遗传因素

菌群-免疫互作啮齿动物（小鼠）研究论文基础研究自身免疫疾病

发表在Nature上的这篇观点综述总结了可能影响后代儿童心血管健康的产前因素，包括遗传、表观遗传、生活方式等。全面了解这些因素，可以从从产前开发预防和降低心血管疾病的干预措施。

心血管疾病表观遗传遗传因素

随着炎症性肠病（IBD）发病率和患病率的不断提高，IBD已成为公共卫生的主要威胁之一，迫切需要开发新的治疗药物。四川大学的黄灿华、李昌龙和美国北达科他大学的Min Wu与研究团队，在Theranostics发表文章，通过整合计算机筛选、微生物群干扰、基因敲除技术、体外和体内验证，建立了一个预测IBD生物标志物和宿主-微生物相互作用靶点以及预测候选药物的框架，或可用于临床应用。

炎症性肠病(IBD) 微生物组遗传因素 cGAS

儿童肠道菌群

环境和遗传因素是如何影响儿童肠道菌群组成的？

mBio最近发表的研究表明，婴儿早期收养可能导致儿童肠道微生物组组成的显著变化，这种变化可能是由收养家庭环境影响介导的。研究还进一步表明，遗传因素可能对儿童肠道中某种微生物的丰度起到关键作用。总的来说，细菌的类型与环境的关系更密切，而不同细菌的丰度与遗传的关系更密切。

儿童肠道菌群收养遗传因素家庭环境

结直肠癌风险

35万人数据：健康的生活方式可降低大肠癌风险

American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项前瞻性队列研究结果，对近35万名参与者进行多年随访后发现，健康生活方式（根据BMI、饮食、喝酒、吸烟等因素评估）与更低的结直肠癌风险相关，且这种关联在高遗传风险者中更为明显。

结直肠癌风险研究论文前瞻性队列研究生活方式遗传因素

多发性硬化

宿主遗传与肠道菌群的互作，决定对多发性硬化的易感性

多发性硬化（MS）是一种中枢神经系统的自身免疫疾病，其发病风险由遗传和环境等因素共同决定，肠道菌群也被证明与MS有密切关系。PNAS近期发表的一项小鼠研究表明，宿主基因型和肠道菌群之间的复杂互作，决定了宿主对MS的易感性。该研究发现，在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中，肠道菌群与宿主的遗传背景之间存在“适配”关系，当菌群与宿主遗传“不匹配”时，抗病个体的菌群或其中的特定肠菌（比如本研究中的罗伊氏乳杆菌），可能反而会增加易病个体的疾病风险。因此，干预肠道菌群治疗自身免疫疾病时，应考虑个体的遗传因素，设计量身定制的治疗方案。

多发性硬化 multiple sclerosis gut microbiome Genetics 实验性自身免疫性脑脊髓炎

绿茶

绿茶提取物诱导的肝损伤与HLA分型相关

绿茶 HLA 遗传因素肝损伤研究论文

尿道微生物组

Cell子刊：宿主遗传和环境影响大龄女性的尿道菌群

尿道菌群随性别而变化，且在老年人群中与发病率有关。Cell Host and Microbe近期发表的文章，对1600位45岁以上女性双胞胎进行尿道菌群分析，发现尿道菌群具有独特组成，且宿主遗传和宿主环境影响尿道菌群组成。

尿道微生物组 Microbiome Genetics urogenital tract Ageing

IBD

Nature：利用遗传学及功能基因组学剖析IBD相关通路（综述）

IBD是一种复杂疾病，遗传因素与环境因素对菌群-免疫轴的破坏驱动了IBD的发病。来自Nature上发表的一篇综述文章，详细介绍了近年来通过对IBD相关风险基因的研究，揭示出的在IBD发病机制中起关键调控作用的细胞及分子通路，以及这些通路在粘膜免疫稳态调控中的作用机制。同时，该综述以IBD为例，总结了如何通过遗传学及功能基因组分析，研究特定疾病的发病机制的策略。

IBD adaptive immunity Functional genomics Immunogenetics Inflammation

老年衰弱

遗传和饮食对炎性衰老及老年衰弱的影响（综述）

Ageing Research Reviews上发表的一篇综述文章，详细介绍了老年衰弱综合征的症状表现，及患者可能表现出的免疫系统失调。并讨论了遗传因素及饮食营养对炎性衰老的影响，以及通过营养干预减轻炎性衰老并防治衰弱症的可能。

