Eric G Pamer

革兰氏阴性菌血流感染是接受同种异体造血干细胞移植（allo-HCT）的患者中的常见严重并发症。Clinical Infectious Diseases上发表的一项前瞻性队列研究，对700多名接受了allo-HCT的患者进行分析后发现，埃希氏菌属等5个菌属与革兰氏阴性菌血流感染相关，而瘤胃球菌科和拟杆菌科的定殖则在其中起保护作用。另外，氟喹诺酮类药物的使用可能降低革兰氏阴性菌血流感染的风险，但可能增加大肠杆菌感染的风险。

血流感染 Gram-negative bloodstream infections Intestinal Microbiota allogeneic hematopoietic cell transplantation 同种异体造血干细胞移植

抗生素耐药性

Nature：特定肠道菌产生的羊毛硫抗生素可抵抗耐万古霉素肠球菌

耐万古霉素肠球菌（VRE）是院内感染的一个主要原因，难以治疗。肠道共生菌群可抑制VRE的定植，但对于接受大量抗生素治疗的患者，由于肠道菌群被破坏，发生VRE感染的风险大大增加。Nature发表的一项最新研究，从共生菌Blautia producta BPSCSK菌株中鉴定出可抵抗VRE定植的细菌产物——羊毛硫抗生素，并通过分析VRE感染高危患者肠道菌群和小鼠试验表明，羊毛硫抗生素及其产生菌或能帮高危患者重建对VRE的抗性。

抗生素耐药性 Antimicrobial resistance metagenomics Microbiome 耐万古霉素肠球菌

抗生素耐药细菌

Cell子刊：肠道胆汁酸促进万古霉素耐药肠球菌的定殖

《Cell Host and Microbe》上发表的一项最新研究，发现肠道中的一种次级胆汁酸——石胆酸可通过促进万古霉素耐药性肠球菌（VRE）形成长链结构，以增加生物膜的形成，从而促进其在肠道中的定殖。该研究对于阐释致病菌定殖机制具有重要参考价值。

抗生素耐药细菌 Enterococcus VRE bile microbiota

定殖抗性

菌群产生的短链脂肪酸有望用于清除耐药性致病菌

肠杆菌科致病菌的抗生素耐药性威胁感染治疗有效性的。本研究发现，正常肠道菌群对肠杆菌科致病菌的定殖抗性，部分来源于短链脂肪酸介导的细胞酸化作用，而重建产短链脂肪酸的菌群有助于清除肠道内的耐药肠杆菌。本文结果对研究定殖抗性的作用机制、研发抗感染疗法、控制抗生素耐药性都有借鉴价值。

定殖抗性短链脂肪酸酸化作用肠杆菌科致病菌抗生素耐药性

自体粪菌移植

Science子刊：自体粪菌移植，重建患者被抗生素摧残的肠道菌群

Cell本月发表的一项重磅研究中（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1041252324），自体粪菌移植可迅速恢复使用抗生素后的健康人的肠道菌群多样性。Science Translational Medicine刚刚上线的一项临床研究表明，在接受造血干细胞移植的患者中，自体粪菌移植可作为干预手段，用于恢复被常规抗生素治疗所破坏的肠道菌群。该研究仍在追踪患者的恢复情况，以判断自体FMT是否能减少因丧失菌群多样性而导致的不良临床结局。

自体粪菌移植异基因造血干细胞移植随机对照临床试验抗生素肠道菌群

定殖抗性

定殖抗性的维持和破坏

肠道细菌间的相互作用对维持菌群稳态、防御病原菌具有重要作用。本综述总结了细菌间直接的定殖抗性机制、潜在病原菌对抗定殖抗性的的竞争策略及其利用定殖抗性的崩溃达到定植和扩增的策略。作者同时提出了真菌、原生动物和噬菌体等对细菌间互作的影响，并强调了肠道不同区段菌群结构差异对细菌互作网络的影响，值得专业人士参考。

定殖抗性病原菌入侵细菌间相互作用 Donghui Xu Rihui Wu

同种异体造血干细胞移植

产丁酸菌或能减少造血干细胞移植后的呼吸道病毒感染

呼吸道病毒感染常发生于同种异体造血干细胞移植患者中。Blood上发表的一项最新研究发现，粪便菌群中产丁酸菌丰度较高的患者，接受造血干细胞移植后，呼吸道病毒感染风险较低。

同种异体造血干细胞移植产丁酸细菌 Orfeu M Buxton Kelly M Ness

骨髓移植

Cell子刊：肠道菌群如何影响骨髓移植预后？

骨髓移植（BMT）是治疗恶性血液病的有效手段，然而患者术后通常会经历免疫缺陷和营养问题，影响BMT预后。Cell Host and Microbe[IF：14.946]本周上线的一项研究表明，肠道菌群增加饮食能量吸收，有助于BMT后重建造血和免疫功能。有兴趣的读者不妨搭配Nature Reviews发表的综述（http://www.xunludkp.com/papers/read/1095674431）共同阅读。

骨髓移植营养吸收

抗生素耐药性

Annual Review：抵抗艰难梭菌和耐药菌的菌群疗法（综述）

这是Annual Review of Microbiology发出的年度综述，特别关注应对艰难梭菌和耐药菌的菌群疗法（Microbiota Therapy）。Annual Review出手的文章，建议必读！

