Fen Zhang

香港中文大学的黄秀娟团队在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇观点型综述，详细介绍了新冠病毒感染导致的肠道菌群变化，并讨论了新冠病毒诱导肠道菌群失调以及肠道菌群失调影响新冠病毒感染严重程度的潜在机制，同时探讨了新冠病毒流行前、流行期间及流行后的肠道菌群变化，以及新冠病毒防控措施对肠道菌群的影响，最后展望了靶向干预菌群以改善新冠肺炎患者结局的可能。

新冠综述肠道菌群

代谢产物

港中大黄秀娟团队：肠道菌群功能改变与新冠肺炎严重程度相关

新型冠状病毒感染导致的严重急性呼吸综合征（COVID-19）不仅仅影响患者的呼吸道，同时会感染和影响包括肠道在内的其他器官。近期已有研究发现，新冠肺炎患者与正常对照相比，肠道菌群发生了显著改变，主要表现为产丁酸盐的有益菌减少，机会致病菌增加。肠道菌群可以通过调控宿主免疫机能以拮抗病毒感染，例如肠道菌群代谢产物络氨酸可以通过调控细胞因子分泌增强肺细胞抗流感病毒的能力。但是，肠道菌群的代谢产物能否具有类似拮抗新冠病毒的能力尚未有研究。因此，深入探索肠道菌群及其代谢物在新冠肺炎发病机制和严重程度中的作用，有助于人们理解肠道微生物群与宿主防御新冠病毒的关系。近期香港中文大学黄秀娟团队在Gastroenterology上发表了他们关于新冠肺炎肠道菌群变化的最新的工作，通过宏基因组分析发现，新冠肺炎患者肠道菌群显著改变，导致产短链脂肪酸（SCFA）和L-异亮氨酸合成能力受损。该研究详细描述了肠道菌群功能改变以及菌群纵向动力学与疾病严重程度和免疫反应的关系，为新冠肺炎与肠道菌群变化的关系提供了重要的证据。

代谢产物短链脂肪酸（SCFA）异亮氨酸疾病严重程度新冠肺炎

自闭症谱系障碍

国内团队：自闭症儿童的肠道菌群变化

来自香港中文大学的黄秀娟团队与香港理工大学的Ruth Chan团队在Gut上发表的一项最新研究，对比了自闭症谱系障碍（ASD）患儿与发育正常儿童的肠道菌群差异。

自闭症谱系障碍生物标志物研究论文队列研究

SARS-CoV-2

港中大黄秀娟：肠道病毒组或影响新冠严重程度

RNA病毒SARS-CoV-2主要影响呼吸道和胃肠道。从粪便中可分离到SARS-CoV-2，且在人肠道细胞中可进行病毒复制。同时，人类肠道中还含有大量的常驻病毒（统称为病毒组），它们在调节宿主免疫和疾病病理生理学方面发挥作用。Microbiome近期发表来自香港中文大学黄秀娟团队的文章，发现COVID-19患者的肠道RNA和DNA病毒组与非COVID-19患者不同，且在COVID-19疾病消退后持续存在。肠道病毒通过调节免疫影响COVID-19严重程度。肠道病毒与COVID-19严重程度和宿主年龄呈负相关，这可能部分解释了年龄较大的受试者容易出现更严重的COVID-19感染。研究强调了人类肠道病毒组在COVID-19严重性和潜在治疗中的重要性。

SARS-CoV-2 肠道病毒组年龄免疫

COVID-19

香港中文大学：新冠肺炎患者的肠道菌群组成可能影响疾病严重程度

香港中文大学的黄秀娟团队及陈基湘团队在Gut上发表的一项队列研究结果，对比了100名COVID-19患者及78名对照的肠道菌群组成，并对27名患者的肠道菌群进行纵向分析（持续至病毒检测阴性后30天），发现患者的肠道菌群组成与对照有显著差别，且这种差别在病毒清除后仍持续存在。另外，肠道菌群组成与患者的炎症因子、趋化因子及组织损伤标志物的水平密切相关，提示肠道菌群可能影响患者的疾病严重程度。

COVID-19 研究论文基础研究菌群-免疫互作队列研究

粪菌移植

港中大：FMT治疗移植物抗宿主病，肠道细菌、真菌、病毒如何变化？

香港中文大学的黄秀娟团队及陈基湘团队在Nature Communications上发表的一项最新研究，对一名接受同种异体造血干细胞移植（allo-HSCT）后发展出移植物抗宿主病（GvHD）的14岁患儿进行粪菌移植治疗，并对粪菌移植后4个月内的肠道细菌、真菌及病毒的多样性、组成及功能的动态变化进行了深入分析。

