Alex K Shalek

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Alex K Shalek

文章数：7篇

环境性肠病

Science子刊：单细胞图谱揭示环境性肠病的上皮和免疫特征

环境性肠病（EE）是一种肠道亚临床疾病，由于暴露在环境肠道病原体引起，可导致儿童营养不良、生长发育迟缓和口服疫苗反应减弱等，但目前关于EE的完整病理生理学仍不清楚。近日，发表在Science Translational Medicine上的文章，通过对EE样本进行单细胞测序分析，发现与EE严重程度相关的细胞亚群，且EE患者样本中促炎分子显著增加、WNT和MAPK信号失调。因此，这项研究表明与EE相关的上皮和免疫特征，并提供了治疗/干预EE的靶点。

环境性肠病单细胞测序分析肠上皮免疫活化

Nature子刊：用类器官模型筛选肠道上皮细胞组成的调节剂

屏障上皮的细胞组成对机体的平衡至关重要。然而，目前还缺乏识别调节上皮细胞组成和功能的生物靶标以及调节它们的小分子的方法。Nature Biomedical Engineering发表的研究，发现了肠道干细胞分化的可药用生物靶点Xpo1（Exportin 1 inhibitor）和小分子调节剂KPT-330。Xpo1的抑制剂KPT-330，可以调节肠道干细胞的命运，显著增加器官模型和野生型小鼠中Paneth细胞的丰度。总的来说，该研究提供了一个可借鉴的研究模式，用来发现药物靶点，以合理地调节肠道上皮屏障。

类器官肠道上皮细胞组成 KPT-330 XPO1

Cell子刊：高脂饮食增强肠干细胞并促肿瘤的机制

肥胖是多种肿瘤的危险因素。Cell Reports近期发表的文章，高脂饮食通过PPAR-FAO轴增强肠道干性和致瘤特性。肠道干细胞中，PPARδ 和 PPARα激活脂肪酸氧化（FAO）代谢程序，缺失或抑制FAO过程可抑制HFD所增强的肠道干细胞的扩增和增殖，抑制早期肠道肿瘤的形成。研究提示，抑制HFD激活的FAO代谢程序或是对抗HFD对肠道干细胞和肠道肿瘤发生的影响的一个治疗策略。

高脂饮食肠干细胞致瘤性肠道肿瘤

移植物抗宿主病

Science子刊：导致急性移植物抗宿主病的供体CD8+ T细胞有哪些特征

供体T细胞的器官浸润对于同种异体造血干细胞移植（allo-HCT）后的急性移植物抗宿主病（aGVHD）的发展十分关键。Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，在发展出aGVHD的allo-HCT恒河猴模型中，利用单细胞RNA测序技术，鉴定出了胃肠道浸润的致病性供体CD8+ T细胞的表型及转录特征，并发现相比于未发展出GVHD的患者，aGVHD患者的外周血CD8+ T细胞也有相似的转录特征。

移植物抗宿主病胃肠道急性移植物抗宿主病研究论文基础研究灵长类（猿猴）

溃疡性结肠炎及克罗恩病的免疫细胞亚群差异

来自Gastroenterology上发表的一项最新研究，利用质谱流式细胞（CyTOF）技术及单细胞RNA测序技术，分析对比了溃疡性结肠炎（UC）与克罗恩病（CD）患者的结肠粘膜及血液中的免疫细胞，鉴定出了不同患者（包括活动性UC、活动性CD、非活动性UC、非活动性CD）的结肠及血液中富集的免疫细胞亚群。该研究结果提示，未来或可靶向特定免疫细胞亚群以治疗不同类型的IBD。

IBD Treg MAIT cells ILC3 scRNA-seq

溃疡性结肠炎

Cell：溃疡性结肠炎中哪些细胞和基因出了问题？

上周Cell发表的又一篇单细胞RNA测序研究，对18名溃疡性结肠炎（UC）和12名健康人的结肠粘膜样本进行单细胞RNA测序，揭示出基因表达模式和细胞类群的变化在UC发生和药物应答中的作用，以及风险基因与特定细胞类型和功能通路的关系。

溃疡性结肠炎 INFLAMMATORY BOWEL DISEASE ULCERATIVE COLITIS Inflammation anti-TNF resistance

肠道干细胞

Cell：与T细胞间的亲密互作，调节肠道干细胞的更新和分化

肠道干细胞（ISC）稳态受多种细胞和信号因素的影响，Cell上周发表的一项研究揭示了ISC与T细胞间的互作对ISC稳态的调控机制。该研究发现有些ISC可直接向辅助性T细胞呈递抗原，而不同类型的T细胞及其细胞因子可对ISC的分化和自我更新起不同作用，影响小鼠对肠道感染的抵抗力。这些发现为干细胞与免疫细胞间的互作提供了新机制。

肠道干细胞辅助性T细胞粘膜免疫主要组织相容性复合体 MHC class II