抗生素耐药性菌群疗法

菌毛

Nature：精准清除特定肠道病原细菌的糖类！

这是对同期Nature上的重量级研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1058090408）的新闻报道，老规矩，这样的文章，看看图就必有收获。

菌毛粘附蛋白尿路致病性大肠杆菌伴侣引导通路

万古霉素耐药性屎肠球菌

【耐药专题】Cell子刊：共生菌群的合作恢复对万古霉素耐药性屎肠球菌的定殖抗性

① 专性厌氧共生细菌与对万古霉素耐药性肠球菌（VRE）的定殖抗性相关，但相关的特异性细菌种类尚未明确；② 本研究确定了一系列共生细菌，包含梭菌属XIVa簇中的Blautia producta以及Clostridium bolteae，可恢复对VRE的定殖抗性，并在小鼠体内清除VRE；③ C. bolteae并不直接介导VRE的清除，而是通过促进B. producta在肠道内的定殖发挥作用，B. producta可直接抑制VRE的生长。

万古霉素耐药性屎肠球菌 Jens Christian Claussen Jens Christian Claussen Andre Franke Marc-Thorsten Hütt

口服万古霉素

JAC：口服万古霉素，到底对人体肠道菌群有何影响？

口服万古霉素，对人的肠道菌群有什么长短期影响？看看这篇文章。

口服万古霉素肠道菌群

结肠炎

Nature Reviews：艰难梭菌性结肠炎（综述）

艰难梭菌感染是抗生素使用造成的肠道感染及腹泻的主要原因，艰难梭菌是菌群研究里最精彩能听到的细菌名字，Nature Reviews Microbiology上这篇综述，系统性总结了艰难梭菌相关发病机制，非常值得一读。

结肠炎艰难梭菌 Katie A Meyer Brian J Bennett Katie A Meyer

肠道微生物组

Science：重塑肠道菌群，战胜耐药菌！

① 丰富的肠道共生菌群协助抵抗病原菌的侵袭；② 抗生素治疗可破坏正常肠道菌群结构，反而使人更易感染病原菌；③ 重塑正常肠道菌群可很好抑制抗生素抗性病原菌引起的感染；④ 前沿研究正在寻找更多益生菌制剂，帮助重建和增强肠道正常菌群抵抗力；⑤ 将减少医疗过程中抗生素抗性细菌引起的感染。

肠道微生物组抗生素益生菌 Andrew J Macpherson M Gomez de Aguero

癌症

菌群介导的癌症中的感染

① 癌症中发生的感染可能来自癌症治疗或癌症本身，免疫系统受损、解剖屏障破坏及医院内病原体暴露是可能原因； ② 常见万古霉素耐药性的肠球菌、肠杆菌及艰难梭菌感染； ③ 这些细菌正常状态下也存在于体内，但在体内菌群收到破坏时发生感染； ④ 本综述讨论菌群在癌症相关感染中的作用。

癌症感染菌群造血干细胞移植血液感染

临床基因组学

JCM：临床基因组学的重要角色

介绍第115届美国微生物学会大会上关于“临床基因组学”专门研讨会的精华观点，值得一看。

临床基因组学宏基因组美国微生物学会高通量测序 Luwei Liu

CTLA-4单抗

通过对黑色素瘤病人肠道菌群的分析研究检查点阻断诱导结肠炎的风险

① 伊匹目单抗（ipilimumab）可以阻断细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）信号，这种抗体与新发病的免疫介导性结肠炎相关；② 对接受CTLA-4单抗药物治疗转移性黑色素瘤的患者结肠炎发病前后的粪便菌群组成进行了分析；③ 拟杆菌门丰度增加与结肠炎抵抗相关；④ 缺乏多胺转运及B族维生素合成相关的通路与结肠炎发病风险增加有关；⑤ 识别上述生物标志物有助于降低癌症免疫治疗后炎症并发症的风险。

CTLA-4单抗结肠炎黑色素瘤 Martial Marbouty Romain Koszul

病原体

Cell：靶向肠道菌群的疗法，有挑战但更可为！

去年年底Cell上发表的一篇综述，昨天Cell又再次在当期目录中列示并推荐阅读，这确实是一篇短小但值得深读的综述，推荐给大家。

病原体病原菌菌群靶向调节艰难梭菌肠道传染病

TLR信号

Annual Review：菌群如何促进炎症，抵御感染？

一篇肠道菌群和免疫的经典综述，值得细读。

TLR信号抗微生物分子树突状细胞粘蛋白炎症性疾病

岩藻糖基化

Nature：肠道上皮产生的岩藻糖，是抗病菌利器

这是2014年发表在Nature，明确在疾病状态下，肠道上皮细胞通过岩藻糖基化的蛋白，促进肠道有益细菌的生长以抑制病原菌。这充分说明了宿主（小鼠）与肠道菌群之间互动的巧妙机制，为应对肠道病原体感染打开了一扇窗，蕴藏很大的转化价值。

岩藻糖基化

肠道菌群

Blood：肠道菌群多样性与造血干细胞移植患者死亡率显著相关

Blood是国际知名的血液学杂志，在它上面发表了一些关于造血干细胞移植与肠道菌群关系的文献，我们找到了其中7篇的全文，前几天做了日报，今天再次特别分享给大家。

肠道菌群多样性同种异体造血干细胞移植死亡率 Shiho Fujisaka