老年衰弱 Frailty syndrome Inflamm aging Immune system SNP

痴呆

JAMA：近20万人数据揭示，健康的生活方式或可预防痴呆

JAMA上发表的一项回顾性队列分析结果，在对近20万人进行了8年左右的随访后发现，生活方式与遗传因素均与痴呆的风险独立显著相关，良好的生活方式（包括不吸烟、日常锻炼、健康饮食、控制酒精摄入等）与痴呆风险的降低相关。

痴呆痴呆生活方式遗传因素回顾性队列研究

口腔鳞状细胞癌

口腔菌群、生活方式、遗传因素对口腔鳞状细胞癌风险的影响

对138名口腔鳞状细胞癌及151名健康对照的口腔菌群、生活方式、遗传因素进行分析，鉴定出了影响口腔鳞状细胞癌风险的各类因素，其中，饮酒、吸烟、槟榔、较差的口腔卫生与患癌风险增加相关。

口腔鳞状细胞癌口腔菌群遗传因素生活方式 Inbar Raber

饮食

CR：饮食、遗传和肠道菌群，共同影响血浆代谢物水平

不同遗传背景的小鼠，肥胖及糖尿病风险存在差异，这种差异与肠道菌群相关。饮食、遗传因素、肠道菌群通过共同影响代谢产物的水平而影响疾病风险。

饮食遗传因素代谢产物胰岛素抵抗 Jessica N Witchley

人类微生物组计划

GM：遗传因素对不同部位菌群的影响不一样

人体菌群在多大程度上受遗传因素的影响？近期Genome Medicine[IF：7.071]上线的研究表明，菌群组成与遗传因素的相关性，在人体不同身体部位间存在差异，其中，肠道和口腔菌群可能受宿主遗传的影响较大。这些发现进一步加深了对宿主-菌群相互作用的认识理解，值得关注。

人类微生物组计划遗传因素 Association studies Human Microbiome Project Human genome sequence

参考基因集

史上最多双胞胎菌群测序：250人，鉴1140万基因+800万SNP

华大基因参与的一项研究，对250名成年英国双胞胎进行粪便菌群宏基因组测序，建立起包含1140万个基因的肠道菌群参考基因目录（比2014年同样由华大参与并发表在Nature Biotechnology的988万又多了一百多万个），同时还鉴定出肠道菌群中的8百万个SNP，并明确肠道菌群的可遗传性和环境因素的影响。这又是一篇宏基因组测序的重要文章，特别推荐！值得一提的是，该文主要作者都在我们的Hi Microbes系列群里，这篇文章也是今年群友发出的最重要文献之一。

参考基因集宏基因组测序 SNP 遗传因素环境因素

菌群-肠-脑轴

YJBM：肠道菌群如何决定婴儿健康？（综述）

Yale Journal of Biology & Medicine 是一个还没有被SCI收录的杂志，但今年他们推出的菌群专刊，大牛云集，16篇文章都非常精彩，再次强烈推荐给大家阅读。

菌群-肠-脑轴婴儿健康肠道菌群遗传因素 Jingcheng Xiao

饮食

JC：饮食或遗传诱导肥胖，对肠道菌群影响不同

饮食诱导的肥胖与遗传诱导的肥胖对小肠菌群的影响不同，但均与肠道炎症增高及Wnt信号通路改变以促进肿瘤形成相关。推荐阅读。

饮食肥胖炎症 Wnt信号通路遗传因素

双胞胎

CHM：1126对英国双胞胎，告诉你菌群的遗传特性

又一个值得珍藏的大样本研究。

双胞胎肠道菌群遗传因素 Marinos Pericleous Martyn Caplin

肥胖

NEJM：某些基因开或关，肥肉就增或减？

今天NEJM值得看的另一评论文章。

肥胖遗传因素 Trim28

遗传因素

Cell：人体自身基因，参与塑造肠道菌群

这是2014年发表在Cell的重要研究，通过针对416对双胞胎的研究，明确宿主遗传（自身基因）对塑造肠道菌群的贡献。经典文献，值得深读，特别推荐。

遗传因素 William D Fraser Negar Tabatabaei