粪菌移植移植物抗宿主病研究论文纵向研究肠道真菌组

肠道真菌组

国内团队：中国六族人群的肠道真菌组

昆明医科大学第一附属医院缪应雷、王昆华和香港中文大学黄秀娟与团队，近期在Gastroenterology发表了一项关于中国人肠道真菌组的重要研究。该研究纳入了香港和云南不同地区的6个民族的900多名健康人，系统性地分析了宿主、环境、饮食等多种因素（共118个变量）与肠道真菌组的关联，揭示了地理、城市化、民族和饮食习惯等在塑造肠道真菌组中的重要影响。

肠道真菌组 Mycobiome geography Ethnicity urbanization

肠道DNA病毒组

Cell子刊：国内团队绘制人类肠道DNA病毒组图谱

香港中文大学的Siew C. Ng和昆明医科大学的Yinglei Miao合作在Cell Host and Microbe发表文章，绘制了中国人群的肠道DNA病毒组图谱，揭示了基于群体的变异以及宿主和环境因素在人类肠道DNA病毒组形成过程中的重要性。

肠道DNA病毒组 Virome metadata Diet metacommunity

新冠感染

港中大团队：与新冠病毒肠道感染相关的肠道菌群特征

部分COVID-19（新冠）患者存在胃肠道症状，但人们对于新冠病毒在胃肠道中的活性和感染性仍所知甚少。此前的体外细胞感染模型研究显示，新冠病毒在细胞内的活跃复制和感染特征，表现为转录组分析中其基因组序列的3‘端覆盖度高于5'端。香港中文大学黄秀娟（Siew C Ng）团队在Gut杂志发表的最新研究中，通过提取新冠患者粪便病毒RNA并进行鸟枪法宏基因组测序，分析了患者粪便中的上述新冠病毒活性特征，表明存在无症状的新冠病毒肠道感染，且这种活跃的感染可持续至呼吸道病毒转阴后。他们进一步分析了肠道菌群的组成和功能，鉴定出与新冠病毒肠道感染相关的菌群特征：条件致病菌富集、有益菌群丧失以及特定代谢功能的变化。

新冠感染新冠病毒胃肠道感染肠道菌群

新冠肺炎

香港中文大学：新冠肺炎患者的肠道真菌变化

新冠病毒可感染肠道细胞，可能影响肠道菌群。香港中文大学黄秀娟团队继上个月发表了COVID-19患者的肠道菌群特征后（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1075254450），又在《Gastroenterology》上发表了一项最新研究，揭示了COVID-19患者在住院期间的粪便真菌变化，他们发现相比于健康对照，致病真菌——念珠菌属及曲霉属在患者中显著富集，且肠道真菌的失调可持续到患者鼻咽样本中的新冠病毒被清除后12天之久。

新冠肺炎 coronovirus microbe yeast Intestine

新冠肺炎

香港中文大学团队：新冠患者的肠道菌群特征

新冠病毒能感染胃肠道，但与肠道菌群的关联并不清楚。香港中文大学Siew C .Ng和Paul K.S. Chan与团队在《Gastroenterology》发表的一项新研究，揭示了COVID-19患者住院期间的肠道菌群特征，及其与疾病程度和粪便病毒载量的关联。这些发现提示，靶向调节肠道菌群或许是改善COVID-19的新思路。

新冠肺炎 coronavirus bacteria gut microbiome fecal nucleic acid

肠道真菌失调

港中大黄秀娟：肠道真菌可影响粪菌移植对CDI患者的疗效

Nature Communications刚刚上线来自香港中文大学黄秀娟团队主导的重要研究，发现肠道中的真菌组成可影响粪菌移植（FMT）治疗艰难梭菌感染（CDI）的效果，治疗后的复发情况与持续性真菌失调、供体真菌定殖不佳、患者和供体粪便中的白色念珠菌含量有关，并在小鼠模型中证实抗真菌治疗可改善白色念珠菌对FMT效果的不良影响。这些发现为筛选治疗CDI的FMT供体和提升疗效提供了新视角。

肠道真菌失调粪菌移植艰难梭菌感染念珠菌属白色念珠菌