Wenyi Zhang

多项研究已经报道，在细菌中DNA甲基化是一种普遍的表观遗传机制，其中6-甲基腺嘌呤（6mA）是最普遍的一种，在调节基因表达和形成致病菌的宿主细胞方面起作用，但其在副干酪乳酪杆菌中的生理功能却鲜为人知。近日，内蒙古农业大学张和平及团队在Nature Communications发表最新研究，通过多组学和高通量染色体构象捕获（Hi-C）技术，揭示了副干酪乳酪杆菌表观遗传修饰的分子和功能作用，极大地促进了益生菌领域的最新前沿研究，值得关注。

甲基化益生菌研究论文基础研究表观遗传

张和平+张文羿：鼠李糖乳杆菌Probio-M9对肠道菌群和免疫的影响

益生菌在全球市场正在爆炸性增长，但目前关于食用益生菌是否对非患者有益仍存在争议。近日，内蒙古农业大学张和平团队联合张文羿团队在Microbiology spectrum上发表文章，发现鼠李糖乳杆菌Probio-M9可以收紧免疫与肠道菌群间的联系，并稳定肠道菌群的遗传变异。本研究揭示益生菌消费的影响被严重低估，为全面了解和评估益生菌的疗效提供了新的视角。

益生菌

张和平+张文羿+左永春：机器学习平台iProbiotics助力益生菌快速筛选

益生菌的发现和实验验证需要大量的时间和精力，因此，开发有效的益生菌筛选方法具有重要意义。内蒙古农业大学张和平、张文羿和左永春作为共同通讯作者，在Briefings in Bioinformatics发表研究，开发了一个基于机器学习算法的平台，一种新颖且免费的在线生物信息学工具 iProbiotics，用于从可用的全基因组测序数据中预测益生菌特征，它将促进益生菌的快速筛选。作者构建了三个独立模型，其可在 http://bib.oxfordjournals.org/ 上在线获得，作者的研究结果为益生菌的鉴定和潜在机制提供了新的见解。

益生菌 k-mer组成预测特征选择机器学习

益生菌

国内团队：干酪乳杆菌Zhang或能减少抗生素引起的菌群失调

内蒙古农业大学张文羿团队，近期在Computational and Structural Biotechnology Journal发表研究，表明抗生素治疗不仅导致宿主肠道菌群失调，还导致炎症反应和肠道菌群中抗生素耐药基因增加。而每日补充干酪乳杆菌Zhang可以缓解抗生素干预的这些不良副作用，并促进肠道菌群稳态的恢复，这些益生菌作用可能与戈氏副拟杆菌介导的有益作用有关。

益生菌干酪乳杆菌Zhang 抗生素抗生素耐药基因短链脂肪酸

益生菌

张和平+周晓峰等：益生菌辅助治疗通过调节肠道菌群缓解溃疡性结肠炎

来自内蒙古农业大学的张和平团队与中日友好医院的周晓峰团队合作在Microbial Biotechnology上发表的一项随机双盲安慰剂对照试验结果，在25名活动性溃疡性结肠炎（UC）患者中发现，相比于单独使用美沙拉嗪治疗，美沙拉嗪+益生菌治疗12周后，可更有效地缓解UC症状，并显著提升缓解率，同时增加肠道粘膜菌群中的有益菌相对丰度。另外，有益菌相对丰度与UC疾病活动指数之间呈显著负相关，提示益生菌可通过调节肠道菌群以缓解UC。

益生菌研究论文溃疡性结肠炎随机双盲对照实验（RCT）干酪乳杆菌Zhang

植物乳杆菌P-8

内蒙农大：植物乳杆菌P-8适应抗生素时发生了什么变化

内蒙古农业大学张文羿团队近期在mSystems发表研究，分析了植物乳杆菌P-8在对抗生素的适应中发生的变化，发现一些应激蛋白可能有助于细菌形成抗生素耐药表型，并表明相关基因通过可移动遗传元件传播给其它细菌的风险比较低。该研究为具有高耐药性的新型益生菌的生物安全性，提供了新的见解。

植物乳杆菌P-8 Lactobacillus plantarum P-8 研究论文细胞系实验

益生菌

内蒙农大：植物乳杆菌P-8适应抗生素时发生了什么变化

内蒙古农业大学张文羿团队近期在mSystems发表研究，分析了植物乳杆菌P-8在对抗生素的适应中发生的变化，发现一些应激蛋白可能有助于细菌形成抗生素耐药表型，并表明相关基因通过可移动遗传元件传播给其它细菌的风险比较低。该研究为具有高耐药性的新型益生菌的生物安全性，提供了新的见解。

益生菌抗生素耐药性 Lactobacillus Lactobacillus plantarum P-8 adaptive laboratory evolution

