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文章数：9篇

单核苷酸变异

朱立新/刘占举/朱瑞新/焦娜等：肠菌单核苷酸变异助力大肠癌早期无创筛查

结直肠癌是全球第三大恶性肿瘤，影像学检查、内镜检查、粪便隐血检测以及液体活检等是常见的筛查策略。然而，目前这些方法仍存在假阳性高、敏感性低等问题，亟需开发准确度和敏感性更高的早筛标志物。近日，中山大学朱立新、同济大学附属第十人民医院刘占举和朱瑞新、浙江大学焦娜及团队在Gut Microbes发表最新研究，整合了多队列全宏基因组测序数据，并系统评估了多模态微生物标志物对于结直肠腺瘤的诊断效能，最终揭示了微生物单核苷酸变异作为疾病诊断标志物的潜力巨大，值得关注。

单核苷酸变异早期诊断研究论文基础研究肠道菌群

刘占举+郭天南+朱瑞新Cell子刊：多组学破译克罗恩病中宿主与肠道菌群互作的空间特征

宿主-菌群互作失调在克罗恩病 (CD) 肠炎的发生发展中起着关键作用，然而肠道及其附属组织的空间分布和相互作用网络尚不清楚。近日，同济大学刘占举、朱瑞新团队联合西湖大学郭天南在Cell Reports Medicine发表文章，通过对克罗恩病患者的肠道及其附属组织的整合多组学分析，揭示了宿主蛋白和肠道菌群的空间特征及其相互作用，为CD发病机制以及基于蛋白和微生物的潜在诊断标志物提供了新见解。

多组学炎症性肠病肠道菌群蛋白质组学克罗恩病

朱瑞新+朱立新等iMeta: 靶向基石菌种可恢复NASH中失调的产丁酸菌

产丁酸菌的生态失调是非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）发展的关键因素之一。同济大学朱瑞新团队和中山大学六院朱立新团队与合作者近期在iMeta发表研究，收集了来自纽约的22名非酒精性脂肪性肝炎（NASH）患者、25名肥胖患者和16名健康个体的粪便样本，进行16S rRNA基因测序，并基于因果推理理论和动态干预模拟（DIS）建立了一种疾病关键菌种识别算法。该研究发现多个关键菌种可有效地使NAFLD的菌群组成向正常肠道菌群恢复，提示了一种新的潜在的NAFLD微生物治疗方法。

因果推理动态干预模拟肠道菌群关键物种非酒精性脂肪肝病（NAFLD）

朱瑞新+朱立新等Nature子刊：基于多界微生物的大肠癌跨队列诊断模型

Nature Microbiology最新发表了上海交通大学医学院王慧、同济大学朱瑞新、中科院上海营养与健康研究所张国庆、复旦大学陈兴栋、中山大学附属第六医院朱立新作为共同通讯作者的研究论文，通过对结直肠癌（CRC）大样本宏基因组数据集进行综合分析，揭示了与CRC相关的4界肠道微生物（细菌、真菌、古菌、病毒）各自的变化和彼此的互作，并建立了基于多界微生物和宏基因组功能标志物的CRC诊断模型。这些发现对于基于肠道微生物组的CRC筛查诊断，以及进一步研究相关机制、寻找治疗靶点，具有重要参考价值。

结直肠癌肠道微生物组诊断模型

兰平、何真等：锁定肠系膜脂肪中的促肠炎细菌

肠系膜脂肪组织（mAT）增生，即“爬行脂肪”，是克罗恩病（CD）的一个病理特征，且与CD患者的预后不佳有关，但其机制仍不清楚。中山大学附属第六医院兰平作为共同通讯作者、何真作为共同第一作者，在Microbiome发表最新研究，通过整合多组学分析，揭示了CD患者的mAT菌群-宿主互作失调，及其与CD患者疾病进展的关系。通过对mAT菌群进行分离培养，该研究进一步发现，mAT中的一种无色杆菌属细菌A. pulmonis是促炎的致病共生菌，可在小鼠中移位到mAT并促进结肠炎的恶化。这些发现加深了我们对于肠道细菌在CD发展中的作用的认知，为研发基于菌群干预的疗法提供了新思路。

克罗恩病爬行脂肪肠系膜脂肪组织菌群移位

朱瑞新等：结直肠腺瘤及结直肠癌的菌群标志物

同济大学朱瑞新和田川、上海交大医学院刘宁宁、中山大学附属第六医院朱立新与研究团队，近期在Nature Communication上发表研究，对4项研究（共1056例受试者的粪便菌群数据）进行总结，鉴定出了可区分结直肠腺瘤与健康对照、结直肠腺瘤与结直肠癌的菌群标志物，或有助于结直肠癌的早期诊断。

结直肠癌诊断标志物研究论文队列研究

Lancet子刊：国内团队报道新冠患者的胃肠道后遗症

中山大学附属第六医院兰平与研究团队近期在Lancet Gastroenterology & Hepatology发表文章，报道了新冠患者出院后3个月的胃肠道后遗症及其相关临床因素。

新冠肺炎后遗症胃肠道症状

非酒精性脂肪肝

同济大学等：NAFLD中肝脏胆汁酸信号通路受损

胆汁酸通过法尼醇X受体（FXR）等信号通路，调控糖脂代谢和肝脏等组织的炎症状态，可能参与非酒精性脂肪肝（NAFLD）等疾病进程。Gut近期发表了同济大学与纽约州立大学布法罗分校团队合作的研究，表明NAFLD患者的菌群改变，血液胆汁酸增多、初级和次级胆汁酸比例改变，肝脏中FXR和FGF4介导的胆汁酸相关信号通路受损。这些发现提示FXR信号通路中的组分，包括将初级胆汁酸转化为次级胆汁酸的肠道菌，都是潜在的NAFLD治疗靶点。

非酒精性脂肪肝胆汁酸 FXR信号通路人体小鼠

同济大学等：胖瘦鼠肠道菌群荟萃分析

Physiological Genomics发表的由同济大学团队主导的研究，纳入9项啮齿动物研究的原始数据，分析饮食诱导的肥胖与菌群组成和功能变化的关联，值得专业人士关注。

肥胖 Gut microbiota high-fat diet META-ANALYSIS Obesity