贾慧珏与团队的最新研究,在关节炎大鼠模型中揭示了干酪乳杆菌促进肠道菌群恢复从而改善疾病症状的作用,表明这种益生菌或能用于防治类风湿性关节炎。
益生菌
刘良+贾慧珏等:干酪乳杆菌可改善大鼠关节炎
《Microbiome》发表了来自澳门科技大学刘良和华大基因贾慧珏与团队的最新研究,在关节炎大鼠模型中揭示了干酪乳杆菌促进肠道菌群恢复从而改善疾病症状的作用,表明这种益生菌或能用于防治类风湿性关节炎。
益生菌
类风湿关节炎
大鼠
益生菌干预
干酪乳杆菌
肠道细菌参考基因组
华大基因团队:1520个人肠道单细菌参考基因组,助力菌群研究
华大基因的肖亮、贾慧珏和李俊桦与团队的重要研究,近期在Nature Biotechnology发表。该研究通过培养组学方法,从健康人粪便样本中获得1520个单菌基因组草图,对现有的人肠道细菌参考基因组有很大补充;并通过功能注释和泛基因组分析,加深了对肠道细菌功能和特点的了解。这些成果将助力人肠道宏基因组学分析和相关应用转化研究,值得专业人士仔细阅读。
肠道细菌参考基因组
肠道菌群
培养组学
宏基因组学
肠道菌群功能
参考基因集
史上最多双胞胎菌群测序:250人,鉴1140万基因+800万SNP
华大基因参与的一项研究,对250名成年英国双胞胎进行粪便菌群宏基因组测序,建立起包含1140万个基因的肠道菌群参考基因目录(比2014年同样由华大参与并发表在Nature Biotechnology的988万又多了一百多万个),同时还鉴定出肠道菌群中的8百万个SNP,并明确肠道菌群的可遗传性和环境因素的影响。这又是一篇宏基因组测序的重要文章,特别推荐!值得一提的是,该文主要作者都在我们的Hi Microbes系列群里,这篇文章也是今年群友发出的最重要文献之一。
参考基因集
宏基因组测序
SNP
遗传因素
环境因素