Lactobacillus plantarum P-8

张和平等：植物乳杆菌P-8在宿主体内的基因组变异

Lactobacillus plantarum P-8 植物乳杆菌P-8 研究论文临床对照实验肠道菌群【有显著改善】

植物乳杆菌P-8

张和平等：植物乳杆菌P-8在宿主体内的基因组变异

植物乳杆菌P-8

干酪乳杆菌Zhang

FM：与干酪乳杆菌Zhang的庆大霉素耐药性相关的碱性休克蛋白

这是内蒙古农业大学张和平团队发表的研究干酪乳杆菌Zhang对特定抗生素耐药性建立进程的研究，通过在庆大霉素环境下培养细菌，研究细菌蛋白表达水平的变化，确定出特定蛋白与耐药性建立的相关性。值得关注的研究，特别推荐。

干酪乳杆菌Zhang Lactobacillus casei Zhang 研究论文细胞系实验

干酪乳杆菌Zhang

FM：与干酪乳杆菌Zhang的庆大霉素耐药性相关的碱性休克蛋白

这是内蒙古农业大学张和平团队发表的研究干酪乳杆菌Zhang对特定抗生素耐药性建立进程的研究，通过在庆大霉素环境下培养细菌，研究细菌蛋白表达水平的变化，确定出特定蛋白与耐药性建立的相关性。值得关注的研究，特别推荐。

干酪乳杆菌Zhang 庆大霉素碱性休克蛋白 Jillian R-M Brown Burkhardt Flemer

酸马奶

张和平团队：用单细胞扩增技术研究酸马奶细菌

内蒙古农业大学张和平教授团队的新研究成果，再次推荐。

酸马奶单细胞扩增技术 Chun-Jun Guo Michael A Fischbach

乳酸杆菌属

张和平等：在中国使用的发酵乳酸杆菌，耐药么？

发酵食品用的乳酸杆菌的安全性关乎食品安全，为此这篇研究有很大的意义，值得一读。

乳酸杆菌属抗生素耐药性基因 antibiotic susceptibility food safety gene transfer

肠球菌属

张和平等：29株肠球菌的基因组比较

张和平教授团队的新成果，对条件致病菌肠球菌进行基因组比较，值得认真读一读。

肠球菌属比较基因组学 comparative genomics Enterococcus Phylogenetic analysis

三代测序

张和平团队：利用三代测序评估婴儿配方食品安全性

三代测序 PacBio 单分子实时测序婴儿配方食品食品安全

内蒙古农大团队：用三代测序评估苜蓿青贮质量

当生产遇到三代测序，分子生物学在农业中又进一步得以应用。内蒙古农业大学张和平教授团队做的研究，在技术和生产结合上，又走出坚实一步。

苜蓿青贮

内蒙古农大团队：用三代测序评估苜蓿青贮质量

当生产遇到三代测序，分子生物学在农业中又进一步得以应用。内蒙古农业大学张和平教授团队做的研究，在技术和生产结合上，又走出坚实一步。

苜蓿青贮苜蓿青贮三代测序 PacBio

功能基因组学

对213株乳杆菌及其相关菌属进行比较基因组学研究扩展乳酸杆菌的生物应用潜力

① 乳酸菌的代谢多样性、种属不明确、与其他重要的乳酸菌之间关系的不确定性，使得开发利用乳酸菌变得复杂，且乳酸菌催化的生物转化能力尚未开发；② 发布213株乳杆菌及其相关菌属的基因组序列，发现73个核心基因，描述修饰碳水化合物和蛋白质的编码基因目录；③ 乳酸杆菌有广泛且多样性的新CRISPR-Cas免疫系统，可用于基因编辑；④ 揭示乳酸杆菌在自然和工业环境的宿主相互作用因子和细菌素的系统基因组学分布，及工艺过程中承受压力的机制。

功能基因组学乳杆菌

植物乳杆菌P-8

不同年龄人群对植物乳杆菌P-8的肠道应答

内蒙古农业大学张和平团队在Nutrition发表的一项研究，分析了不同年龄段受试者（青年、中年、老年）对口服植物乳杆菌P-8干预的肠道应答情况，包括菌群、分泌型免疫球蛋白A（SIgA）、胆汁酸和短链脂肪酸等指标的变化。

植物乳杆菌P-8 Lactobacillus planatarum P-8 肠道菌群【有显著改善】以人为对象的临床试验临床对照实验

植物乳杆菌P-8

不同年龄人群对植物乳杆菌P-8的肠道应答

内蒙古农业大学张和平团队在Nutrition发表的一项研究，分析了不同年龄段受试者（青年、中年、老年）对口服植物乳杆菌P-8干预的肠道应答情况，包括菌群、分泌型免疫球蛋白A（SIgA）、胆汁酸和短链脂肪酸等指标的变化。

植物乳杆菌P-8 益生菌 probiotics lactobacillus plantarum LP-8